Identificação morfológica de fungos fitopatogênicos e desenvolvimento de primer específico para identificação molecular do fungo fitopatogênico Bipolaris sorokiniana

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ribeiro, Heloísa Giacomelli
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/206199
Resumo: Bipolaris sorokiniana é um fungo fitopatogênico que ataca diversas gramíneas causando doenças principalmente na cultura de trigo. O diagnóstico das doenças causadas por fungos fitopatogênicos geralmente envolve apenas a identificação morfológica destes microrganismos o que requer tempo e mão de obra especializada. Desta forma, a aplicação de ferramentas de biologia molecular que viabilizem um rápido e preciso diagnóstico deste fungo é importante. Este trabalho teve como objetivo buscar uma região no cromossoma de Bipolaris sorokiniana para utilizá-la como referência para o desenho de primers específicos. Para tanto foram realizados ensaios de reações em cadeia da polimerase com dois primers universais do genoma de arroz (URP- Universal Rice Primers), URP 6R e URP 38F, com o objetivo de identificar fragmentos de DNA monomórficos para Bipolaris sorokiniana. Com base nas sequências de um fragmento monomórfico gerado com o primer URP 6R e de um fragmento monomórfico gerado com o primer URP 38F foram desenhados três pares de primers. Um par foi considerado inespecífico para o fungo Bipolaris sorokiniana enquanto dois pares foram considerados específicos para isolados do gênero e espécie Bipolaris sorokiniana e têm potencial para serem utilizados na ìdentiicação e detecção deste fungo.
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spelling Ribeiro, Heloísa GiacomelliVan der Sand, Sueli Terezinha2020-02-22T04:20:51Z2019http://hdl.handle.net/10183/206199001112132Bipolaris sorokiniana é um fungo fitopatogênico que ataca diversas gramíneas causando doenças principalmente na cultura de trigo. O diagnóstico das doenças causadas por fungos fitopatogênicos geralmente envolve apenas a identificação morfológica destes microrganismos o que requer tempo e mão de obra especializada. Desta forma, a aplicação de ferramentas de biologia molecular que viabilizem um rápido e preciso diagnóstico deste fungo é importante. Este trabalho teve como objetivo buscar uma região no cromossoma de Bipolaris sorokiniana para utilizá-la como referência para o desenho de primers específicos. Para tanto foram realizados ensaios de reações em cadeia da polimerase com dois primers universais do genoma de arroz (URP- Universal Rice Primers), URP 6R e URP 38F, com o objetivo de identificar fragmentos de DNA monomórficos para Bipolaris sorokiniana. Com base nas sequências de um fragmento monomórfico gerado com o primer URP 6R e de um fragmento monomórfico gerado com o primer URP 38F foram desenhados três pares de primers. Um par foi considerado inespecífico para o fungo Bipolaris sorokiniana enquanto dois pares foram considerados específicos para isolados do gênero e espécie Bipolaris sorokiniana e têm potencial para serem utilizados na ìdentiicação e detecção deste fungo.Bipolaris sorokiniana is a phytopathogenic fungus that attacks several grasses causing diseases mostly in wheat crop. Diagnosis for diseases caused by phytopathogenic fungi generally involves the morphological identification only of these microorganisms, which requires time and specialized manpower. Thus, the application of molecular biology tools that allow a quick and accurate diagnosis of this fungus is important. The objective of this work was to search for a region in Bipolaris sorokiniana chromosome that could be used to design specific primers. Therefore, polymerase chain reaction assays were performed with two Universal Rice Primers, URP 6R and URP 38F, with the objective of identify Bipolaris sorokiniana monomorphic DNA fragments. Based on the sequences of the monomorphic fragments three pairs of primers were designed. One pair was considered non-specific for Bipolaris sorokiniana while two pairs were considered specific for the genus and Bipolaris sorokiniana species and have the potential to be used in the identification and detection of this fungus.application/pdfporBipolaris sorokinianaFungosBiomarcadoresPatogenicidadeIdentificação morfológica de fungos fitopatogênicos e desenvolvimento de primer específico para identificação molecular do fungo fitopatogênico Bipolaris sorokinianaMorphological identification of phytopathogenic fungus and development of specific primer for molecular identification of phytopathogenic fungus Bipolaris sorokiniana info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de Ciências Básicas da SaúdePrograma de Pós-Graduação em Microbiologia Agrícola e do AmbientePorto Alegre, BR-RS2019mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT001112132.pdf.txt001112132.pdf.txtExtracted Texttext/plain127509http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/206199/2/001112132.pdf.txt1eac0d7d58d38e0a8d28e096e7b82e8aMD52ORIGINAL001112132.pdfTexto completoapplication/pdf2577997http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/206199/1/001112132.pdfc8e25a3d29e4ea3d1a204be7b6edcea2MD5110183/2061992021-05-07 04:49:10.297599oai:www.lume.ufrgs.br:10183/206199Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532021-05-07T07:49:10Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
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