Elementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silveira, Juliano de Oliveira
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/180615
Resumo: O valor adaptativo do sexo em patógenos unicelulares eucarióticos é um assunto de intenso debate, e os mecanismos genéticos envolvidos na reprodução sexual desses organismos são pouco desconhecidos. Diferenças nos sistemas de reprodução podem ajudar a explicar as diferenças nos modos de transmissão, amplitude de gêneros hospedeiros e resposta às mudanças ambientais, todas estreitamente relacionadas à patogenicidade e à virulência desses patógenos. Este trabalho tem como objetivo identificar os elementos genômicos que podem estar associados aos modos de reprodução e elucidar o papel dos ciclos sexuais em um microsporídeo. Microsporídeos fazem parte de um filo de fungos patogênicos intracelulares unicelulares. Estes parasitas são encontrados em praticamente todos os tipos de animais, sendo de importância para saúde e agricultura. Hamiltosporidium tvaerminnensis é um microsporídeo assexuado que é transmitido vertical e horizontalmente ao seu hospedeiro, o microcrustáceo Daphnia magna. H. tvaerminnensis possui uma espécie irmã, Hamiltosporidium magnivora, que difere por ser sexual e apenas verticalmente transmitida Nosso trabalho usa como referência um genoma draft de H. tvaerminnensis de 2009. É um genoma considerado grande para um microsporídeo, com tamanho estimado de 25 Mb. Contamos com sequências de Illumina de duas linhagens recentemente sequenciadas de H. magnivora, uma da Bélgica e outra de Israel, bem como um resequenciamento da mesma linhagem de H. tvaerminnensis, da Finlândia, usando tecnologia mais recente que a referência. Após a montagem e anotação, os nossos resultados apontam para genes chave de meiose ausentes na linhagem assexuada, bem como um enriquecimento de elementos transponíveis e transferência genética horizontal gênica derivada do hospedeiro nas linhagens sexuais. A presença exclusiva de certos genes da meiose bem como de outros genes de reparo a danos do DNA associados à maior presença de elementos móveis sugere uma possível perda de sexo concomitante à inativação de elementos móveis na linhagem assexuada.
id URGS_4e927acfbe7fa99b5f30e483915a0aad
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/180615
network_acronym_str URGS
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
repository_id_str 1853
spelling Silveira, Juliano de OliveiraHaag, Karen Luisa2018-07-24T02:28:12Z2017http://hdl.handle.net/10183/180615001064666O valor adaptativo do sexo em patógenos unicelulares eucarióticos é um assunto de intenso debate, e os mecanismos genéticos envolvidos na reprodução sexual desses organismos são pouco desconhecidos. Diferenças nos sistemas de reprodução podem ajudar a explicar as diferenças nos modos de transmissão, amplitude de gêneros hospedeiros e resposta às mudanças ambientais, todas estreitamente relacionadas à patogenicidade e à virulência desses patógenos. Este trabalho tem como objetivo identificar os elementos genômicos que podem estar associados aos modos de reprodução e elucidar o papel dos ciclos sexuais em um microsporídeo. Microsporídeos fazem parte de um filo de fungos patogênicos intracelulares unicelulares. Estes parasitas são encontrados em praticamente todos os tipos de animais, sendo de importância para saúde e agricultura. Hamiltosporidium tvaerminnensis é um microsporídeo assexuado que é transmitido vertical e horizontalmente ao seu hospedeiro, o microcrustáceo Daphnia magna. H. tvaerminnensis possui uma espécie irmã, Hamiltosporidium magnivora, que difere por ser sexual e apenas verticalmente transmitida Nosso trabalho usa como referência um genoma draft de H. tvaerminnensis de 2009. É um genoma considerado grande para um microsporídeo, com tamanho estimado de 25 Mb. Contamos com sequências de Illumina de duas linhagens recentemente sequenciadas de H. magnivora, uma da Bélgica e outra de Israel, bem como um resequenciamento da mesma linhagem de H. tvaerminnensis, da Finlândia, usando tecnologia mais recente que a referência. Após a montagem e anotação, os nossos resultados apontam para genes chave de meiose ausentes na linhagem assexuada, bem como um enriquecimento de elementos transponíveis e transferência genética horizontal gênica derivada do hospedeiro nas linhagens sexuais. A presença exclusiva de certos genes da meiose bem como de outros genes de reparo a danos do DNA associados à maior presença de elementos móveis sugere uma possível perda de sexo concomitante à inativação de elementos móveis na linhagem assexuada.The adaptive value of sex in eukaryotic unicellular pathogens is a matter of intense debate, and the genetic mechanisms involved in sexual reproduction of these organisms are largely unknown. Differences in reproduction systems could help explaining differences in modes of transmission, host range amplitude and response to environmental changes, all tightly related to pathogenicity and virulence of such pathogens. This work aims to identify genomic elements that could be associated with modes of reproduction, and further elucidate the role of sexual cycles in a microsporidian parasite. Microsporidia belong to a phylum of unicellular intracellular pathogenic Fungi. These parasites are found in virtually all types of animals, being of importance to health and agriculture. Hamiltosporidium tvaerminnensis is a microsporidian shown to be asexual and being both vertically and horizontally transmited to its host, the microcrustacean Daphnia magna. H. tvaerminnensis possesses a sister species, Hamiltosporidium magnivora, which differs by being sexual and only vertically transmitted Our work uses as reference a 2009 assembled draft genome of H. tvaerminnensis. It is an unusually large genome for a microsporidian, estimated to contain 25 Mb of sequence. We rely on Illumina sequencing reads from two recently resequenced linages of H. magnivora, one from Belgium and another from Israel, as well as a set from the same H. tvaerminnensis lineage as the reference, from Finland, using technology newer than the reference. After assembly and annotation, our results point to missing key meiosis genes in the asexual lineage, as well as an enrichment in transposable elements and host derived horizontal gene transfer in the sexual lineages. The exclusive presence of certain meiosis genes as well as other DNA damage repair genes associated to the larger presence of mobile elements hint to a possible loss of sex concomitant to the inactivation of mobile elements in the asexual lineage.application/pdfporMicrosporideosReprodução sexuadaEucariotosElementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de BiociênciasPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularPorto Alegre, BR-RS2017mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL001064666.pdfTexto completoapplication/pdf1671140http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/180615/1/001064666.pdfd2c9524e5b74c259b1267e5959686436MD51TEXT001064666.pdf.txt001064666.pdf.txtExtracted Texttext/plain163736http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/180615/2/001064666.pdf.txt6095f68eaa0b18f0bdad42a649c3d85bMD52THUMBNAIL001064666.pdf.jpg001064666.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1032http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/180615/3/001064666.pdf.jpg59f5dc2674ffd5a008efb408b80f823dMD5310183/1806152018-10-05 07:31:18.538oai:www.lume.ufrgs.br:10183/180615Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532018-10-05T10:31:18Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Elementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeos
title Elementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeos
spellingShingle Elementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeos
Silveira, Juliano de Oliveira
Microsporideos
Reprodução sexuada
Eucariotos
title_short Elementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeos
title_full Elementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeos
title_fullStr Elementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeos
title_full_unstemmed Elementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeos
title_sort Elementos genômicos de reprodução sexuada em microsporídeos
author Silveira, Juliano de Oliveira
author_facet Silveira, Juliano de Oliveira
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Silveira, Juliano de Oliveira
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Haag, Karen Luisa
contributor_str_mv Haag, Karen Luisa
dc.subject.por.fl_str_mv Microsporideos
Reprodução sexuada
Eucariotos
topic Microsporideos
Reprodução sexuada
Eucariotos
description O valor adaptativo do sexo em patógenos unicelulares eucarióticos é um assunto de intenso debate, e os mecanismos genéticos envolvidos na reprodução sexual desses organismos são pouco desconhecidos. Diferenças nos sistemas de reprodução podem ajudar a explicar as diferenças nos modos de transmissão, amplitude de gêneros hospedeiros e resposta às mudanças ambientais, todas estreitamente relacionadas à patogenicidade e à virulência desses patógenos. Este trabalho tem como objetivo identificar os elementos genômicos que podem estar associados aos modos de reprodução e elucidar o papel dos ciclos sexuais em um microsporídeo. Microsporídeos fazem parte de um filo de fungos patogênicos intracelulares unicelulares. Estes parasitas são encontrados em praticamente todos os tipos de animais, sendo de importância para saúde e agricultura. Hamiltosporidium tvaerminnensis é um microsporídeo assexuado que é transmitido vertical e horizontalmente ao seu hospedeiro, o microcrustáceo Daphnia magna. H. tvaerminnensis possui uma espécie irmã, Hamiltosporidium magnivora, que difere por ser sexual e apenas verticalmente transmitida Nosso trabalho usa como referência um genoma draft de H. tvaerminnensis de 2009. É um genoma considerado grande para um microsporídeo, com tamanho estimado de 25 Mb. Contamos com sequências de Illumina de duas linhagens recentemente sequenciadas de H. magnivora, uma da Bélgica e outra de Israel, bem como um resequenciamento da mesma linhagem de H. tvaerminnensis, da Finlândia, usando tecnologia mais recente que a referência. Após a montagem e anotação, os nossos resultados apontam para genes chave de meiose ausentes na linhagem assexuada, bem como um enriquecimento de elementos transponíveis e transferência genética horizontal gênica derivada do hospedeiro nas linhagens sexuais. A presença exclusiva de certos genes da meiose bem como de outros genes de reparo a danos do DNA associados à maior presença de elementos móveis sugere uma possível perda de sexo concomitante à inativação de elementos móveis na linhagem assexuada.
publishDate 2017
dc.date.issued.fl_str_mv 2017
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2018-07-24T02:28:12Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/180615
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 001064666
url http://hdl.handle.net/10183/180615
identifier_str_mv 001064666
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/180615/1/001064666.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/180615/2/001064666.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/180615/3/001064666.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv d2c9524e5b74c259b1267e5959686436
6095f68eaa0b18f0bdad42a649c3d85b
59f5dc2674ffd5a008efb408b80f823d
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv lume@ufrgs.br||lume@ufrgs.br
_version_ 1800309129508552704