Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Bhering, Leonardo Lopes
Data de Publicação: 2014
Outros Autores: Cruz, Cosme Damião
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
Texto Completo: https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/19524
Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar o tamanho ótimo de populações de irmãos completos, para estudos de mapas de marcadores moleculares, por meio de simulações de genomas e tamanhos de populações.Foram simulados genomas parentais e amostras de populações de família de irmãos completos do tipo completamente informativas, e também não completamente informativas. As amostras geradas foram de 100, 200,400 e 600 indivíduos, com três grupos de ligação cada, e 11 marcas moleculares codominantes e multialélicas, espaçadas a dez centimorgans por grupo de ligação. Foram realizadas 100 repetições por amostra. Para populações completamente informativas, o tamanho populacional de 200 indivíduos é suficiente para recuperar as informações originais, contudo, para a população não completamente informativa, é necessária a utilização de uma população maior, de 600 indivíduos.
id EMBRAPA-4_1339a2040ed2558a76fd3de00c752469
oai_identifier_str oai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/19524
network_acronym_str EMBRAPA-4
network_name_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository_id_str
spelling Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completosOptimum population size for genetic mapping in full sibling familiesamostragem; genômica; mapeamento; populações exogâmicassampling; genomics;exogamic populations; mappingO objetivo deste trabalho foi avaliar o tamanho ótimo de populações de irmãos completos, para estudos de mapas de marcadores moleculares, por meio de simulações de genomas e tamanhos de populações.Foram simulados genomas parentais e amostras de populações de família de irmãos completos do tipo completamente informativas, e também não completamente informativas. As amostras geradas foram de 100, 200,400 e 600 indivíduos, com três grupos de ligação cada, e 11 marcas moleculares codominantes e multialélicas, espaçadas a dez centimorgans por grupo de ligação. Foram realizadas 100 repetições por amostra. Para populações completamente informativas, o tamanho populacional de 200 indivíduos é suficiente para recuperar as informações originais, contudo, para a população não completamente informativa, é necessária a utilização de uma população maior, de 600 indivíduos.The objective of this work was to evaluate the optimum size of populations for the study of genetic mapping of full sibling families, through data simulation of genome and populations. Parental genomes and population samples of full sibling families of both completely and non-completely informative types, were simulated. The generated samples had 100, 200, 400 and 600 individuals, with three linkage groups each, and 11 codominant multi-allelic molecular marks, spaced by ten centimorgans in each linkage group. One-hundred repetitions were accomplished by sample. In completely informative populations, the optimum size of 200 individuals is enough to rescue the original information, however, for the non-completely informative population, it is necessary a larger population, with 600 individuals.Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiraBhering, Leonardo LopesCruz, Cosme Damião2014-04-30info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/19524Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.43, n.3, mar. 2008; 379-385Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.43, n.3, mar. 2008; 379-3851678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAporhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/19524/12564info:eu-repo/semantics/openAccess2014-04-30T19:38:38Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/19524Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2014-04-30T19:38:38Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
dc.title.none.fl_str_mv Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos
Optimum population size for genetic mapping in full sibling families
title Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos
spellingShingle Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos
Bhering, Leonardo Lopes
amostragem; genômica; mapeamento; populações exogâmicas
sampling; genomics;exogamic populations; mapping
title_short Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos
title_full Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos
title_fullStr Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos
title_full_unstemmed Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos
title_sort Tamanho de população ideal para mapeamento genético em famílias de irmãos completos
author Bhering, Leonardo Lopes
author_facet Bhering, Leonardo Lopes
Cruz, Cosme Damião
author_role author
author2 Cruz, Cosme Damião
author2_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv

dc.contributor.author.fl_str_mv Bhering, Leonardo Lopes
Cruz, Cosme Damião
dc.subject.por.fl_str_mv amostragem; genômica; mapeamento; populações exogâmicas
sampling; genomics;exogamic populations; mapping
topic amostragem; genômica; mapeamento; populações exogâmicas
sampling; genomics;exogamic populations; mapping
description O objetivo deste trabalho foi avaliar o tamanho ótimo de populações de irmãos completos, para estudos de mapas de marcadores moleculares, por meio de simulações de genomas e tamanhos de populações.Foram simulados genomas parentais e amostras de populações de família de irmãos completos do tipo completamente informativas, e também não completamente informativas. As amostras geradas foram de 100, 200,400 e 600 indivíduos, com três grupos de ligação cada, e 11 marcas moleculares codominantes e multialélicas, espaçadas a dez centimorgans por grupo de ligação. Foram realizadas 100 repetições por amostra. Para populações completamente informativas, o tamanho populacional de 200 indivíduos é suficiente para recuperar as informações originais, contudo, para a população não completamente informativa, é necessária a utilização de uma população maior, de 600 indivíduos.
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014-04-30
dc.type.none.fl_str_mv
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/19524
url https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/19524
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/19524/12564
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
dc.source.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.43, n.3, mar. 2008; 379-385
Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.43, n.3, mar. 2008; 379-385
1678-3921
0100-104x
reponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron:EMBRAPA
instname_str Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron_str EMBRAPA
institution EMBRAPA
reponame_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
collection Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository.name.fl_str_mv Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
repository.mail.fl_str_mv pab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br
_version_ 1793416666454949888

Registros relacionados