Monitoramento de Corynebacterium striatum em hospital universitário da região metropolitana do Rio de Janeiro: aspectos epidemiológicos, microbiológicos e do potencial de virulência

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gusmão, Letícia Nunes Marones de
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UERJ
Texto Completo: http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/14387
Resumo: Corynebacterium striatum has been associated with an increasing number of cases of healthcare-associated infections (HAI), representing an important issue, as they increase mortality and morbidity rates and prolong hospitalizations, resulting, thus, in economic and social damages.Virulence factors such as resistance to antimicrobial agents, ability to adhere to diverse surfaces and to yield biofilm, slime, hydrolytic and proteolytic enzymes may contribute to bacterial pathogenicity. We aimed to analyze, retrospectively and prospectively, the epidemiological, microbiological and virulence aspects of C. striatum strains from the Hospital of the University of the State of Rio de Janeiro - HUPE / UERJ, identified during the period of August/2009 to December/2016. At first we confirmed the efficacy (100% compatibility with 16SrRNA and rpoB gene sequencing) of the MALDI-TOF technique and the screening scheme proposed by the LDCIC/UERJ for C. striatum identification. In the other hand, the semi-automated API Coryne System has presented very low scores with the possibility of failure to identify C. striatum. Eighty nine C. striatum strains were sent from HUPE/UERJ to LDCIC for identification, with the highest number of isolates in 2011/2012 (48.31%). The general ICU and UCIPG section had the highest percentages of isolated C. striatum strains (17.98% and 13.48%). Most of the samples were isolated from the respiratory tract (51.69%) and blood (16.85%). The clonality of 18 samples were investigated by PFGE. Ten PFGE types (I to X) were identified, with eight of them (I, II, V-X) related to blood samples and catheters. Seventy two samples were submitted to the disc diffusion antimicrobial susceptibility test and 90.3% had a multidrug resistance (MDR) profile. Vancomycin was the only antimicrobial agent with 100% bacterial sensitivity. The ermX, aphA1 and cmx resistance genes were investigated by conventional PCR in four MDR samples (pulse I, II, V) and two MDS samples (pulse III and IV). All MDR samples showed amplicons for all genes whereas MDS samples were negative for all genes. All tested samples has showed slime production in the Congo Red Medium and yielded biofilm on the polyurethane catheter and polystyrene surfaces, except 2401 BR-RJ/2012-MDR strain. Ultrastructural analysis by scanning electron microscopy has demonstrated mature biofilms after 48 hours of incubation, allowing observes hollow voids and the production and accumulation of extracellular material. The results indicate that MDR and MDS C. striatum biofilm producers were responsible for severe infections, including infections in patients using invasive medical devices, at HUPE/UERJ. Our data emphasize that C. striatum should not be underestimated, neglected or dismissed as contaminants by health professionals. This infectious agent should be take into account as a pathogen related to health-care associated infections (HAI) in Brazil and efforts should be made to monitoring and elaborate strategies for the prevention, control and treatment of this corynebacteriosis.
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Dissertação (Mestrado em Microbiologia Médica Humana) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2018.http://www.bdtd.uerj.br/handle/1/14387Corynebacterium striatum has been associated with an increasing number of cases of healthcare-associated infections (HAI), representing an important issue, as they increase mortality and morbidity rates and prolong hospitalizations, resulting, thus, in economic and social damages.Virulence factors such as resistance to antimicrobial agents, ability to adhere to diverse surfaces and to yield biofilm, slime, hydrolytic and proteolytic enzymes may contribute to bacterial pathogenicity. We aimed to analyze, retrospectively and prospectively, the epidemiological, microbiological and virulence aspects of C. striatum strains from the Hospital of the University of the State of Rio de Janeiro - HUPE / UERJ, identified during the period of August/2009 to December/2016. At first we confirmed the efficacy (100% compatibility with 16SrRNA and rpoB gene sequencing) of the MALDI-TOF technique and the screening scheme proposed by the LDCIC/UERJ for C. striatum identification. In the other hand, the semi-automated API Coryne System has presented very low scores with the possibility of failure to identify C. striatum. Eighty nine C. striatum strains were sent from HUPE/UERJ to LDCIC for identification, with the highest number of isolates in 2011/2012 (48.31%). The general ICU and UCIPG section had the highest percentages of isolated C. striatum strains (17.98% and 13.48%). Most of the samples were isolated from the respiratory tract (51.69%) and blood (16.85%). The clonality of 18 samples were investigated by PFGE. Ten PFGE types (I to X) were identified, with eight of them (I, II, V-X) related to blood samples and catheters. Seventy two samples were submitted to the disc diffusion antimicrobial susceptibility test and 90.3% had a multidrug resistance (MDR) profile. Vancomycin was the only antimicrobial agent with 100% bacterial sensitivity. The ermX, aphA1 and cmx resistance genes were investigated by conventional PCR in four MDR samples (pulse I, II, V) and two MDS samples (pulse III and IV). All MDR samples showed amplicons for all genes whereas MDS samples were negative for all genes. All tested samples has showed slime production in the Congo Red Medium and yielded biofilm on the polyurethane catheter and polystyrene surfaces, except 2401 BR-RJ/2012-MDR strain. Ultrastructural analysis by scanning electron microscopy has demonstrated mature biofilms after 48 hours of incubation, allowing observes hollow voids and the production and accumulation of extracellular material. The results indicate that MDR and MDS C. striatum biofilm producers were responsible for severe infections, including infections in patients using invasive medical devices, at HUPE/UERJ. Our data emphasize that C. striatum should not be underestimated, neglected or dismissed as contaminants by health professionals. This infectious agent should be take into account as a pathogen related to health-care associated infections (HAI) in Brazil and efforts should be made to monitoring and elaborate strategies for the prevention, control and treatment of this corynebacteriosis.Corynebacterium striatum tem sido associado a um número crescente de casos de infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS), representando um importante agravo, uma vez que aumentam as taxas de mortalidade e morbidade e prolongam as internações acarretando prejuízos do ponto de vista econômico e social. Atributos de virulência como multirresistência a antimicrobianos, habilidade de aderir às superfícies diversas e constituir biofilme, expressão de slime e enzimas hidrolíticas e proteolíticas podem se associar e contribuir para a patogenicidade bacteriana. O presente trabalho teve como objetivo analisar retrospectiva e prospectivamente os aspectos epidemiológicos, microbiológicos e do potencial de virulência de cepas de C. striatum oriundas do Hospital da Universidade do Estado do Rio de Janeiro - HUPE/UERJ, identificadas durante o período de Agosto/2009 a Dezembro/2016. Inicialmente, confirmamos a eficácia (100% de compatibilidade com o sequenciamento dos genes 16SrRNA e rpoB) da técnica de MALDI-TOF e do esquema de triagem proposto pelo LDCIC/UERJ para a identificação de C. striatum, enquanto que o sistema semiautomatizado API Coryne apresentou escores muito baixos com possibilidade de falhas na identificação de C. striatum. No período analisado 89 amostras oriundas do HUPE/UERJ foram identificadas como C. striatum, com maior concentração de isolamentos nos anos de 2011/2012 (48,31%). Os setores de UTI geral e UCIPG foram os que apresentaram maiores percentuais de isolamento (17,98% e 13,48%). A maior parte das amostras foi oriunda do trato respiratório (51,69%) e de sangue (16,85%). Os perfis clonais de 18 amostras foram investigados por PFGE sendo identificados 10 pulsotipos (I a X), estando oito deles (I, II, V-X) relacionados a amostras de sangue e cateteres. Dentre as 72 amostras submetidas ao teste de susceptibilidade por disco-difusão, 90,3% apresentaram perfil de multirresistência, sendo a vancomicina o único antimicrobiano com 100% de sensibilidade. Para a pesquisa dos genes de resistência ermX, aphA1 e cmx por PCR convencional, foram selecionadas quatro amostras MDR (pulsotipos I, II, V) e duas amostras MDS (pulsotipos III e IV). Todas as amostras MDR apresentaram amplicons para todos os genes enquanto que as amostras MDS foram negativas para os três genes. Com exceção da amostra 2401 BR-RJ/2012-MDR, todas as amostras testadas revelaram produção de slime em Meio Vermelho do Congo e foram fortes produras de biofilme na superfície de cateter de poliuretano e em poliestireno. A análise ultraestrutural por microscopia eletrônica de varredura demonstrou a formação de biofilmes maduros após 48 horas de incubação permitindo a observação de hollow voids e a produção e acúmulo de material extracelular. Os resultados indicam que C. striatum MDR e MDS produtores de biofilme são responsáveis por quadros de infecções severas de vários tipos, inclusive em pacientes fazendo uso de dispositivos médicos invasivos, no HUPE/UERJ. Nossos dados enfatizam que C. striatum não deve ser subestimado, negligenciado ou descartado como mero contaminante pelos profissionais da saúde. Esse agente deve ser incluído entre os pátogenos concernentes às infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS) no Brasil e esforços devem ser empenhados no sentido de se manter o seu monitoramento e elaborar estratégias para a prevenção, controle e tratamento dessa corinebacteriose.Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2021-01-07T15:15:35Z No. of bitstreams: 1 Leticia Nunes Marones de Gusmao Dissertacao completa.pdf: 1330290 bytes, checksum: 2570c66c17ccc0aef2267615cb7f4054 (MD5)Made available in DSpace on 2021-01-07T15:15:35Z (GMT). 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description Corynebacterium striatum has been associated with an increasing number of cases of healthcare-associated infections (HAI), representing an important issue, as they increase mortality and morbidity rates and prolong hospitalizations, resulting, thus, in economic and social damages.Virulence factors such as resistance to antimicrobial agents, ability to adhere to diverse surfaces and to yield biofilm, slime, hydrolytic and proteolytic enzymes may contribute to bacterial pathogenicity. We aimed to analyze, retrospectively and prospectively, the epidemiological, microbiological and virulence aspects of C. striatum strains from the Hospital of the University of the State of Rio de Janeiro - HUPE / UERJ, identified during the period of August/2009 to December/2016. At first we confirmed the efficacy (100% compatibility with 16SrRNA and rpoB gene sequencing) of the MALDI-TOF technique and the screening scheme proposed by the LDCIC/UERJ for C. striatum identification. In the other hand, the semi-automated API Coryne System has presented very low scores with the possibility of failure to identify C. striatum. Eighty nine C. striatum strains were sent from HUPE/UERJ to LDCIC for identification, with the highest number of isolates in 2011/2012 (48.31%). The general ICU and UCIPG section had the highest percentages of isolated C. striatum strains (17.98% and 13.48%). Most of the samples were isolated from the respiratory tract (51.69%) and blood (16.85%). The clonality of 18 samples were investigated by PFGE. Ten PFGE types (I to X) were identified, with eight of them (I, II, V-X) related to blood samples and catheters. Seventy two samples were submitted to the disc diffusion antimicrobial susceptibility test and 90.3% had a multidrug resistance (MDR) profile. Vancomycin was the only antimicrobial agent with 100% bacterial sensitivity. The ermX, aphA1 and cmx resistance genes were investigated by conventional PCR in four MDR samples (pulse I, II, V) and two MDS samples (pulse III and IV). All MDR samples showed amplicons for all genes whereas MDS samples were negative for all genes. All tested samples has showed slime production in the Congo Red Medium and yielded biofilm on the polyurethane catheter and polystyrene surfaces, except 2401 BR-RJ/2012-MDR strain. Ultrastructural analysis by scanning electron microscopy has demonstrated mature biofilms after 48 hours of incubation, allowing observes hollow voids and the production and accumulation of extracellular material. The results indicate that MDR and MDS C. striatum biofilm producers were responsible for severe infections, including infections in patients using invasive medical devices, at HUPE/UERJ. Our data emphasize that C. striatum should not be underestimated, neglected or dismissed as contaminants by health professionals. This infectious agent should be take into account as a pathogen related to health-care associated infections (HAI) in Brazil and efforts should be made to monitoring and elaborate strategies for the prevention, control and treatment of this corynebacteriosis.
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