Modelagem molecular da timidina quinase: um importante alvo terapêutico no Vírus Herpes Simplex e avaliação da resistência
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Data de Publicação: | 2013 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRJ |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11422/20746 |
Resumo: | A infecção pelo vírus herpes simplex (HSV) atinge cerca de um terço da população mundial e pode ser causada pelo vírus HSV-1, associado à doença oral e HSV-2 à doença genital. O tratamento padrão é o aciclovir (ACV) e análogos que inibem a timidina quinase (TK). Essa enzima converte o ACV em ACV monofosfato que é convertido em di- e trifosfato por quinases celulares. Na forma trifosfatada, inibe a DNA polimerase viral, impedindo o alongamento do DNA viral. Resistência ao ACV tem sido observada na clínica, especialmente por alterações na TK. O objetivo do trabalho é avaliar as interações do ACV e análogos com a TK de HSV-1 e HSV-2 e as interações do ACV com as enzimas mutantes de HSV-1 para entender a relação com a resistência. A estrutura 3D da TK de HSV-2 foi construída no programa Swiss Model usando a modelagem comparativa e foram construídos modelos das TKs mutantes usando o programa Swiss PDB Viewer. As estruturas foram minimizadas, validadas e foram realizados estudos de docking usando o programa Autodock 4.2 para avaliar os modos de ligação do ACV e análogos com as enzimas. Os resultados mostraram que o ACV, ganciclovir e penciclovir interagiram de forma semelhante com a TK de HSV-1 e HSV-2, enquanto a brivudina, que tem maior afinidade pela enzima de HSV-1 do que HSV-2, apresentou um modo de ligação semelhante ao ACV na enzima de HSV-1, mas ocupou um sítio diferente na de HSV-2, o que pode explicar o perfil de atividade diferente desta. A análise do encaixe do ACV com as enzimas mutantes também mostrou um modo de ligação e interação com resíduos diferentes, o que pode justificar a resistência ao ACV nestas enzimas. Este estudo trouxe uma nova perspectiva sobre a resistência do HSV ao ACV e pode auxiliar no planejamento de novos fármacos para herpes. |
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No. of bitstreams: 1 AEGSilva.pdf: 1836126 bytes, checksum: 8785df65e7abb9e1df872307a77bca9a (MD5) Previous issue date: 2013-12A infecção pelo vírus herpes simplex (HSV) atinge cerca de um terço da população mundial e pode ser causada pelo vírus HSV-1, associado à doença oral e HSV-2 à doença genital. O tratamento padrão é o aciclovir (ACV) e análogos que inibem a timidina quinase (TK). Essa enzima converte o ACV em ACV monofosfato que é convertido em di- e trifosfato por quinases celulares. Na forma trifosfatada, inibe a DNA polimerase viral, impedindo o alongamento do DNA viral. Resistência ao ACV tem sido observada na clínica, especialmente por alterações na TK. O objetivo do trabalho é avaliar as interações do ACV e análogos com a TK de HSV-1 e HSV-2 e as interações do ACV com as enzimas mutantes de HSV-1 para entender a relação com a resistência. A estrutura 3D da TK de HSV-2 foi construída no programa Swiss Model usando a modelagem comparativa e foram construídos modelos das TKs mutantes usando o programa Swiss PDB Viewer. As estruturas foram minimizadas, validadas e foram realizados estudos de docking usando o programa Autodock 4.2 para avaliar os modos de ligação do ACV e análogos com as enzimas. Os resultados mostraram que o ACV, ganciclovir e penciclovir interagiram de forma semelhante com a TK de HSV-1 e HSV-2, enquanto a brivudina, que tem maior afinidade pela enzima de HSV-1 do que HSV-2, apresentou um modo de ligação semelhante ao ACV na enzima de HSV-1, mas ocupou um sítio diferente na de HSV-2, o que pode explicar o perfil de atividade diferente desta. A análise do encaixe do ACV com as enzimas mutantes também mostrou um modo de ligação e interação com resíduos diferentes, o que pode justificar a resistência ao ACV nestas enzimas. Este estudo trouxe uma nova perspectiva sobre a resistência do HSV ao ACV e pode auxiliar no planejamento de novos fármacos para herpes.porUniversidade Federal do Rio de JaneiroUFRJBrasilInstituto de Ciências FarmacêuticasCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIAHerpes simplex vírusTimidina quinaseResistência a medicamentosAciclovirModelagem molecularSimplexvirusThymidine kinaseDrug resistanceDrug resistanceMolecular modelingModelagem molecular da timidina quinase: um importante alvo terapêutico no Vírus Herpes Simplex e avaliação da resistênciainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisabertoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRJinstname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)instacron:UFRJLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81853http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/20746/2/license.txtdd32849f2bfb22da963c3aac6e26e255MD52ORIGINALAEGSilva.pdfAEGSilva.pdfapplication/pdf1836126http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/20746/1/AEGSilva.pdf8785df65e7abb9e1df872307a77bca9aMD5111422/207462023-11-30 00:00:53.114oai:pantheon.ufrj.br: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Repositório de PublicaçõesPUBhttp://www.pantheon.ufrj.br/oai/requestopendoar:2023-11-30T03:00:53Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)false |
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