Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Vieiralves, Thomáz
Data de Publicação: 2004
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRJ
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11422/3045
Resumo: A taxonomia de Amphimedon é complicada devido à sua ampla distribuição e abundância de morfotipos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar as espécies de Amphimedon da costa brasileira pelo estudo combinado de técnicas morfológicas e de polimorfismos do DNA. Foram utilizadas amostras provenientes da coleção do Museu Nacional (MN-UFRJ) de Amphimedon viridis, A. compressa e A. aff. compressa. O DNA genômico foi extraído e as regiões dos espaçadores internos transcritos (ITS-1 e ITS-2) dos genes que codificam para o RNA ribossomal (RNAr) nuclear foram amplificados. Após a amplificação, as amostras foram submetidas à técnica do polimorfismo de Conformação de Fita Simples (SSCP). Os resultados apresentados apoiam a ideia de que A. aff. compressa inclui espécies distintas quando utilizamos a regiões de ITS1 como caracter molecular. Do mesmo modo, estes resultados indicam a possibilidade das Amphimedon viridis da região Nordeste e Sudeste serem coespecíficas, ocorrendo homogeneamente ao longo da costa brasileira. Nossos resultados permitiram a diferenciação das espécies de Amphimedon pela técnica conjugada de PCR-SSCP, demonstrando a viabilidade deste método na distinção de espécies de esponjas marinhas.
id UFRJ_a7a9fff451f40f7946f7309860eb1aaa
oai_identifier_str oai:pantheon.ufrj.br:11422/3045
network_acronym_str UFRJ
network_name_str Repositório Institucional da UFRJ
repository_id_str
spelling Vieiralves, Thomázhttp://lattes.cnpq.br/3430484825332979http://lattes.cnpq.br/1094857204903462Hajdu, Gisele Lôbohttp://lattes.cnpq.br/1346430944942436Muricy, Guilherme Ramos da Silvahttp://lattes.cnpq.br/9117928743199916Klautau, Michelle Regina Lemoshttp://lattes.cnpq.br/7866700606716431Silva, Carla Menegola dahttp://lattes.cnpq.br/3881833045044771Hajdu, Eduardo Carlos Meduna2017-10-18T22:14:47Z2023-11-30T03:02:19Z2004http://hdl.handle.net/11422/3045A taxonomia de Amphimedon é complicada devido à sua ampla distribuição e abundância de morfotipos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar as espécies de Amphimedon da costa brasileira pelo estudo combinado de técnicas morfológicas e de polimorfismos do DNA. Foram utilizadas amostras provenientes da coleção do Museu Nacional (MN-UFRJ) de Amphimedon viridis, A. compressa e A. aff. compressa. O DNA genômico foi extraído e as regiões dos espaçadores internos transcritos (ITS-1 e ITS-2) dos genes que codificam para o RNA ribossomal (RNAr) nuclear foram amplificados. Após a amplificação, as amostras foram submetidas à técnica do polimorfismo de Conformação de Fita Simples (SSCP). Os resultados apresentados apoiam a ideia de que A. aff. compressa inclui espécies distintas quando utilizamos a regiões de ITS1 como caracter molecular. Do mesmo modo, estes resultados indicam a possibilidade das Amphimedon viridis da região Nordeste e Sudeste serem coespecíficas, ocorrendo homogeneamente ao longo da costa brasileira. Nossos resultados permitiram a diferenciação das espécies de Amphimedon pela técnica conjugada de PCR-SSCP, demonstrando a viabilidade deste método na distinção de espécies de esponjas marinhas.The taxonomy of Amphimedon is complicated due to its wide distribution and abundance of morphotypes. The objective of this work was to characterize the species of Amphimedon from the Brazilian Coast by the combined study of morphology and DNA polymorphisms. The samples utilized were derived from the collections of Museu Nacional (MNRJ, and comprised Amphimedon viridis, A. compressa e A. aff. compressa. The genomic DNA was extracted and the regions of the internal transcribed spacers (ITS-1 and ITS-2) coding for nuclear ribossomal RNA were amplified. After amplifications, samples were subjected to the Single Strand Conformation Polimorphism (SSCP) technique. The individuals of Amphimedon viridis show a similar ITS 1 migration pattern, even when coming from distant collecting localities on the Brazilian Coast. The results presented support the idea that A. aff. compressa comprises distinct species when we utilize ITS 1 regions as a molecular character. In the same way, these results indicate the possibility that A. viridis from the northeastern and southeastern Brazilian regions are conspecific, occurring homogeneously along the Brazilian coast. Our results enabled the differentiation of Amphimedon species through the combined PCR-SSCP technique, showing the potential use of this method for the distinction of species of marine sponges.Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T22:14:47Z No. of bitstreams: 1 618387.pdf: 5097477 bytes, checksum: b8518d78d9bd177997c0fd650714809f (MD5)Made available in DSpace on 2017-10-18T22:14:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 618387.pdf: 5097477 bytes, checksum: b8518d78d9bd177997c0fd650714809f (MD5) Previous issue date: 2004PETROBRASporUniversidade Federal do Rio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Zoologia)UFRJBrasilMuseu NacionalCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::TAXONOMIA DOS GRUPOS RECENTESAmphimedonDemospôngiasHaploscleridaEsponjasBrasilDistinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológicainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisabertoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRJinstname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)instacron:UFRJORIGINAL618387.pdf618387.pdfapplication/pdf5097477http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/1/618387.pdfb8518d78d9bd177997c0fd650714809fMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81853http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/2/license.txtdd32849f2bfb22da963c3aac6e26e255MD52TEXT618387.pdf.txt618387.pdf.txtExtracted texttext/plain116024http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/3/618387.pdf.txtbdb35734cc055087f86cef048ac85e44MD5311422/30452023-11-30 00:02:19.964oai:pantheon.ufrj.br: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Repositório de PublicaçõesPUBhttp://www.pantheon.ufrj.br/oai/requestopendoar:2023-11-30T03:02:19Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica
title Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica
spellingShingle Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica
Vieiralves, Thomáz
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::TAXONOMIA DOS GRUPOS RECENTES
Amphimedon
Demospôngias
Haplosclerida
Esponjas
Brasil
title_short Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica
title_full Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica
title_fullStr Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica
title_full_unstemmed Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica
title_sort Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica
author Vieiralves, Thomáz
author_facet Vieiralves, Thomáz
author_role author
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3430484825332979
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1094857204903462
dc.contributor.advisorCo1.none.fl_str_mv Hajdu, Gisele Lôbo
dc.contributor.advisorCo1Lattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1346430944942436
dc.contributor.author.fl_str_mv Vieiralves, Thomáz
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Muricy, Guilherme Ramos da Silva
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9117928743199916
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Klautau, Michelle Regina Lemos
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7866700606716431
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Silva, Carla Menegola da
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3881833045044771
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Hajdu, Eduardo Carlos Meduna
contributor_str_mv Muricy, Guilherme Ramos da Silva
Klautau, Michelle Regina Lemos
Silva, Carla Menegola da
Hajdu, Eduardo Carlos Meduna
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::TAXONOMIA DOS GRUPOS RECENTES
topic CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::TAXONOMIA DOS GRUPOS RECENTES
Amphimedon
Demospôngias
Haplosclerida
Esponjas
Brasil
dc.subject.por.fl_str_mv Amphimedon
Demospôngias
Haplosclerida
Esponjas
Brasil
description A taxonomia de Amphimedon é complicada devido à sua ampla distribuição e abundância de morfotipos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar as espécies de Amphimedon da costa brasileira pelo estudo combinado de técnicas morfológicas e de polimorfismos do DNA. Foram utilizadas amostras provenientes da coleção do Museu Nacional (MN-UFRJ) de Amphimedon viridis, A. compressa e A. aff. compressa. O DNA genômico foi extraído e as regiões dos espaçadores internos transcritos (ITS-1 e ITS-2) dos genes que codificam para o RNA ribossomal (RNAr) nuclear foram amplificados. Após a amplificação, as amostras foram submetidas à técnica do polimorfismo de Conformação de Fita Simples (SSCP). Os resultados apresentados apoiam a ideia de que A. aff. compressa inclui espécies distintas quando utilizamos a regiões de ITS1 como caracter molecular. Do mesmo modo, estes resultados indicam a possibilidade das Amphimedon viridis da região Nordeste e Sudeste serem coespecíficas, ocorrendo homogeneamente ao longo da costa brasileira. Nossos resultados permitiram a diferenciação das espécies de Amphimedon pela técnica conjugada de PCR-SSCP, demonstrando a viabilidade deste método na distinção de espécies de esponjas marinhas.
publishDate 2004
dc.date.issued.fl_str_mv 2004
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2017-10-18T22:14:47Z
dc.date.available.fl_str_mv 2023-11-30T03:02:19Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11422/3045
url http://hdl.handle.net/11422/3045
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio de Janeiro
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Zoologia)
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRJ
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv Museu Nacional
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio de Janeiro
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRJ
instname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
instacron:UFRJ
instname_str Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
instacron_str UFRJ
institution UFRJ
reponame_str Repositório Institucional da UFRJ
collection Repositório Institucional da UFRJ
bitstream.url.fl_str_mv http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/1/618387.pdf
http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/2/license.txt
http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/3/618387.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv b8518d78d9bd177997c0fd650714809f
dd32849f2bfb22da963c3aac6e26e255
bdb35734cc055087f86cef048ac85e44
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1784097095979892736