Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2004 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRJ |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11422/3045 |
Resumo: | A taxonomia de Amphimedon é complicada devido à sua ampla distribuição e abundância de morfotipos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar as espécies de Amphimedon da costa brasileira pelo estudo combinado de técnicas morfológicas e de polimorfismos do DNA. Foram utilizadas amostras provenientes da coleção do Museu Nacional (MN-UFRJ) de Amphimedon viridis, A. compressa e A. aff. compressa. O DNA genômico foi extraído e as regiões dos espaçadores internos transcritos (ITS-1 e ITS-2) dos genes que codificam para o RNA ribossomal (RNAr) nuclear foram amplificados. Após a amplificação, as amostras foram submetidas à técnica do polimorfismo de Conformação de Fita Simples (SSCP). Os resultados apresentados apoiam a ideia de que A. aff. compressa inclui espécies distintas quando utilizamos a regiões de ITS1 como caracter molecular. Do mesmo modo, estes resultados indicam a possibilidade das Amphimedon viridis da região Nordeste e Sudeste serem coespecíficas, ocorrendo homogeneamente ao longo da costa brasileira. Nossos resultados permitiram a diferenciação das espécies de Amphimedon pela técnica conjugada de PCR-SSCP, demonstrando a viabilidade deste método na distinção de espécies de esponjas marinhas. |
id |
UFRJ_a7a9fff451f40f7946f7309860eb1aaa |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:pantheon.ufrj.br:11422/3045 |
network_acronym_str |
UFRJ |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFRJ |
repository_id_str |
|
spelling |
Vieiralves, Thomázhttp://lattes.cnpq.br/3430484825332979http://lattes.cnpq.br/1094857204903462Hajdu, Gisele Lôbohttp://lattes.cnpq.br/1346430944942436Muricy, Guilherme Ramos da Silvahttp://lattes.cnpq.br/9117928743199916Klautau, Michelle Regina Lemoshttp://lattes.cnpq.br/7866700606716431Silva, Carla Menegola dahttp://lattes.cnpq.br/3881833045044771Hajdu, Eduardo Carlos Meduna2017-10-18T22:14:47Z2023-11-30T03:02:19Z2004http://hdl.handle.net/11422/3045A taxonomia de Amphimedon é complicada devido à sua ampla distribuição e abundância de morfotipos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar as espécies de Amphimedon da costa brasileira pelo estudo combinado de técnicas morfológicas e de polimorfismos do DNA. Foram utilizadas amostras provenientes da coleção do Museu Nacional (MN-UFRJ) de Amphimedon viridis, A. compressa e A. aff. compressa. O DNA genômico foi extraído e as regiões dos espaçadores internos transcritos (ITS-1 e ITS-2) dos genes que codificam para o RNA ribossomal (RNAr) nuclear foram amplificados. Após a amplificação, as amostras foram submetidas à técnica do polimorfismo de Conformação de Fita Simples (SSCP). Os resultados apresentados apoiam a ideia de que A. aff. compressa inclui espécies distintas quando utilizamos a regiões de ITS1 como caracter molecular. Do mesmo modo, estes resultados indicam a possibilidade das Amphimedon viridis da região Nordeste e Sudeste serem coespecíficas, ocorrendo homogeneamente ao longo da costa brasileira. Nossos resultados permitiram a diferenciação das espécies de Amphimedon pela técnica conjugada de PCR-SSCP, demonstrando a viabilidade deste método na distinção de espécies de esponjas marinhas.The taxonomy of Amphimedon is complicated due to its wide distribution and abundance of morphotypes. The objective of this work was to characterize the species of Amphimedon from the Brazilian Coast by the combined study of morphology and DNA polymorphisms. The samples utilized were derived from the collections of Museu Nacional (MNRJ, and comprised Amphimedon viridis, A. compressa e A. aff. compressa. The genomic DNA was extracted and the regions of the internal transcribed spacers (ITS-1 and ITS-2) coding for nuclear ribossomal RNA were amplified. After amplifications, samples were subjected to the Single Strand Conformation Polimorphism (SSCP) technique. The individuals of Amphimedon viridis show a similar ITS 1 migration pattern, even when coming from distant collecting localities on the Brazilian Coast. The results presented support the idea that A. aff. compressa comprises distinct species when we utilize ITS 1 regions as a molecular character. In the same way, these results indicate the possibility that A. viridis from the northeastern and southeastern Brazilian regions are conspecific, occurring homogeneously along the Brazilian coast. Our results enabled the differentiation of Amphimedon species through the combined PCR-SSCP technique, showing the potential use of this method for the distinction of species of marine sponges.Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T22:14:47Z No. of bitstreams: 1 618387.pdf: 5097477 bytes, checksum: b8518d78d9bd177997c0fd650714809f (MD5)Made available in DSpace on 2017-10-18T22:14:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 618387.pdf: 5097477 bytes, checksum: b8518d78d9bd177997c0fd650714809f (MD5) Previous issue date: 2004PETROBRASporUniversidade Federal do Rio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Zoologia)UFRJBrasilMuseu NacionalCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::TAXONOMIA DOS GRUPOS RECENTESAmphimedonDemospôngiasHaploscleridaEsponjasBrasilDistinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológicainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisabertoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRJinstname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)instacron:UFRJORIGINAL618387.pdf618387.pdfapplication/pdf5097477http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/1/618387.pdfb8518d78d9bd177997c0fd650714809fMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81853http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/2/license.txtdd32849f2bfb22da963c3aac6e26e255MD52TEXT618387.pdf.txt618387.pdf.txtExtracted texttext/plain116024http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/3/618387.pdf.txtbdb35734cc055087f86cef048ac85e44MD5311422/30452023-11-30 00:02:19.964oai:pantheon.ufrj.br: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Repositório de PublicaçõesPUBhttp://www.pantheon.ufrj.br/oai/requestopendoar:2023-11-30T03:02:19Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica |
title |
Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica |
spellingShingle |
Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica Vieiralves, Thomáz CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::TAXONOMIA DOS GRUPOS RECENTES Amphimedon Demospôngias Haplosclerida Esponjas Brasil |
title_short |
Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica |
title_full |
Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica |
title_fullStr |
Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica |
title_full_unstemmed |
Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica |
title_sort |
Distinção de espécies de Amphimedon Duchassaing & Michelotti, 1864 (Niphatidae, Haplosclerida, Demospongiae) da costa brasileira por estudos de diversidade genética e morfológica |
author |
Vieiralves, Thomáz |
author_facet |
Vieiralves, Thomáz |
author_role |
author |
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/3430484825332979 |
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/1094857204903462 |
dc.contributor.advisorCo1.none.fl_str_mv |
Hajdu, Gisele Lôbo |
dc.contributor.advisorCo1Lattes.pt_BR.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/1346430944942436 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Vieiralves, Thomáz |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Muricy, Guilherme Ramos da Silva |
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/9117928743199916 |
dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
Klautau, Michelle Regina Lemos |
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/7866700606716431 |
dc.contributor.referee3.fl_str_mv |
Silva, Carla Menegola da |
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/3881833045044771 |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Hajdu, Eduardo Carlos Meduna |
contributor_str_mv |
Muricy, Guilherme Ramos da Silva Klautau, Michelle Regina Lemos Silva, Carla Menegola da Hajdu, Eduardo Carlos Meduna |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::TAXONOMIA DOS GRUPOS RECENTES |
topic |
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::TAXONOMIA DOS GRUPOS RECENTES Amphimedon Demospôngias Haplosclerida Esponjas Brasil |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Amphimedon Demospôngias Haplosclerida Esponjas Brasil |
description |
A taxonomia de Amphimedon é complicada devido à sua ampla distribuição e abundância de morfotipos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar as espécies de Amphimedon da costa brasileira pelo estudo combinado de técnicas morfológicas e de polimorfismos do DNA. Foram utilizadas amostras provenientes da coleção do Museu Nacional (MN-UFRJ) de Amphimedon viridis, A. compressa e A. aff. compressa. O DNA genômico foi extraído e as regiões dos espaçadores internos transcritos (ITS-1 e ITS-2) dos genes que codificam para o RNA ribossomal (RNAr) nuclear foram amplificados. Após a amplificação, as amostras foram submetidas à técnica do polimorfismo de Conformação de Fita Simples (SSCP). Os resultados apresentados apoiam a ideia de que A. aff. compressa inclui espécies distintas quando utilizamos a regiões de ITS1 como caracter molecular. Do mesmo modo, estes resultados indicam a possibilidade das Amphimedon viridis da região Nordeste e Sudeste serem coespecíficas, ocorrendo homogeneamente ao longo da costa brasileira. Nossos resultados permitiram a diferenciação das espécies de Amphimedon pela técnica conjugada de PCR-SSCP, demonstrando a viabilidade deste método na distinção de espécies de esponjas marinhas. |
publishDate |
2004 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2004 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2017-10-18T22:14:47Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2023-11-30T03:02:19Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/11422/3045 |
url |
http://hdl.handle.net/11422/3045 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal do Rio de Janeiro |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Zoologia) |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFRJ |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Museu Nacional |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal do Rio de Janeiro |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFRJ instname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) instacron:UFRJ |
instname_str |
Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) |
instacron_str |
UFRJ |
institution |
UFRJ |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFRJ |
collection |
Repositório Institucional da UFRJ |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/1/618387.pdf http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/2/license.txt http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/3045/3/618387.pdf.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
b8518d78d9bd177997c0fd650714809f dd32849f2bfb22da963c3aac6e26e255 bdb35734cc055087f86cef048ac85e44 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1784097095979892736 |