Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markers

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Mori, Neide Tomita [UNESP]
Data de Publicação: 2012
Outros Autores: Moraes, Mario Luiz Teixeira de [UNESP], Morita, Caroline Midori [UNESP], Mori, Edson Seizo [UNESP]
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0104-77602012000100002
http://hdl.handle.net/11449/29931
Resumo: Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, popularmente conhecida por ipê-roxo, é uma espécie pertencente à família Bignoneaceae, muito apreciada por sua beleza, madeira de excelente qualidade e utilizada em produtos medicinais e programas de reflorestamento de áreas degradadas, paisagismo e restauração. Neste trabalho, objetivou-se estudar a diversidade genética entre e dentro das populações de H. heptaphyllus por meio de marcadores microssatélites. Foram estudadas 192 plântulas, formadas a partir de sementes colhidas de duas populações, em um total de 30 árvores, de fragmentos florestais naturais na região de Botucatu - SP. Foram analisados oito locos microssatélites, com polimorfismo alélico, variando de seis alelos para o loco TAU22 a 14 alelos para os locos TAU12, TAU30 e TAU31, com número efetivo médio de alelos por loco (Âe) igual a 4,9. As médias para a heterozigosidade esperada (Ĥe), para as duas populações foi de 0,785, a heterozigosidade observada (Ĥo)foi de 0,609 e o índice de fixação (^F) variou pouco entre as populações, com média de 0,222. O valor médio da divergência genética entre as duas populações (Ĝst') foi de 0,100. Conclui-se que a maior diversidade genética ocorre dentro das populações; portanto, em programa de coleta de germoplasma, para a região de Botucatu, é recomendado realizar uma maior amostragem de indivíduos dentro das populações, o que possibilitaria uma boa representatividade genética. As populações estudadas possuem diversidade genética para subsidiar programas de melhoramento genético e conservação de germoplasma.
id UNSP_e42400aae13e1628da413e00c20c186e
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/29931
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markersDiversidade genética entre e dentro de populações de Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos por marcadores microssatélitesGermoplasmamarcadores molecularesdiversidade genéticaGermplasmmolecular markersgenetic diversityHandroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, popularmente conhecida por ipê-roxo, é uma espécie pertencente à família Bignoneaceae, muito apreciada por sua beleza, madeira de excelente qualidade e utilizada em produtos medicinais e programas de reflorestamento de áreas degradadas, paisagismo e restauração. Neste trabalho, objetivou-se estudar a diversidade genética entre e dentro das populações de H. heptaphyllus por meio de marcadores microssatélites. Foram estudadas 192 plântulas, formadas a partir de sementes colhidas de duas populações, em um total de 30 árvores, de fragmentos florestais naturais na região de Botucatu - SP. Foram analisados oito locos microssatélites, com polimorfismo alélico, variando de seis alelos para o loco TAU22 a 14 alelos para os locos TAU12, TAU30 e TAU31, com número efetivo médio de alelos por loco (Âe) igual a 4,9. As médias para a heterozigosidade esperada (Ĥe), para as duas populações foi de 0,785, a heterozigosidade observada (Ĥo)foi de 0,609 e o índice de fixação (^F) variou pouco entre as populações, com média de 0,222. O valor médio da divergência genética entre as duas populações (Ĝst') foi de 0,100. Conclui-se que a maior diversidade genética ocorre dentro das populações; portanto, em programa de coleta de germoplasma, para a região de Botucatu, é recomendado realizar uma maior amostragem de indivíduos dentro das populações, o que possibilitaria uma boa representatividade genética. As populações estudadas possuem diversidade genética para subsidiar programas de melhoramento genético e conservação de germoplasma.Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, popularly known as ipê-roxo, is a species of the family Bignoneaceae much appreciated for its beauty, excellent quality wood which is used for making medicinal products and also in reforestation programs of degraded areas, as well as landscaping and restoration. The aim of this study was to investigate the genetic diversity between and within populations of H. heptaphyllus using microsatellite markers. The 192 seedlings were produced from seeds collected on 30 trees into the two populations of natural forest fragments in Botucatu region, São Paulo, Brazil. Eight microsatellite loci were analyzed, with allelic polymorphism varying from six alleles for locus TAU22 to 14 alleles for loci TAU12, TAU30, and TAU31, with an expected mean number of alleles per locus (Âe) of 4.9. The mean expected heterozygosity(Ĥe) for the two populations was 0.785, the mean observed heterozygosity(Ĥo) was 0.609, and the fixation index (^F) was low between populations, with a mean of 0.222. The gene differentiation between the two populations (Ĝst') was 0.100. We concluded that the higher genetic diversity is within populations; therefore, as far as germplasm collection programs in Botucatu region are concerned, it is recommended that a larger sampling of individuals should be considered within populations, thereby providing good genetic representativeness. The populations have enough genetic diversity to support genetic improvement and germplasm preservation programs.Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho Faculdade de Ciências AgronômicasUniversidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho Faculdade de EngenhariaUniversidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho Faculdade de Ciências AgronômicasUniversidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho Faculdade de EngenhariaUniversidade Federal de Lavras (UFLA)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Mori, Neide Tomita [UNESP]Moraes, Mario Luiz Teixeira de [UNESP]Morita, Caroline Midori [UNESP]Mori, Edson Seizo [UNESP]2014-05-20T15:16:09Z2014-05-20T15:16:09Z2012-03-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleapplication/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0104-77602012000100002CERNE. UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA), v. 18, n. 1, p. 9-15, 2012.0104-7760http://hdl.handle.net/11449/2993110.1590/S0104-77602012000100002S0104-77602012000100002WOS:000302588300002S0104-77602012000100002.pdf9339164677717394SciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPengCERNE0.5000,368info:eu-repo/semantics/openAccess2024-01-16T06:27:13Zoai:repositorio.unesp.br:11449/29931Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-01-16T06:27:13Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markers
Diversidade genética entre e dentro de populações de Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos por marcadores microssatélites
title Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markers
spellingShingle Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markers
Mori, Neide Tomita [UNESP]
Germoplasma
marcadores moleculares
diversidade genética
Germplasm
molecular markers
genetic diversity
title_short Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markers
title_full Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markers
title_fullStr Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markers
title_full_unstemmed Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markers
title_sort Genetic diversity between and within populations of Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos using microsatellite markers
author Mori, Neide Tomita [UNESP]
author_facet Mori, Neide Tomita [UNESP]
Moraes, Mario Luiz Teixeira de [UNESP]
Morita, Caroline Midori [UNESP]
Mori, Edson Seizo [UNESP]
author_role author
author2 Moraes, Mario Luiz Teixeira de [UNESP]
Morita, Caroline Midori [UNESP]
Mori, Edson Seizo [UNESP]
author2_role author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Mori, Neide Tomita [UNESP]
Moraes, Mario Luiz Teixeira de [UNESP]
Morita, Caroline Midori [UNESP]
Mori, Edson Seizo [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Germoplasma
marcadores moleculares
diversidade genética
Germplasm
molecular markers
genetic diversity
topic Germoplasma
marcadores moleculares
diversidade genética
Germplasm
molecular markers
genetic diversity
description Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, popularmente conhecida por ipê-roxo, é uma espécie pertencente à família Bignoneaceae, muito apreciada por sua beleza, madeira de excelente qualidade e utilizada em produtos medicinais e programas de reflorestamento de áreas degradadas, paisagismo e restauração. Neste trabalho, objetivou-se estudar a diversidade genética entre e dentro das populações de H. heptaphyllus por meio de marcadores microssatélites. Foram estudadas 192 plântulas, formadas a partir de sementes colhidas de duas populações, em um total de 30 árvores, de fragmentos florestais naturais na região de Botucatu - SP. Foram analisados oito locos microssatélites, com polimorfismo alélico, variando de seis alelos para o loco TAU22 a 14 alelos para os locos TAU12, TAU30 e TAU31, com número efetivo médio de alelos por loco (Âe) igual a 4,9. As médias para a heterozigosidade esperada (Ĥe), para as duas populações foi de 0,785, a heterozigosidade observada (Ĥo)foi de 0,609 e o índice de fixação (^F) variou pouco entre as populações, com média de 0,222. O valor médio da divergência genética entre as duas populações (Ĝst') foi de 0,100. Conclui-se que a maior diversidade genética ocorre dentro das populações; portanto, em programa de coleta de germoplasma, para a região de Botucatu, é recomendado realizar uma maior amostragem de indivíduos dentro das populações, o que possibilitaria uma boa representatividade genética. As populações estudadas possuem diversidade genética para subsidiar programas de melhoramento genético e conservação de germoplasma.
publishDate 2012
dc.date.none.fl_str_mv 2012-03-01
2014-05-20T15:16:09Z
2014-05-20T15:16:09Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dx.doi.org/10.1590/S0104-77602012000100002
CERNE. UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA), v. 18, n. 1, p. 9-15, 2012.
0104-7760
http://hdl.handle.net/11449/29931
10.1590/S0104-77602012000100002
S0104-77602012000100002
WOS:000302588300002
S0104-77602012000100002.pdf
9339164677717394
url http://dx.doi.org/10.1590/S0104-77602012000100002
http://hdl.handle.net/11449/29931
identifier_str_mv CERNE. UFLA - Universidade Federal de Lavras (UFLA), v. 18, n. 1, p. 9-15, 2012.
0104-7760
10.1590/S0104-77602012000100002
S0104-77602012000100002
WOS:000302588300002
S0104-77602012000100002.pdf
9339164677717394
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv CERNE
0.500
0,368
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Lavras (UFLA)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Lavras (UFLA)
dc.source.none.fl_str_mv SciELO
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1797790310031425536