Detecção rápida e diferenciação de espécies de micobactérias através de um sistema de pcr multiplex
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Data de Publicação: | 2010 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60937 |
Resumo: | O gênero Mycobacterium é constituído por espécies do complexo Mycobacterium tuberculosis e outras denominadas micobactérias não tuberculosas (MNT). Nas infecções causadas por micobactérias, o diagnóstico precoce é essencial para a implementação do tratamento e cura do paciente. Métodos moleculares têm proporcionado à melhoria considerável da velocidade e precisão de identificação das micobactérias. Este estudo teve como objetivo avaliar um sistema PCR Multiplex em diferentes amostras clínicas de pacientes com tuberculose e micobacterioses, além de cepas de micobactérias isoladas em meio de cultura para ser proposta como ferramenta auxiliar no diagnóstico diferencial da tuberculose e doenças causadas por MNT. Foram analisados 40 pacientes com diagnóstico de tuberculose realizado pelo médico assistente do serviço de saúde, 63,15% do sexo masculino e 36,85% do feminino. Foram processadas 58 espécimes biológicos de origem pulmonar e extrapulmonar e as amostras clínicas pulmonares bacíliferas extraídas com Kit QIAamp DNA Mini and Blood Mini Handbook foram as que amplificaram pelo menos um alvo específico quando utilizamos a PCR multiplex. Em relação às características fenotípicas e bioquímicas das 40 cepas de micobactérias, 55% foram caracterizadas como M. tuberculosis, 22,5% como micobactérias não tuberculosas. Quando comparamos os resultados dos testes fenotípicos e bioquímicos com a PCR multiplex, observamos 93,3% de concordância nos resultados. Na comparação dos resultados da PCR multiplex com a técnica de PRA- hsp65 e com o diagnóstico final dos pacientes, verificamos que houve concordância em 100% e 74,28% dos resultados, respectivamente. Concluímos que a PCR multiplex poderá ser utilizada como ferramenta auxiliar no diagnóstico diferencial da tuberculose e das infecções causadas pelas MNT. Entretanto é de fundamental importância que o diagnóstico diferencial seja baseado na análise conjunta de vários parâmetros que identifiquem as espécies de MNT. |
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Lima, Andrea SantosSchindler, Haiana CharifkerXimenes, Eulalia Camelo Pessoa AzevedoCavalcanti, Milena de PaivaMorais, Clarice Neuenschwander Lins deSilva, Carlos Gustavo Régis daSchindler, Haiana Charifker2023-10-26T14:24:39Z2023-10-26T14:24:39Z2010LIMA, A. S. Detecção rápida e diferenciação de espécies de micobactérias através de um sistema de PCR multiplex. 2010 Dissertação (Mestrado Acadêmico em Saúde Pública) – Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, Fundação Oswaldo Cruz, Recife, 2010https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60937O gênero Mycobacterium é constituído por espécies do complexo Mycobacterium tuberculosis e outras denominadas micobactérias não tuberculosas (MNT). Nas infecções causadas por micobactérias, o diagnóstico precoce é essencial para a implementação do tratamento e cura do paciente. Métodos moleculares têm proporcionado à melhoria considerável da velocidade e precisão de identificação das micobactérias. Este estudo teve como objetivo avaliar um sistema PCR Multiplex em diferentes amostras clínicas de pacientes com tuberculose e micobacterioses, além de cepas de micobactérias isoladas em meio de cultura para ser proposta como ferramenta auxiliar no diagnóstico diferencial da tuberculose e doenças causadas por MNT. Foram analisados 40 pacientes com diagnóstico de tuberculose realizado pelo médico assistente do serviço de saúde, 63,15% do sexo masculino e 36,85% do feminino. Foram processadas 58 espécimes biológicos de origem pulmonar e extrapulmonar e as amostras clínicas pulmonares bacíliferas extraídas com Kit QIAamp DNA Mini and Blood Mini Handbook foram as que amplificaram pelo menos um alvo específico quando utilizamos a PCR multiplex. Em relação às características fenotípicas e bioquímicas das 40 cepas de micobactérias, 55% foram caracterizadas como M. tuberculosis, 22,5% como micobactérias não tuberculosas. Quando comparamos os resultados dos testes fenotípicos e bioquímicos com a PCR multiplex, observamos 93,3% de concordância nos resultados. Na comparação dos resultados da PCR multiplex com a técnica de PRA- hsp65 e com o diagnóstico final dos pacientes, verificamos que houve concordância em 100% e 74,28% dos resultados, respectivamente. Concluímos que a PCR multiplex poderá ser utilizada como ferramenta auxiliar no diagnóstico diferencial da tuberculose e das infecções causadas pelas MNT. Entretanto é de fundamental importância que o diagnóstico diferencial seja baseado na análise conjunta de vários parâmetros que identifiquem as espécies de MNT.The genus Mycobacterium comprises Mycobacterium tuberculosis complex species and others called nontuberculous mycobacteria (NTM). In infections caused by mycobacteria, early diagnosis is essential for the implementation of the treatment and cure. Molecular methods have provided considerable improvement to the speed and accuracy of identification of mycobacteria. This study aimed to evaluate a multiplex PCR system in different clinical samples from patients with tuberculosis and mycobacteria, and mycobacteria strains isolated in culture medium to be proposed as an auxiliary tool in the differential diagnosis of tuberculosis and diseases caused by NTM. We analyzed 40 patients diagnosed with tuberculosis conducted by the attending physician of the health service, 63.15% male and 36.85% female. 58 specimens were processed biological origin of pulmonary and extrapulmonary clinical samples and extracted with smearpositive Kit QIAamp DNA Mini and Blood Mini Handbook were used to amplify a specific target at least when using the multiplex PCR. In relation to phenotypic and biochemical characteristics of 40 strains of mycobacteria, 55% were characterized as M. tuberculosis, 22.5% as nontuberculous mycobacteria. When comparing the results of phenotypic and biochemical tests with the multiplex PCR, we observed 93.3% agreement in results. Comparing the results of multiplex PCR with the technique of PRA-hsp65 and the final diagnosis of patients, we found that there was agreement in 100% and 74.28% of the results, respectively. We conclude that the multiplex PCR could be used as an auxiliary tool in the differential diagnosis of tuberculosis and NTM infections. However it is of fundamental importance that the differential diagnosis is based on joint analysis of various parameters to identify the species of NTM.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.Universidade Federal de Pernambuco. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.porMycobacterium tuberculosisMicobactérias AtípicasReação em Cadeia da PolimeraseDiagnósticoMycobacterium tuberculosisAtypical MycobacteriaPolymerase Chain ReactionDiagnosisTuberculosis micobacterianaMicobacterias atípicasReacción en cadena de la polimerasaDiagnósticoMycobacterium tuberculosisMycobactéries atypiquesRéaction en chaîne par polyméraseDiagnosticDetecção rápida e diferenciação de espécies de micobactérias através de um sistema de pcr multiplexinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2010-03-30Instituto Aggeu MagalhãesMestrado AcadêmicoRecifePrograma de Pós-Graduação em Saúde Públicainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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