One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Andrade, Elisabete
Data de Publicação: 2018
Outros Autores: Rocha, Daniele, Fontana-Maurell, Marcela, Costa, Elaine, Ribeiro, Marisa, Godoy, Daniela Tupy de, Ferreira, Antonio G. P., Tanuri, Amilcar, Alvarez, Patrícia, Brindeiro, Rodrigo
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/39352
Resumo: O Serviço de Saúde Pública do Brasil fornece αPEG-IFN gratuitamente para tratar pacientes infectados pelo HCV. O objetivo principal da terapia com HCV é a eliminação a longo prazo do HCV do sangue para reduzir o risco de complicações e morte associadas ao HCV. A viremia do paciente afeta a duração e a resposta do tratamento, influenciando assim as decisões clínicas. Desenvolvemos um método de alto rendimento para realizar a quantificação da carga do vírus do RNA da hepatite C (HCV) em amostras de plasma para monitorar pacientes em tratamento. O método baseia-se na detecção duplex, em um teste de RT-PCR em tempo real de uma etapa, e foi validado de acordo com as regras estabelecidas pela agência reguladora oficial do Brasil (ANVISA). Esse novo método foi comparado a um kit comercial (Teste Cobas / Taqman HCV v2.0 - Roche), mostrando resultados de carga de vírus com correlação significativa entre eles (p = 0,012) usando painéis comerciais e clínicos. Além disso, foram analisadas 611 amostras de pacientes tratados com interferon alfa peguilado (αPEG-IFN) de diferentes regiões do Brasil. Nosso teste de RT-PCR em tempo real de uma etapa demonstrou bom desempenho na medição da carga viral e no monitoramento do curso do tratamento, com valores aceitáveis ​​de sensibilidade e especificidade.
id CRUZ_063f742fc60051f2378d34cbdb9f8078
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/39352
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Andrade, ElisabeteRocha, DanieleFontana-Maurell, MarcelaCosta, ElaineRibeiro, MarisaGodoy, Daniela Tupy deFerreira, Antonio G. P.Tanuri, AmilcarAlvarez, PatríciaBrindeiro, Rodrigo2020-01-21T13:46:30Z2020-01-21T13:46:30Z2018ANDRADE, E. et al. One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil. Brazilian Journal of Infectious Diseases, Salvador, v. 22, n. 5, p. 418-423, Sept./Oct. 2018.1413-8670https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/3935210.1016/j.bjid.2018.08.0031678-4391O Serviço de Saúde Pública do Brasil fornece αPEG-IFN gratuitamente para tratar pacientes infectados pelo HCV. O objetivo principal da terapia com HCV é a eliminação a longo prazo do HCV do sangue para reduzir o risco de complicações e morte associadas ao HCV. A viremia do paciente afeta a duração e a resposta do tratamento, influenciando assim as decisões clínicas. Desenvolvemos um método de alto rendimento para realizar a quantificação da carga do vírus do RNA da hepatite C (HCV) em amostras de plasma para monitorar pacientes em tratamento. O método baseia-se na detecção duplex, em um teste de RT-PCR em tempo real de uma etapa, e foi validado de acordo com as regras estabelecidas pela agência reguladora oficial do Brasil (ANVISA). Esse novo método foi comparado a um kit comercial (Teste Cobas / Taqman HCV v2.0 - Roche), mostrando resultados de carga de vírus com correlação significativa entre eles (p = 0,012) usando painéis comerciais e clínicos. Além disso, foram analisadas 611 amostras de pacientes tratados com interferon alfa peguilado (αPEG-IFN) de diferentes regiões do Brasil. Nosso teste de RT-PCR em tempo real de uma etapa demonstrou bom desempenho na medição da carga viral e no monitoramento do curso do tratamento, com valores aceitáveis ​​de sensibilidade e especificidade.The Brazilian Public Health Service provides freely αPEG-IFN to treat patients infected with HCV. The primary goal of HCV therapy is the long-term elimination of HCV from the blood to reduce the risk of HCV associated complications and death. Patient viremia affects the treatment duration and response, thus influencing clinical decisions. We developed a high-throughput method to perform the quantification of RNA hepatitis C virus (HCV) virus load in plasma samples to monitor patients under treatment. The method is based on a duplex detection, in a one-step real-time RT-PCR assay and it has been validated according to the rules established by the official Brazilian regulatory agency (ANVISA). This new method was compared to a commercial kit (Cobas/Taqman HCV Test v2.0 - Roche), showing virus load results with significant correlation between them (p= 0,012) using commercial and clinical panels. In addition, 611 samples from patients treated with peguilated alfa-interferon (αPEG-IFN) from different regions of Brazil were analyzed. Our one-step real-time RT-PCR assay demonstrated good performance in viral load measurement and in treatment course monitoring, with acceptable sensitivity and specificity values.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.engHCVCarga viralPCR em tempo realAcompanhamento de pacientesHCVViral loadReal Time PCRMonitoring patientsAnticorpos Anti-Hepatite CCarga ViralReação em Cadeia da Polimerase em Tempo RealOne-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/39352/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALANDRADE_E_etal_One-step_real-time_2018.pdfANDRADE_E_etal_One-step_real-time_2018.pdfapplication/pdf378903https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/39352/2/ANDRADE_E_etal_One-step_real-time_2018.pdfedf3e56923be5a49636d8f68066b4251MD52TEXTANDRADE_E_etal_One-step_real-time_2018.pdf.txtANDRADE_E_etal_One-step_real-time_2018.pdf.txtExtracted texttext/plain28668https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/39352/3/ANDRADE_E_etal_One-step_real-time_2018.pdf.txt73d2cf8accb1f49374295cbb49e22a39MD53icict/393522020-01-27 16:41:36.022oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352020-01-27T19:41:36Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil
title One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil
spellingShingle One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil
Andrade, Elisabete
HCV
Carga viral
PCR em tempo real
Acompanhamento de pacientes
HCV
Viral load
Real Time PCR
Monitoring patients
Anticorpos Anti-Hepatite C
Carga Viral
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
title_short One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil
title_full One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil
title_fullStr One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil
title_full_unstemmed One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil
title_sort One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil
author Andrade, Elisabete
author_facet Andrade, Elisabete
Rocha, Daniele
Fontana-Maurell, Marcela
Costa, Elaine
Ribeiro, Marisa
Godoy, Daniela Tupy de
Ferreira, Antonio G. P.
Tanuri, Amilcar
Alvarez, Patrícia
Brindeiro, Rodrigo
author_role author
author2 Rocha, Daniele
Fontana-Maurell, Marcela
Costa, Elaine
Ribeiro, Marisa
Godoy, Daniela Tupy de
Ferreira, Antonio G. P.
Tanuri, Amilcar
Alvarez, Patrícia
Brindeiro, Rodrigo
author2_role author
author
author
author
author
author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Andrade, Elisabete
Rocha, Daniele
Fontana-Maurell, Marcela
Costa, Elaine
Ribeiro, Marisa
Godoy, Daniela Tupy de
Ferreira, Antonio G. P.
Tanuri, Amilcar
Alvarez, Patrícia
Brindeiro, Rodrigo
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv HCV
Carga viral
PCR em tempo real
Acompanhamento de pacientes
topic HCV
Carga viral
PCR em tempo real
Acompanhamento de pacientes
HCV
Viral load
Real Time PCR
Monitoring patients
Anticorpos Anti-Hepatite C
Carga Viral
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv HCV
Viral load
Real Time PCR
Monitoring patients
dc.subject.decs.pt_BR.fl_str_mv Anticorpos Anti-Hepatite C
Carga Viral
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
description O Serviço de Saúde Pública do Brasil fornece αPEG-IFN gratuitamente para tratar pacientes infectados pelo HCV. O objetivo principal da terapia com HCV é a eliminação a longo prazo do HCV do sangue para reduzir o risco de complicações e morte associadas ao HCV. A viremia do paciente afeta a duração e a resposta do tratamento, influenciando assim as decisões clínicas. Desenvolvemos um método de alto rendimento para realizar a quantificação da carga do vírus do RNA da hepatite C (HCV) em amostras de plasma para monitorar pacientes em tratamento. O método baseia-se na detecção duplex, em um teste de RT-PCR em tempo real de uma etapa, e foi validado de acordo com as regras estabelecidas pela agência reguladora oficial do Brasil (ANVISA). Esse novo método foi comparado a um kit comercial (Teste Cobas / Taqman HCV v2.0 - Roche), mostrando resultados de carga de vírus com correlação significativa entre eles (p = 0,012) usando painéis comerciais e clínicos. Além disso, foram analisadas 611 amostras de pacientes tratados com interferon alfa peguilado (αPEG-IFN) de diferentes regiões do Brasil. Nosso teste de RT-PCR em tempo real de uma etapa demonstrou bom desempenho na medição da carga viral e no monitoramento do curso do tratamento, com valores aceitáveis ​​de sensibilidade e especificidade.
publishDate 2018
dc.date.issued.fl_str_mv 2018
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-01-21T13:46:30Z
dc.date.available.fl_str_mv 2020-01-21T13:46:30Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv ANDRADE, E. et al. One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil. Brazilian Journal of Infectious Diseases, Salvador, v. 22, n. 5, p. 418-423, Sept./Oct. 2018.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/39352
dc.identifier.issn.pt_BR.fl_str_mv 1413-8670
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv 10.1016/j.bjid.2018.08.003
dc.identifier.eissn.none.fl_str_mv 1678-4391
identifier_str_mv ANDRADE, E. et al. One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil. Brazilian Journal of Infectious Diseases, Salvador, v. 22, n. 5, p. 418-423, Sept./Oct. 2018.
1413-8670
10.1016/j.bjid.2018.08.003
1678-4391
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/39352
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/39352/1/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/39352/2/ANDRADE_E_etal_One-step_real-time_2018.pdf
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/39352/3/ANDRADE_E_etal_One-step_real-time_2018.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
edf3e56923be5a49636d8f68066b4251
73d2cf8accb1f49374295cbb49e22a39
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1798324915606126592