Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Faria, Leonardo Lima de
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/40375
Resumo: Os erros no padrão de imprinting são caracterizados como alterações epigenéticas por não afetarem a sequência nucleotídica do DNA mas modificarem a expressão gênica. Diversos aspectos do desenvolvimento embrionário, incluindo ocorrência de malformações congênitas e síndromes diversas, como a síndrome de Beckwith-Wiedemann (SBW; OMIM#130650) ocorrem em decorrência de eventos epigenéticos. A etiologia molecular de SBW é descrita com base em alterações epigenéticas na região cromossômica 11p15.5, que possui genes cuja expressão é regulada por dois centros de imprinting (IC) ou regiões diferencialmente metiladas (DMR). O IC1, que controla a expressão dos genes IGF2 e H19 apresenta metilação no alelo paterno e ausência de metilação no alelo materno; o IC2 encontra-se metilado normalmente no alelo materno, participando no controle da expressão dos genes CDKN1C, KCNQ1 e KNCQ1OT1. A etiologia de SBW também está associada a mutações pontuais em genes como CDKN1C, que codifica um inibidor de kinase dependente de ciclina da fase G1 do ciclo celular. O objetivo deste trabalho é investigar alterações genéticas e epigenéticas em amostras de DNA de 21 pacientes com SBW oriundos do Ambulatórido de Genética Médica do Instituto Nacional Fernandes Figueira IFF/FIOCRUZ. A abordagem metodológica consistiu na análise do perfil de metilação dos dois centros de imprinting de 11p15.5 com uso da ténica de MS-MLPA; análise de microssatélites dessa região, visando discriminar alterações epigenéticas em ambos os centros de imprinting de possíveis dissomias uniparentais (UPD); e a amplificação do gene CDKN1C, para sequenciamento de Sanger. Dos 21 pacientes analisados inicialmente por MS-MLPA, sete não apresentaram nenhuma alteração epigenética. Após reavaliação clínica foi confirmado o diagnóstico de SBW em três desses sete pacientes enquanto que os outros quatro pacientes apresentaram características clínicas isoladas associadas à SBW, sendo excluídos da amostra. Nos 14 pacientes restantes a análise de MS-MLPA identificou 10 casos de perda isolada de metilação no IC2, três casos de deleção em IC2 e um caso de ganho de metilação em IC1 com perda em IC2 (UPDp). Este trabalho confirmou estudos anteriores sobre a ocorrência de alterações epignéticas nesta síndrome; em consequência, permitindo uma orientação clínica e antecipação do monitoramento de pacientes quanto ao risco de tumores pediátricos.
id CRUZ_07e5f3e7062a2bbb371b87182040fe9d
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/40375
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Faria, Leonardo Lima deGonzalez, Sayonara.Llerena Junior, Juan Clinton2020-03-18T13:45:44Z2020-03-18T13:45:44Z2018FARIA, Leonardo Lima de. Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann. 2018. 58 f. Dissertação (Mestrado em Pesquisa Aplicada à Saúde da Criança e da Mulher)-Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/40375Os erros no padrão de imprinting são caracterizados como alterações epigenéticas por não afetarem a sequência nucleotídica do DNA mas modificarem a expressão gênica. Diversos aspectos do desenvolvimento embrionário, incluindo ocorrência de malformações congênitas e síndromes diversas, como a síndrome de Beckwith-Wiedemann (SBW; OMIM#130650) ocorrem em decorrência de eventos epigenéticos. A etiologia molecular de SBW é descrita com base em alterações epigenéticas na região cromossômica 11p15.5, que possui genes cuja expressão é regulada por dois centros de imprinting (IC) ou regiões diferencialmente metiladas (DMR). O IC1, que controla a expressão dos genes IGF2 e H19 apresenta metilação no alelo paterno e ausência de metilação no alelo materno; o IC2 encontra-se metilado normalmente no alelo materno, participando no controle da expressão dos genes CDKN1C, KCNQ1 e KNCQ1OT1. A etiologia de SBW também está associada a mutações pontuais em genes como CDKN1C, que codifica um inibidor de kinase dependente de ciclina da fase G1 do ciclo celular. O objetivo deste trabalho é investigar alterações genéticas e epigenéticas em amostras de DNA de 21 pacientes com SBW oriundos do Ambulatórido de Genética Médica do Instituto Nacional Fernandes Figueira IFF/FIOCRUZ. A abordagem metodológica consistiu na análise do perfil de metilação dos dois centros de imprinting de 11p15.5 com uso da ténica de MS-MLPA; análise de microssatélites dessa região, visando discriminar alterações epigenéticas em ambos os centros de imprinting de possíveis dissomias uniparentais (UPD); e a amplificação do gene CDKN1C, para sequenciamento de Sanger. Dos 21 pacientes analisados inicialmente por MS-MLPA, sete não apresentaram nenhuma alteração epigenética. Após reavaliação clínica foi confirmado o diagnóstico de SBW em três desses sete pacientes enquanto que os outros quatro pacientes apresentaram características clínicas isoladas associadas à SBW, sendo excluídos da amostra. Nos 14 pacientes restantes a análise de MS-MLPA identificou 10 casos de perda isolada de metilação no IC2, três casos de deleção em IC2 e um caso de ganho de metilação em IC1 com perda em IC2 (UPDp). Este trabalho confirmou estudos anteriores sobre a ocorrência de alterações epignéticas nesta síndrome; em consequência, permitindo uma orientação clínica e antecipação do monitoramento de pacientes quanto ao risco de tumores pediátricos.Errors in imprinting pattern are characterized as epigenetic alterations, not affecting the nucleotide sequencing on DNA but affecting the gene expression. Several aspects of embrionary development, including occurrence of abnormalities and congenital disorders, as Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS; OMIM#130650) occur due epignetics events. The molecular etiology of SBW is described based on epigenetic alterations in 11p15.5 chromossomic region, wich includes genes that have the expression regulated by two imprinting centers (IC) or differentialy methylated region (DMR). The IC1 regulates the gene expression of IGF2 and H19 genes. This IC shows a high methylation level only in the paternal allele. The IC2, normally methylated on the maternal allele, controls de gene expression of CDKN1C, KCNQ1 e KNCQ1OT1 genes. Besides this alterations, SBW\2019s etiology is also associated with pontual mutations in CDKN1C gene, which encondes a cyclin dependent kinase inhibitor, acting on G1 celular cycle phase. The purpose of this study is to investigate genetics and epigenetics alterations in DNA samples of 21 patients with BWS from Instituto Nacional Fernandes Figueira IFF/FIOCRUZ. The methodological approach was based on the methylation profile\2019s analysis of the two 11p15.5 imprinting centers using the MS-MLPA technique; microsatellite analysis of this region, aiming to distinguish epigenetic alterations on both imprinting centers from possible uniparental disomy (UPD); and CDKN1C gene Sanger sequencing. Seven of 21 patients analysed by MS-MLPA did not shown any epigenetic alteration. After a clinical revaluation the SBW diagnosys was confirmed to three of this sevens patients while the reamining four only shown isolated clinial features associated with BWS. On 14 patients MS-MLPA analysis identified 10 cases of isolated loss of methylation on IC2, three cases of IC2 deletions and one case with both gain of methylation on IC1 and loss of methylation on IC2 (UDPp). This study confirmed previous researches about the epigenetic alteration occurence ih BWS; in consequence, allowing a clinical monitoring to this patients due the risk of pediatric tumors.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porSíndrome de Beckwith-WiedemannMetilaçãoEpigenéticaGene CDKN1CMS-MLPALocus 11p15.5Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemanninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2018Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes FigueiraFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Pesquisa Aplicada à Saúde da Criança e da Mulherinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/40375/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALleonardo_faria_iff_mest_2018.pdfapplication/pdf1699671https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/40375/2/leonardo_faria_iff_mest_2018.pdf2e96a9df830719a80cfbc3d8e7a3f9f5MD52TEXTleonardo_faria_iff_mest_2018.pdf.txtleonardo_faria_iff_mest_2018.pdf.txtExtracted texttext/plain88980https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/40375/3/leonardo_faria_iff_mest_2018.pdf.txt289bed359c3e386162018240f0c7b5ebMD53icict/403752020-03-20 14:37:37.17oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352020-03-20T17:37:37Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann
title Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann
spellingShingle Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann
Faria, Leonardo Lima de
Síndrome de Beckwith-Wiedemann
Metilação
Epigenética
Gene CDKN1C
MS-MLPA
Locus 11p15.5
title_short Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann
title_full Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann
title_fullStr Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann
title_full_unstemmed Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann
title_sort Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann
author Faria, Leonardo Lima de
author_facet Faria, Leonardo Lima de
author_role author
dc.contributor.advisorco.pt_BR.fl_str_mv Gonzalez, Sayonara.
dc.contributor.author.fl_str_mv Faria, Leonardo Lima de
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Llerena Junior, Juan Clinton
contributor_str_mv Llerena Junior, Juan Clinton
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Síndrome de Beckwith-Wiedemann
Metilação
Epigenética
Gene CDKN1C
MS-MLPA
Locus 11p15.5
topic Síndrome de Beckwith-Wiedemann
Metilação
Epigenética
Gene CDKN1C
MS-MLPA
Locus 11p15.5
description Os erros no padrão de imprinting são caracterizados como alterações epigenéticas por não afetarem a sequência nucleotídica do DNA mas modificarem a expressão gênica. Diversos aspectos do desenvolvimento embrionário, incluindo ocorrência de malformações congênitas e síndromes diversas, como a síndrome de Beckwith-Wiedemann (SBW; OMIM#130650) ocorrem em decorrência de eventos epigenéticos. A etiologia molecular de SBW é descrita com base em alterações epigenéticas na região cromossômica 11p15.5, que possui genes cuja expressão é regulada por dois centros de imprinting (IC) ou regiões diferencialmente metiladas (DMR). O IC1, que controla a expressão dos genes IGF2 e H19 apresenta metilação no alelo paterno e ausência de metilação no alelo materno; o IC2 encontra-se metilado normalmente no alelo materno, participando no controle da expressão dos genes CDKN1C, KCNQ1 e KNCQ1OT1. A etiologia de SBW também está associada a mutações pontuais em genes como CDKN1C, que codifica um inibidor de kinase dependente de ciclina da fase G1 do ciclo celular. O objetivo deste trabalho é investigar alterações genéticas e epigenéticas em amostras de DNA de 21 pacientes com SBW oriundos do Ambulatórido de Genética Médica do Instituto Nacional Fernandes Figueira IFF/FIOCRUZ. A abordagem metodológica consistiu na análise do perfil de metilação dos dois centros de imprinting de 11p15.5 com uso da ténica de MS-MLPA; análise de microssatélites dessa região, visando discriminar alterações epigenéticas em ambos os centros de imprinting de possíveis dissomias uniparentais (UPD); e a amplificação do gene CDKN1C, para sequenciamento de Sanger. Dos 21 pacientes analisados inicialmente por MS-MLPA, sete não apresentaram nenhuma alteração epigenética. Após reavaliação clínica foi confirmado o diagnóstico de SBW em três desses sete pacientes enquanto que os outros quatro pacientes apresentaram características clínicas isoladas associadas à SBW, sendo excluídos da amostra. Nos 14 pacientes restantes a análise de MS-MLPA identificou 10 casos de perda isolada de metilação no IC2, três casos de deleção em IC2 e um caso de ganho de metilação em IC1 com perda em IC2 (UPDp). Este trabalho confirmou estudos anteriores sobre a ocorrência de alterações epignéticas nesta síndrome; em consequência, permitindo uma orientação clínica e antecipação do monitoramento de pacientes quanto ao risco de tumores pediátricos.
publishDate 2018
dc.date.issued.fl_str_mv 2018
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-03-18T13:45:44Z
dc.date.available.fl_str_mv 2020-03-18T13:45:44Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv FARIA, Leonardo Lima de. Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann. 2018. 58 f. Dissertação (Mestrado em Pesquisa Aplicada à Saúde da Criança e da Mulher)-Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/40375
identifier_str_mv FARIA, Leonardo Lima de. Investigação genética e epigenética em pacientes com Síndrome de Beckwith-Wiedemann. 2018. 58 f. Dissertação (Mestrado em Pesquisa Aplicada à Saúde da Criança e da Mulher)-Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018.
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/40375
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/40375/1/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/40375/2/leonardo_faria_iff_mest_2018.pdf
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/40375/3/leonardo_faria_iff_mest_2018.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
2e96a9df830719a80cfbc3d8e7a3f9f5
289bed359c3e386162018240f0c7b5eb
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1813009087751782400