Dinâmica do estado de portador de neisseria meningitidis: estudo longitudinal com estudantes universitários de 18 a 24 anos de idade, Salvador, Brasil
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/54959 |
Resumo: | INTRODUÇÃO: Neisseria meningitidis (Nm) é uma bactéria que comumente coloniza a orofaringe de humanos, de forma assintomática, embora possa tornar-se patogênica, causando principalmente meningite. Os adolescentes e adultos jovens são os principais transmissores da bactéria e são, portanto, considerados alvos importantes de programas de vacinação. Estudos longitudinais com portadores assintomáticos podem fornecer informações fundamentais sobre a epidemiologia e estrutura da população das cepas circulantes de N. meningitidis. Entretanto, poucos estudos são realizados para estimar a duração do estado de portador assintomático do meningococo, através do acompanhamento de indivíduos ao longo do tempo. OBJETIVO: Estudar a dinâmica do estado de portador de Nm em uma população de estudantes de 18 a 24 anos de idade de uma universidade na cidade de Salvador, Bahia. MATERIAL E MÉTODOS: Entre os meses de fevereiro e novembro de 2019 nós conduzimos um estudo longitudinal para a coleta de cinco swabs de orofaringe de cada estudante. O isolamento e identificação das cepas de Nm foram realizados por métodos clássicos. O sequenciamento do genoma total (WGS) foi empregado para a caracterização molecular dos isolados. Foi aplicado um questionário para a obtenção das informações sociodemográficas dos estudantes. Além disso, foi calculada a taxa de aquisição de Nm bem como o tempo de colonização pela bactéria. RESULTADOS: Cada aluno realizou, em média, três coletas, sendo que 11,2% (n=47/418) deles apresentaram-se como portadores de Nm pelo menos uma vez durante o estudo. Sete estudantes foram portadores em cinco coletas. A taxa de aquisição do meningococo foi de 3,2% (n=12) e estava associada à frequência a festas pelo menos uma vez durante o estudo (OR: 4,37 95% IC 1,15 - 16,67; p=0,031). A maioria dos isolados (n=102/115; 88,7%) foi caracterizada como não-grupável, sendo que 72,2% (n=83/115) apresentaram deleção do gene da cápsula. O genogrupo B correspondeu a 8,7% (n=10/115) das cepas. Um total de 19 STs foram identificadas e distribuídas em oito complexos clonais. Quatro STs eram novos. O complexo clonal mais frequente foi o cc198, presente em 20% (n=23/115) dos isolados. As variantes de PorA e FetA mais prevalentes foram P1.18,25-37 (n=11; 9,6%) e F5-5 (n=65; 56,5%), respectivamente. Todos isolados apresentaram a PorB de classe 3. A subfamília A/v2-3 da FHbp correspondeu a 67,8% (n=78) dos isolados, enquanto a subvariante 912 da NHBA foi predominante entre as amostras analisadas (n=30; 26,1%). A maioria das cepas sequenciadas (n=74; 64,3%) não apresentou o gene nadA. Entretanto, a variante NadA-1.1 correspondeu a 4,3% (n=5) dos isolados e estava associada ao complexo clonal hiperinvasivo cc32. A média de tempo de colonização foi de 22,5 semanas, sendo que sete indivíduos permaneceram colonizados durante 38,8 semanas. A maioria (n=23/29; 79,3%) dos participantes albergou a mesma cepa ou cepas idênticas de Nm durante o estudo. CONCLUSÕES: Os resultados do nosso trabalho demonstram uma baixa taxa de aquisição de Nm entre os universitários; o estado de portador se mostrou duradouro, sendo mantido pela mesma cepa na maioria dos casos. Também foi identificada uma alta diversidade genética entre as cepas analisadas, com a predominância de isolados não-grupáveis. |
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Macedo, Lara Evellyn do NascimentoCampos, Leila Carvalho2022-10-03T12:18:55Z2022-10-03T12:18:55Z2022MACEDO, Lara Evellyn do Nascimento. Dinâmica do estado de portador de neisseria meningitidis: estudo longitudinal com estudantes universitários de 18 a 24 anos de idade, Salvador, Brasil. 2022. 113f. Dissertação, (mestrado)-Instituto Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2022.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/54959INTRODUÇÃO: Neisseria meningitidis (Nm) é uma bactéria que comumente coloniza a orofaringe de humanos, de forma assintomática, embora possa tornar-se patogênica, causando principalmente meningite. Os adolescentes e adultos jovens são os principais transmissores da bactéria e são, portanto, considerados alvos importantes de programas de vacinação. Estudos longitudinais com portadores assintomáticos podem fornecer informações fundamentais sobre a epidemiologia e estrutura da população das cepas circulantes de N. meningitidis. Entretanto, poucos estudos são realizados para estimar a duração do estado de portador assintomático do meningococo, através do acompanhamento de indivíduos ao longo do tempo. OBJETIVO: Estudar a dinâmica do estado de portador de Nm em uma população de estudantes de 18 a 24 anos de idade de uma universidade na cidade de Salvador, Bahia. MATERIAL E MÉTODOS: Entre os meses de fevereiro e novembro de 2019 nós conduzimos um estudo longitudinal para a coleta de cinco swabs de orofaringe de cada estudante. O isolamento e identificação das cepas de Nm foram realizados por métodos clássicos. O sequenciamento do genoma total (WGS) foi empregado para a caracterização molecular dos isolados. Foi aplicado um questionário para a obtenção das informações sociodemográficas dos estudantes. Além disso, foi calculada a taxa de aquisição de Nm bem como o tempo de colonização pela bactéria. RESULTADOS: Cada aluno realizou, em média, três coletas, sendo que 11,2% (n=47/418) deles apresentaram-se como portadores de Nm pelo menos uma vez durante o estudo. Sete estudantes foram portadores em cinco coletas. A taxa de aquisição do meningococo foi de 3,2% (n=12) e estava associada à frequência a festas pelo menos uma vez durante o estudo (OR: 4,37 95% IC 1,15 - 16,67; p=0,031). A maioria dos isolados (n=102/115; 88,7%) foi caracterizada como não-grupável, sendo que 72,2% (n=83/115) apresentaram deleção do gene da cápsula. O genogrupo B correspondeu a 8,7% (n=10/115) das cepas. Um total de 19 STs foram identificadas e distribuídas em oito complexos clonais. Quatro STs eram novos. O complexo clonal mais frequente foi o cc198, presente em 20% (n=23/115) dos isolados. As variantes de PorA e FetA mais prevalentes foram P1.18,25-37 (n=11; 9,6%) e F5-5 (n=65; 56,5%), respectivamente. Todos isolados apresentaram a PorB de classe 3. 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Também foi identificada uma alta diversidade genética entre as cepas analisadas, com a predominância de isolados não-grupáveis.INTRODUCTION: Neisseria meningitidis (Nm) is a common asymptomatic oropharyngeal colonizer in humans, which in rare cases can invade the bloodstream causing invasive disease such as meningitis. Adolescents and young adults play a pivotal role in transmission, and they are the main targets of vaccination programs. Longitudinal studies with asymptomatic carriers can provide important information on the epidemiology and structure of the circulating meningococcal strains. However, few studies were carried out to estimate the duration of carriage of Nm, following up individuals over time. AIM: To study the dynamics of meningococcal carriage among 18 to 24 years old students at a university in the city of Salvador, Bahia. MATERIALS AND METHODS: Between February and November 2019 we conducted a longitudinal study to collect five oropharyngeal swabs from each student. The isolation and identification of Nm strains were performed using classical methods. Whole genome sequencing (WGS) was performed for the molecular characterization of the isolates. A questionnaire was applied to obtain sociodemographic information of the students. In addition, the Nm acquisition rate and the duration of meningococcal colonization were calculated. RESULTS: On average, each student attented three visits and 11.2% (n=47/418) of them were positive for meningococcal carriage in at least one visit. Seven students were carriers in five visits. The meningococcal acquisition rate was 3.2% (n=12) and was associated with party attendance at least once during the study (OR: 4.37 95% CI 1.15 - 16.67; p= 0.031). Most of the isolates (n=102/115; 88.7%) were non-groupable and 72.2% (n=83/115) of them showed a deletion of the capsule gene. Genogroup B corresponded only to 8.7% (n=10/115) of the strains. The isolates were assigned to 19 STs and eight clonal complexes. Four new STs were identified. The most frequent clonal complex was cc198, which was present in 20% (n=23/115) of the isolates. The most prevalent PorA and FetA variants were P1.18,25-37 (n=11; 9.6%) and F5-5 (n=65; 56.5%), respectively. All isolates showed class 3 PorB. The FHbp A/v2-3 subfamily corresponded to 67.8% (n=78) of the isolates, whereas the subvariant 912 of NHBA was predominant among the analyzed samples (n=30; 26.1%). The majority of the strains (n=74; 64.3%) lacked nadA gene. However, the NadA-1.1 variant was found in 4.3% (n=5) of the isolates and was associated with the cc32 hyperinvasive clonal complex. The average duration of carriage was 22.5 weeks and seven individuals remained carriers for 38.8 weeks. The majority (n=23/29; 79.3%) of the participants harbored the same or identical strains of Nm during the study. CONCLUSIONS: Our data demonstrate a low acquisition rate of Nm among university students; carriage proved to be long-lasting and it was maintained by the same strain in most cases. A high genetic diversity was also identified among the analyzed strains, with a predominance of non groupable isolates.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES). Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia – FAPESB.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilporNeisseria meningitidisPortadorColonizaçãoEpidemiologiaNeisseria meningitidesCarrierColonizationEpidemiologyNeisseria MeningitidisPortadorColonizacaoEpidemiologiaDinâmica do estado de portador de neisseria meningitidis: estudo longitudinal com estudantes universitários de 18 a 24 anos de idade, Salvador, Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2022Instituto Gonçalo MonizMestrado AcadêmicoSalvadorPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/54959/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALLara_Evellyn_do_Nascimento_Macedo_Dissertacao.pdfapplication/pdf1693976https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/54959/2/Lara_Evellyn_do_Nascimento_Macedo_Dissertacao.pdf79752dc349bcc1f300dc38947f69cec7MD52icict/549592022-10-03 09:18:55.963oai:www.arca.fiocruz.br:icict/54959Tk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352022-10-03T12:18:55Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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