Seleção in silico de genes alterados pela exposição ao benzeno e avaliação do padrão de metilação de LINE-1 em trabalhadores de postos de combustíveis na zona oeste do Rio de Janeiro/RJ
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Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/34243 |
Resumo: | Trabalhadores de postos de combustíveis estão expostos há diversas substâncias químicas presentes no ambiente de trabalho, destacando-se entre elas o benzeno, por ser comprovadamente cancerígeno para seres humanos. O objetivo deste trabalho foi avaliar as alterações nos padrões de metilação do DNA de uma população exposta ocupacionalmente ao benzeno, em Postos de revenda de combustíveis (PRC) na Zona Oeste do município do Rio de Janeiro, como um possível biomarcador precoce a esta exposição, com intuito de estabelecer medidas de promoção à saúde dos trabalhadores e de redução dos níveis de benzeno no ar. Para tanto, foi utilizado metodologia para seleção de genes por meio de bioinformática com análises de dados em larga escala e foram desenvolvidas e padronizadas metodologia analíticas (como extração de DNA por salting out, eletroforese em gel de agarose, amplificação por PCR e conversão de DNA por bissulfito de sódio) para avaliar o padrão de metilação de DNA por pirosequenciamento no gene selecionado por bioinformática, no retrotransposon LINE-1 e no gene CDKN2B. Com o uso dos softwares de bioinformática, foi possível selecionar três possíveis biomarcadores (KLF6, JUN, KLF4) e dentre os três o gene KLF6 foi escolhido para este estudo. Participaram do estudo 88 trabalhadores, sendo 52 oriundos de 7 postos de combustíveis localizados nos bairros de Santa Cruz, Paciência e Sepetiba da AP5.3 e 35 trabalhadores expostos ambientalmente, pertencentes as portarias da fiocruz, dos quais apenas 12 (devidos as perdas ao longo das análises) trabalhadores (9 de postos de combustíveis e 3 das portarias) tiveram seus níveis de metilação mensurados. Neste trabalho só foi possível avaliar metilação para o retrotransposon LINE-1, para o qual os níveis médios de metilação para este gene, entre os trabalhadores, foram de 67,7 para os trabalhadores de postos de combustíveis e 68,4. As alterações que foram observadas nas populações estudadas são pequenas em valores, mas representam uma alteração precoce induzida pela exposição aos padrões normais de metilação demonstrando o potencial desta abordagem para contribuir na identificação de um biomarcador precoce de exposição à baixas doses de benzeno (precoce em relação aos desfechos à saúde relacionados ao metabolismo do benzeno, como alterações em leucócitos), impactando no estabelecimento de medidas de promoção a saúde dos trabalhadores. |
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Santos, Marcus Vinicius Corrêa dosPerini, Jamila AlessandraMattos, Rita de Cássia Oliveira da CostaLarentis, Ariane Leites2019-07-18T14:30:46Z2019-07-18T14:30:46Z2018SANTOS, Marcus Vinicius Corrêa dos. Seleção in silico de genes alterados pela exposição ao benzeno e avaliação do padrão de metilação de LINE-1 em trabalhadores de postos de combustíveis na zona oeste do Rio de Janeiro/RJ. 2018. 97 f. Dissertação (Mestrado em Saúde Pública e Meio Ambiente) - Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2018.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/34243Trabalhadores de postos de combustíveis estão expostos há diversas substâncias químicas presentes no ambiente de trabalho, destacando-se entre elas o benzeno, por ser comprovadamente cancerígeno para seres humanos. O objetivo deste trabalho foi avaliar as alterações nos padrões de metilação do DNA de uma população exposta ocupacionalmente ao benzeno, em Postos de revenda de combustíveis (PRC) na Zona Oeste do município do Rio de Janeiro, como um possível biomarcador precoce a esta exposição, com intuito de estabelecer medidas de promoção à saúde dos trabalhadores e de redução dos níveis de benzeno no ar. Para tanto, foi utilizado metodologia para seleção de genes por meio de bioinformática com análises de dados em larga escala e foram desenvolvidas e padronizadas metodologia analíticas (como extração de DNA por salting out, eletroforese em gel de agarose, amplificação por PCR e conversão de DNA por bissulfito de sódio) para avaliar o padrão de metilação de DNA por pirosequenciamento no gene selecionado por bioinformática, no retrotransposon LINE-1 e no gene CDKN2B. Com o uso dos softwares de bioinformática, foi possível selecionar três possíveis biomarcadores (KLF6, JUN, KLF4) e dentre os três o gene KLF6 foi escolhido para este estudo. Participaram do estudo 88 trabalhadores, sendo 52 oriundos de 7 postos de combustíveis localizados nos bairros de Santa Cruz, Paciência e Sepetiba da AP5.3 e 35 trabalhadores expostos ambientalmente, pertencentes as portarias da fiocruz, dos quais apenas 12 (devidos as perdas ao longo das análises) trabalhadores (9 de postos de combustíveis e 3 das portarias) tiveram seus níveis de metilação mensurados. Neste trabalho só foi possível avaliar metilação para o retrotransposon LINE-1, para o qual os níveis médios de metilação para este gene, entre os trabalhadores, foram de 67,7 para os trabalhadores de postos de combustíveis e 68,4. As alterações que foram observadas nas populações estudadas são pequenas em valores, mas representam uma alteração precoce induzida pela exposição aos padrões normais de metilação demonstrando o potencial desta abordagem para contribuir na identificação de um biomarcador precoce de exposição à baixas doses de benzeno (precoce em relação aos desfechos à saúde relacionados ao metabolismo do benzeno, como alterações em leucócitos), impactando no estabelecimento de medidas de promoção a saúde dos trabalhadores.Fuel station workers are exposed to several chemical substances present in the work environment, among them benzene, because it is proven carcinogenic to humans. The objective of this work was to evaluate the changes in DNA methylation patterns of an occupationally exposed population to benzene at the Fuel Resale Station (PRC) in the West Zone of the city of Rio de Janeiro, as a possible early biomarker for this exposure, with the aim of establishing measures to promote the health of workers and reduce the levels of benzene in the air. For this purpose, a methodology was used to select genes through bioinformatics with large scale analyzes of data and analytical methodology was developed and standardized (such as DNA extraction by salting out, agarose gel electrophoresis, PCR amplification and DNA conversion by sodium bisulfite) to evaluate the methylation pattern of DNA by pyrosequencing in the genes induced by bioinformatics and in the LINE-1 and CDKN2B genes. With the use of bioinformatics software, it was possible to select three possible biomarkers (KLF6, JUN, KLF4) and among the three the KLF6 gene was chosen for this study. 88 workers participated in the study, of which 52 were from 7 gas stations located in the districts of Santa Cruz, Paciência and Sepetiba of AP5.3 and 35 workers exposed to the environment, belonging to the orders of fiocruz, of which only 12 (due to losses over of the analyzes) workers (9 of the fuel stations and 3 of the ordinances) had their methylation levels measured. In this work it was only possible to evaluate methylation for the LINE-1 gene, for which the average levels of methylation for this gene among workers were 67.7 for workers at gas stations and 68.4. The changes that were observed in the studied populations are small in values but represent an early alteration induced by exposure to normal methylation patterns demonstrating the potential of this approach to contribute to the identification of an early biomarker of exposure to low doses of benzene (early in relation to health outcomes related to benzene metabolism, such as changes in leukocytes), impacting the establishment of measures to promote the health of workers.Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porBenzenoEpigenéticaBiologia de sistemasSaúde do trabalhadorBenzeneEpigeneticsSystems biologyOccupational healthBenzenoEpigenômicaBiologia de SistemasSaúde do TrabalhadorMetilação de DNATrabalhadoresPosto de CombustívelSeleção in silico de genes alterados pela exposição ao benzeno e avaliação do padrão de metilação de LINE-1 em trabalhadores de postos de combustíveis na zona oeste do Rio de Janeiro/RJIn silico selection of genes altered by benzene exposure and evaluation of the methylation pattern of LINE-1 in workers of fuel stations in the western zone of Rio de Janeiro / RJinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2018Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Fundação Oswaldo CruzFundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio AroucaRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Saúde Pública e Meio Ambienteinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34243/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALve_Marcus_Vinicius_ENSP_2018application/pdf6102684https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34243/2/ve_Marcus_Vinicius_ENSP_2018f4a5dd44d5acafcdac6695a3c06c5c80MD52TEXTve_Marcus_Vinicius_ENSP_2018.txtve_Marcus_Vinicius_ENSP_2018.txtExtracted texttext/plain169091https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34243/3/ve_Marcus_Vinicius_ENSP_2018.txt3d518daaf2741c347d2e61f5605fb43aMD53icict/342432021-02-09 00:01:51.016oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352021-02-09T03:01:51Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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