Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Costa, Maria Sandra Moura
Data de Publicação: 2012
Outros Autores: Nogueira, Paulo Afonso, Magalhães, Gleicienne Félix, Taquita, Paula, Mariúba, Luis André, Penatti, Marilene, Orlandi, Patrícia Puccinelli
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/9744
Resumo: Introdução: Entre 2000 e 2002, 79 amostras positivas para rotavírus foram coletadas de crianças com diarreia na Amazônia ocidental brasileira. Métodos: Para a caracterização molecular dos genótipos G e P foram realizadas as reações de RT-PCR e a análise dos eletroferotipos por eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE). Resultados: 59 amostras foram confirmadas como pertencentes ao rotavírus grupo A. Os genótipos G1P[8], G3P[8] e G4P[8] apresentaram perfis eletroforéticos longos. O genótipo G1P[8] foi encontrado em maior proporção. O eletroferotipo curto ocorreu apenas em genótipos G2. Conclusões: A proporção dos genótipos de rotavírus observada não foi diferente de outras áreas do Brasil. Este estudo é a primeira genotipagem de rotavírus na Amazônia ocidental brasileira.
id CRUZ_469c77e9ec0a390b5947101c820cd6f2
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/9744
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Costa, Maria Sandra MouraNogueira, Paulo AfonsoMagalhães, Gleicienne FélixTaquita, PaulaMariúba, Luis AndréPenatti, MarileneOrlandi, Patrícia Puccinelli2015-03-19T14:50:28Z2015-03-19T14:50:28Z2012COSTA, Maria Sandra Moura. Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, v. 45, n. 4, p. 520-522, Jul./Aug, 2012.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/9744Introdução: Entre 2000 e 2002, 79 amostras positivas para rotavírus foram coletadas de crianças com diarreia na Amazônia ocidental brasileira. Métodos: Para a caracterização molecular dos genótipos G e P foram realizadas as reações de RT-PCR e a análise dos eletroferotipos por eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE). Resultados: 59 amostras foram confirmadas como pertencentes ao rotavírus grupo A. Os genótipos G1P[8], G3P[8] e G4P[8] apresentaram perfis eletroforéticos longos. O genótipo G1P[8] foi encontrado em maior proporção. O eletroferotipo curto ocorreu apenas em genótipos G2. Conclusões: A proporção dos genótipos de rotavírus observada não foi diferente de outras áreas do Brasil. Este estudo é a primeira genotipagem de rotavírus na Amazônia ocidental brasileira.Introduction: During the period from 2000 to 2002, 79 rotavirus-positive stool samples were collected from children presenting diarrhea in the Western Brazilian Amazon. Methods: Molecular characterization of the G and P genotypes was performed using RT-PCR and electropherotyping analysis by polyacrylamide gel electrophoresis. Results: A total of 59 samples were confirmed as group A rotavirus. A long electrophoretic profile was exhibited by the G1P[8], G3P[8], and G4P[8] genotypes. The G1P[8] genotype was found in greater proportion. The short electropherotype was exhibited only by G2 genotype strains. Conclusions: The proportion of the rotavirus genotypes observed was not different from that in other areas of Brazil. This study is the first genotyping of rotavirus in the Western Brazilian Amazon.Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Setor de Microbiologia. Porto Velho, RO, Brasil.Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Setor de Microbiologia. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil.Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Setor de Microbiologia. Porto Velho, RO, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil.Hospital Infantil Cosme Damião. Direção de Pediatria. Porto Velho, RO, Brasil.Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Setor de Microbiologia. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Leônidas e Maria Deane. Manaus, AM, Brasil.engRotavírus grupo AGenotipagemAmazônia BrasileiraGroup A rotavirusGenotypingBrazilian AmazoniaRotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazoniainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82352https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/9744/1/license.txtafbdf7d7a9bcf771a1cc7edf5f618413MD51ORIGINALa21v45n4.pdfa21v45n4.pdfapplication/pdf755922https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/9744/2/a21v45n4.pdf2cc4544f02a0db7133fb2af4c019b317MD52TEXTa21v45n4.pdf.txta21v45n4.pdf.txtExtracted texttext/plain15359https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/9744/3/a21v45n4.pdf.txt25f39a659e296dd6471b59b91e5fb109MD53icict/97442018-04-04 08:26:29.658oai:www.arca.fiocruz.br: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ório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352018-04-04T11:26:29Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia
title Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia
spellingShingle Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia
Costa, Maria Sandra Moura
Rotavírus grupo A
Genotipagem
Amazônia Brasileira
Group A rotavirus
Genotyping
Brazilian Amazonia
title_short Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia
title_full Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia
title_fullStr Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia
title_full_unstemmed Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia
title_sort Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia
author Costa, Maria Sandra Moura
author_facet Costa, Maria Sandra Moura
Nogueira, Paulo Afonso
Magalhães, Gleicienne Félix
Taquita, Paula
Mariúba, Luis André
Penatti, Marilene
Orlandi, Patrícia Puccinelli
author_role author
author2 Nogueira, Paulo Afonso
Magalhães, Gleicienne Félix
Taquita, Paula
Mariúba, Luis André
Penatti, Marilene
Orlandi, Patrícia Puccinelli
author2_role author
author
author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Costa, Maria Sandra Moura
Nogueira, Paulo Afonso
Magalhães, Gleicienne Félix
Taquita, Paula
Mariúba, Luis André
Penatti, Marilene
Orlandi, Patrícia Puccinelli
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv Rotavírus grupo A
Genotipagem
Amazônia Brasileira
topic Rotavírus grupo A
Genotipagem
Amazônia Brasileira
Group A rotavirus
Genotyping
Brazilian Amazonia
dc.subject.en.pt_BR.fl_str_mv Group A rotavirus
Genotyping
Brazilian Amazonia
description Introdução: Entre 2000 e 2002, 79 amostras positivas para rotavírus foram coletadas de crianças com diarreia na Amazônia ocidental brasileira. Métodos: Para a caracterização molecular dos genótipos G e P foram realizadas as reações de RT-PCR e a análise dos eletroferotipos por eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE). Resultados: 59 amostras foram confirmadas como pertencentes ao rotavírus grupo A. Os genótipos G1P[8], G3P[8] e G4P[8] apresentaram perfis eletroforéticos longos. O genótipo G1P[8] foi encontrado em maior proporção. O eletroferotipo curto ocorreu apenas em genótipos G2. Conclusões: A proporção dos genótipos de rotavírus observada não foi diferente de outras áreas do Brasil. Este estudo é a primeira genotipagem de rotavírus na Amazônia ocidental brasileira.
publishDate 2012
dc.date.issued.fl_str_mv 2012
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-19T14:50:28Z
dc.date.available.fl_str_mv 2015-03-19T14:50:28Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv COSTA, Maria Sandra Moura. Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, v. 45, n. 4, p. 520-522, Jul./Aug, 2012.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/9744
identifier_str_mv COSTA, Maria Sandra Moura. Rotavirus genotyping in gastroenteritis cases of an infantile population from Western Brazilian Amazonia. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, v. 45, n. 4, p. 520-522, Jul./Aug, 2012.
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/9744
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/9744/1/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/9744/2/a21v45n4.pdf
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/9744/3/a21v45n4.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv afbdf7d7a9bcf771a1cc7edf5f618413
2cc4544f02a0db7133fb2af4c019b317
25f39a659e296dd6471b59b91e5fb109
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1813009210729824256

Registros relacionados