Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmanioses

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Raphaela Lopes da
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/61066
Resumo: Espécies pertencentes ao gênero Leishmania são agentes etiológicos das leishmanioses, um grupo de doenças que possuem grande impacto e distribuição mundial e são consideradas doenças reemergentes e negligenciadas pela Organização Mundial de Saúde. O arsenal terapêutico disponível para o tratamento dessas doenças é limitado, contando com apenas um fármaco com atividade por via oral, a miltefosina, que não é licenciada no Brasil para o tratamento em humanos. Os fármacos tradicionais, como os antimoniais pentavalentes, anfotericina B e petamidina provocam diversos efeitos colaterais, possuem alta toxicidade, alto custo, além de crescentes casos de resistência. A inovação radical no desenvolvimento de fármacos é um processo que consome muito tempo e requer grande investimento financeiro e de recursos humanos. O reposicionamento de fármacos é uma abordagem que pode ser útil, pois essa estratégia oferece a vantagem de trabalhar com compostos comprovadamente seguros, possuem um perfil farmacológico favorável em humanos e tem determinadas atividades biológicas já descritas. Enzimas do complexo citocromo P450 (P450) são a uma superfamília de proteínas encontradas em todos os seres vivos, com papel importante no metabolismo de xenobióticos, além de participarem em diversas vias metabólicas, como a biossíntese de esteróis e ácidos graxos, entre outras. Diversos trabalhos já vêm sugerindo a inibição da CYP51 (esterol C14-desmetilase) de Leishmania spp. como um possível alvo para a quimioterapia das leishmanioses. Desta forma, neste trabalho analisamos o genoma de L. infantum em busca de enzimas P450 que ainda não tenham sido descritas e que sejam similares às enzimas P450 humanas. Foi realizada a busca no genoma do parasito por sequências similares a enzimas P450 humanas e foram selecionados 4 hits estatisticamente significativos. Análises de busca in silico de motivos característicos da superfamília P450 revelaram que os hits selecionados possuem assinaturas específicas de enzimas P450, assim como atividades biológicas ligadas a função de oxidação-redução. A identificação e localização desses motivos e predição de estruturas secundárias dos hits revelaram a co-localização dos motivos dentro das 4 sequências e também a conservação das estruturas secundárias α-hélice e β-folha. Dados in silico de expressão de mRNA e expressão proteica desses hits, assim como ensaios experimentais de expressão de mRNA demonstraram que estas sequências podem ser potencialmente expressas em proteínas. Esses resultados mostraram que as sequências P450 putativas de L. infantum possuem potencial para serem classificadas na superfamília de enzimas P450 e para serem candidatos a alvos para o reposicionamento para o tratamento das leishmanioses
id CRUZ_48c269196829caeacb20edcce037081b
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/61066
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Silva, Raphaela Lopes daSantos, Eduardo Caio Torres dos2023-11-07T16:57:00Z2023-11-07T16:57:00Z2020SILVA, Raphaela Lopes da. Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionamento de fármacos para as leishmanioses. 2020. 100 f. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular ) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, RJ, 2020.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/61066Espécies pertencentes ao gênero Leishmania são agentes etiológicos das leishmanioses, um grupo de doenças que possuem grande impacto e distribuição mundial e são consideradas doenças reemergentes e negligenciadas pela Organização Mundial de Saúde. O arsenal terapêutico disponível para o tratamento dessas doenças é limitado, contando com apenas um fármaco com atividade por via oral, a miltefosina, que não é licenciada no Brasil para o tratamento em humanos. Os fármacos tradicionais, como os antimoniais pentavalentes, anfotericina B e petamidina provocam diversos efeitos colaterais, possuem alta toxicidade, alto custo, além de crescentes casos de resistência. A inovação radical no desenvolvimento de fármacos é um processo que consome muito tempo e requer grande investimento financeiro e de recursos humanos. O reposicionamento de fármacos é uma abordagem que pode ser útil, pois essa estratégia oferece a vantagem de trabalhar com compostos comprovadamente seguros, possuem um perfil farmacológico favorável em humanos e tem determinadas atividades biológicas já descritas. Enzimas do complexo citocromo P450 (P450) são a uma superfamília de proteínas encontradas em todos os seres vivos, com papel importante no metabolismo de xenobióticos, além de participarem em diversas vias metabólicas, como a biossíntese de esteróis e ácidos graxos, entre outras. Diversos trabalhos já vêm sugerindo a inibição da CYP51 (esterol C14-desmetilase) de Leishmania spp. como um possível alvo para a quimioterapia das leishmanioses. Desta forma, neste trabalho analisamos o genoma de L. infantum em busca de enzimas P450 que ainda não tenham sido descritas e que sejam similares às enzimas P450 humanas. Foi realizada a busca no genoma do parasito por sequências similares a enzimas P450 humanas e foram selecionados 4 hits estatisticamente significativos. Análises de busca in silico de motivos característicos da superfamília P450 revelaram que os hits selecionados possuem assinaturas específicas de enzimas P450, assim como atividades biológicas ligadas a função de oxidação-redução. A identificação e localização desses motivos e predição de estruturas secundárias dos hits revelaram a co-localização dos motivos dentro das 4 sequências e também a conservação das estruturas secundárias α-hélice e β-folha. Dados in silico de expressão de mRNA e expressão proteica desses hits, assim como ensaios experimentais de expressão de mRNA demonstraram que estas sequências podem ser potencialmente expressas em proteínas. Esses resultados mostraram que as sequências P450 putativas de L. infantum possuem potencial para serem classificadas na superfamília de enzimas P450 e para serem candidatos a alvos para o reposicionamento para o tratamento das leishmaniosesSpecies belonging to the genus Leishmania are etiological agents of leishmaniasis, a group of diseases that have great impact and worldwide distribution and are considered reemerging diseases and neglected by the World Health Organization (WHO). The therapeutic arsenal available for the treatment of these diseases is limited, with only one drug active by oral route, the miltefosine, which is not certified for human use in Brasil. The traditional drugs such as pentavalent antimonials, amphotericin B and pentamidine cause many side effects, have high toxicity, high cost, and increasing cases of resistance. Radical innovation in drug development is a time-consuming process that requires a large financial and human resource investment. Drug repurposing is a useful approach because this strategy offers the advantage of working with proven safe compounds, has a favorable pharmacological profile in humans, and has certain biological activities already described. Enzymes of the cytochrome P450 complex (P450) are a superfamily of proteins found in all living beings, with an important role in xenobiotic metabolism, and participate in many metabolic pathways, such as sterol and fatty acid biosynthesis, among others. Several works have already suggested inhibiting CYP51 (sterol C14-demethylase) from Leishmania spp. as a possible target for leishmaniasis chemotherapy. Thus, in this work we analyze the L. infantum genome for search P450 enzymes that have not yet been described and which are homologous to human P450 enzymes. The parasite genome was searched for human P450 enzymes homologous sequences and and 4 statistically significant hits were selected. In silico search analyzes of motifs characteristic of the P450 superfamily revealed that the selected hits have specific signatures of P450 enzymes, as well as biological activities linked to the oxidation-reduction function. The identification and location of these motifs and prediction of secondary structures of the hits revealed the co-localization of the motifs within the 4 sequences and also the conservation of the secondary structures α-helix and β-leaf. In silico data of mRNA expression and protein expression of these hits, as well as experimental mRNA expression assays demonstrated that these sequences can potentially be expressed in proteins. These results showed that the putative P450 sequences of L. infantum have the potential to be classified in the superfamily of P450 enzymes and to be candidates for targets for repositioning for the treatment of leishmaniasisFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porLeishmaniosesReposicionamento de FármacosSuperfamília P450BioinformáticaAlvos FarmacológicosLeishmanioseReposicionamento de MedicamentosBiologia ComputacionalSistema Enzimático do Citocromo P-450Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmaniosesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2020Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecularinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/61066/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALraphaela_silva_ioc_dout_2020.pdfapplication/pdf1696168https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/61066/2/raphaela_silva_ioc_dout_2020.pdf3e7441e95bcdb8bf9f2f6d07af1d8b28MD52icict/610662023-11-07 13:57:01.737oai:www.arca.fiocruz.br:icict/61066Tk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-11-07T16:57:01Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.en_US.fl_str_mv Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmanioses
title Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmanioses
spellingShingle Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmanioses
Silva, Raphaela Lopes da
Leishmanioses
Reposicionamento de Fármacos
Superfamília P450
Bioinformática
Alvos Farmacológicos
Leishmaniose
Reposicionamento de Medicamentos
Biologia Computacional
Sistema Enzimático do Citocromo P-450
title_short Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmanioses
title_full Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmanioses
title_fullStr Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmanioses
title_full_unstemmed Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmanioses
title_sort Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionemento de fármacos para as leishmanioses
author Silva, Raphaela Lopes da
author_facet Silva, Raphaela Lopes da
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Raphaela Lopes da
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Santos, Eduardo Caio Torres dos
contributor_str_mv Santos, Eduardo Caio Torres dos
dc.subject.other.en_US.fl_str_mv Leishmanioses
Reposicionamento de Fármacos
Superfamília P450
Bioinformática
Alvos Farmacológicos
topic Leishmanioses
Reposicionamento de Fármacos
Superfamília P450
Bioinformática
Alvos Farmacológicos
Leishmaniose
Reposicionamento de Medicamentos
Biologia Computacional
Sistema Enzimático do Citocromo P-450
dc.subject.decs.en_US.fl_str_mv Leishmaniose
Reposicionamento de Medicamentos
Biologia Computacional
Sistema Enzimático do Citocromo P-450
description Espécies pertencentes ao gênero Leishmania são agentes etiológicos das leishmanioses, um grupo de doenças que possuem grande impacto e distribuição mundial e são consideradas doenças reemergentes e negligenciadas pela Organização Mundial de Saúde. O arsenal terapêutico disponível para o tratamento dessas doenças é limitado, contando com apenas um fármaco com atividade por via oral, a miltefosina, que não é licenciada no Brasil para o tratamento em humanos. Os fármacos tradicionais, como os antimoniais pentavalentes, anfotericina B e petamidina provocam diversos efeitos colaterais, possuem alta toxicidade, alto custo, além de crescentes casos de resistência. A inovação radical no desenvolvimento de fármacos é um processo que consome muito tempo e requer grande investimento financeiro e de recursos humanos. O reposicionamento de fármacos é uma abordagem que pode ser útil, pois essa estratégia oferece a vantagem de trabalhar com compostos comprovadamente seguros, possuem um perfil farmacológico favorável em humanos e tem determinadas atividades biológicas já descritas. Enzimas do complexo citocromo P450 (P450) são a uma superfamília de proteínas encontradas em todos os seres vivos, com papel importante no metabolismo de xenobióticos, além de participarem em diversas vias metabólicas, como a biossíntese de esteróis e ácidos graxos, entre outras. Diversos trabalhos já vêm sugerindo a inibição da CYP51 (esterol C14-desmetilase) de Leishmania spp. como um possível alvo para a quimioterapia das leishmanioses. Desta forma, neste trabalho analisamos o genoma de L. infantum em busca de enzimas P450 que ainda não tenham sido descritas e que sejam similares às enzimas P450 humanas. Foi realizada a busca no genoma do parasito por sequências similares a enzimas P450 humanas e foram selecionados 4 hits estatisticamente significativos. Análises de busca in silico de motivos característicos da superfamília P450 revelaram que os hits selecionados possuem assinaturas específicas de enzimas P450, assim como atividades biológicas ligadas a função de oxidação-redução. A identificação e localização desses motivos e predição de estruturas secundárias dos hits revelaram a co-localização dos motivos dentro das 4 sequências e também a conservação das estruturas secundárias α-hélice e β-folha. Dados in silico de expressão de mRNA e expressão proteica desses hits, assim como ensaios experimentais de expressão de mRNA demonstraram que estas sequências podem ser potencialmente expressas em proteínas. Esses resultados mostraram que as sequências P450 putativas de L. infantum possuem potencial para serem classificadas na superfamília de enzimas P450 e para serem candidatos a alvos para o reposicionamento para o tratamento das leishmanioses
publishDate 2020
dc.date.issued.fl_str_mv 2020
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-11-07T16:57:00Z
dc.date.available.fl_str_mv 2023-11-07T16:57:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SILVA, Raphaela Lopes da. Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionamento de fármacos para as leishmanioses. 2020. 100 f. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular ) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, RJ, 2020.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/61066
identifier_str_mv SILVA, Raphaela Lopes da. Identificação da família P450 como potenciais alvos moleculares para o reposicionamento de fármacos para as leishmanioses. 2020. 100 f. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular ) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, RJ, 2020.
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/61066
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/61066/1/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/61066/2/raphaela_silva_ioc_dout_2020.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
3e7441e95bcdb8bf9f2f6d07af1d8b28
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1813008955493842944