Análise de polimorfismos de nucleotídeo único (snps) em genes codificadores de tlrs e de proteínas da rota de ativação provocada por tlrs, em pacientes infectados com zika vírus com manifestações no sistema nervoso
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Data de Publicação: | 2020 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/43605 |
Resumo: | A Zika é uma arbovirose causada pelo vírus Zika (ZIKV) que é transmitido por mosquitos do gênero Aedes. Até recentemente era considerado que o ZIKV causava infecções de evolução benignas e esporádicas em humanos na África e na Ásia, mas com a disseminação para outros locais, foi observado um aumento nas ocorrências de casos com complicações no sistema nervoso (SN), associados à infecção por ZIKV, como a síndrome de Guillain-Barré (SGB) e malformações congênitas graves em crianças e fetos de mulheres, que foram infectadas com o vírus durante a gravidez. Não está bem esclarecido o mecanismo de indução da resposta imune contra ZIKV. Uma hipótese levantada para os casos de manifestações neurológicas seriam fatores genéticos do hospedeiro. Os polimorfismos são alterações no genoma que podem ou não comprometer a função dos genes. Os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) são de grande importância, quando presentes em genes que atuam no sistema imune inato, podendo comprometer a atividade desses genes e, como consequência, a resposta do indivíduo às infecções. Ainda não está descrita a associação de SNPs na predisposição a manifestações graves nas infecções por ZIKV. O objetivo deste trabalho foi avaliar a presença de SNPs em DNA obtido de 16 amostras de LCR de crianças infectadas por ZIKV, que tiveram manifestações no SN. Os SNPs foram selecionados de acordo com a literatura e estão associados a genes codificadores de receptores do tipo Toll (TLR) e de proteínas que ativam a via de TLR. Os SNPs selecionados para o estudo foram: rs8177374 no gene de tirap, rs3775291 no gene de tlr3 e rs179008 no gene de tlr7. Estes SNPs foram avaliados por ensaios com sonda TaqMan, utilizando-se qPCR. Foi encontrada uma alta frequência de alelos mutados nos genes de tlr7 e de tirap. O SNP analisado para tlr3 não foi encontrado nas 16 amostras. Com nossos resultados concluímos que os SNPs encontrados em tlr7 e tirap podem estar envolvidos no desfecho mais grave dos pacientes estudados e que não foi encontrado SNP em tlr3. |
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Silva, Thaís Bárbara de SouzaKroon, Erna GessienAlves, Pedro AugustoCampos, Marco Antônio da SilvaRocha, Marcele NevesGuedes, Maria Isabel Maldonado CoelhoCampos, Marco Antônio da Silva2020-09-24T14:39:50Z2020-09-24T14:39:50Z2020SILVA, Thaís Bárbara de Souza. Análise de polimorfismos de nucleotídeo único (snps) em genes codificadores de tlrs e de proteínas da rota de ativação provocada por tlrs, em pacientes infectados com zika vírus com manifestações no sistema nervoso. 2020. 87 f. Dissertação (Mestrado em Ciências - Área de concentração Biologia Celular e Molecular, Genética e Bioinformática) - Instituto René Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Belo Horizonte, 2020.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/43605A Zika é uma arbovirose causada pelo vírus Zika (ZIKV) que é transmitido por mosquitos do gênero Aedes. Até recentemente era considerado que o ZIKV causava infecções de evolução benignas e esporádicas em humanos na África e na Ásia, mas com a disseminação para outros locais, foi observado um aumento nas ocorrências de casos com complicações no sistema nervoso (SN), associados à infecção por ZIKV, como a síndrome de Guillain-Barré (SGB) e malformações congênitas graves em crianças e fetos de mulheres, que foram infectadas com o vírus durante a gravidez. Não está bem esclarecido o mecanismo de indução da resposta imune contra ZIKV. Uma hipótese levantada para os casos de manifestações neurológicas seriam fatores genéticos do hospedeiro. Os polimorfismos são alterações no genoma que podem ou não comprometer a função dos genes. Os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) são de grande importância, quando presentes em genes que atuam no sistema imune inato, podendo comprometer a atividade desses genes e, como consequência, a resposta do indivíduo às infecções. Ainda não está descrita a associação de SNPs na predisposição a manifestações graves nas infecções por ZIKV. O objetivo deste trabalho foi avaliar a presença de SNPs em DNA obtido de 16 amostras de LCR de crianças infectadas por ZIKV, que tiveram manifestações no SN. Os SNPs foram selecionados de acordo com a literatura e estão associados a genes codificadores de receptores do tipo Toll (TLR) e de proteínas que ativam a via de TLR. Os SNPs selecionados para o estudo foram: rs8177374 no gene de tirap, rs3775291 no gene de tlr3 e rs179008 no gene de tlr7. Estes SNPs foram avaliados por ensaios com sonda TaqMan, utilizando-se qPCR. Foi encontrada uma alta frequência de alelos mutados nos genes de tlr7 e de tirap. O SNP analisado para tlr3 não foi encontrado nas 16 amostras. Com nossos resultados concluímos que os SNPs encontrados em tlr7 e tirap podem estar envolvidos no desfecho mais grave dos pacientes estudados e que não foi encontrado SNP em tlr3.Zika is an arboviruse caused by the Zika virus (ZIKV) that is transmitted by mosquitoes of the genus Aedes. Until recently, ZIKV was considered to cause benign and sporadic infections in humans in Africa and Asia, but with the spread to other locations, an increase in the occurrence of cases with complications in the nervous system (SN) associated with the ZIKV infection was observed, such as Guillain-Barré syndrome (GBS) and severe congenital malformations in children and fetuses of women who were infected with the ZIKV during pregnancy. The mechanism for inducing the immune response against ZIKV is not well understood. A hypothesis raised for cases of neurological manifestations would be genetic factors of the host. Polymorphisms are changes in the genome that may or may not compromise the function of genes. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are of great importance, when present in genes that act on the innate immune system, and can compromise the activity of these genes and, consequently, the individual's response to infections. The association of SNPs in the predisposition to severe manifestations in ZIKV infections is unknown. Our objective was to evaluate the presence of SNPs in DNA of 16 CSF samples from children infected with ZIKV, who had manifestations in SN. SNPs were selected according to the literature and are associated with genes encoding Toll-like receptors (TLR) and proteins that activate TLR pathway. The SNPs selected for the study were: rs8177374 in the tirap gene, rs3775291 in the tlr3 gene and rs179008 in the tlr7 gene. These were evaluated by tests with a TaqMan probe, using qPCR. A high frequency of mutated alleles was found in the tlr7 and tirap genes. The SNP analyzed for tlr3 was not found in the 16 samples. With our results we conclude that the SNPs found in tlr7 and tirap may be involved in the most severe outcome of the studied patients and no SNP was found in tlr3.CAPES, CNPq, IRRFundação Oswaldo Cruz. Instituto Rene Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.porZika vírusVariação FenotípicaPolimorfismosSNPTLRTIRAPAnálise de polimorfismos de nucleotídeo único (snps) em genes codificadores de tlrs e de proteínas da rota de ativação provocada por tlrs, em pacientes infectados com zika vírus com manifestações no sistema nervosoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2020Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Rene Rachou. Belo Horizonte, MG, BrasilUniversidade Federal de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, BrasilMestrado AcadêmicoBelo Horizonte, MG, BrasilPrograma de Pós-graduação em Ciências da Saúdeinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83082https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/43605/1/license.txt9193a7c197bc67acd023525e72a03240MD51ORIGINALD_2020_Thaís Bárbara Souza Silva.pdfD_2020_Thaís Bárbara Souza Silva.pdfapplication/pdf2678868https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/43605/2/D_2020_Tha%c3%ads%20B%c3%a1rbara%20Souza%20Silva.pdff972108fc9bff03df916d94203935780MD52TEXTD_2020_Thaís Bárbara Souza Silva.pdf.txtD_2020_Thaís Bárbara Souza Silva.pdf.txtExtracted texttext/plain151628https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/43605/3/D_2020_Tha%c3%ads%20B%c3%a1rbara%20Souza%20Silva.pdf.txt5b8b8fff1e0fb9600992161a410eedc9MD53icict/436052020-09-26 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A Zika é uma arbovirose causada pelo vírus Zika (ZIKV) que é transmitido por mosquitos do gênero Aedes. Até recentemente era considerado que o ZIKV causava infecções de evolução benignas e esporádicas em humanos na África e na Ásia, mas com a disseminação para outros locais, foi observado um aumento nas ocorrências de casos com complicações no sistema nervoso (SN), associados à infecção por ZIKV, como a síndrome de Guillain-Barré (SGB) e malformações congênitas graves em crianças e fetos de mulheres, que foram infectadas com o vírus durante a gravidez. Não está bem esclarecido o mecanismo de indução da resposta imune contra ZIKV. Uma hipótese levantada para os casos de manifestações neurológicas seriam fatores genéticos do hospedeiro. Os polimorfismos são alterações no genoma que podem ou não comprometer a função dos genes. Os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) são de grande importância, quando presentes em genes que atuam no sistema imune inato, podendo comprometer a atividade desses genes e, como consequência, a resposta do indivíduo às infecções. Ainda não está descrita a associação de SNPs na predisposição a manifestações graves nas infecções por ZIKV. O objetivo deste trabalho foi avaliar a presença de SNPs em DNA obtido de 16 amostras de LCR de crianças infectadas por ZIKV, que tiveram manifestações no SN. Os SNPs foram selecionados de acordo com a literatura e estão associados a genes codificadores de receptores do tipo Toll (TLR) e de proteínas que ativam a via de TLR. Os SNPs selecionados para o estudo foram: rs8177374 no gene de tirap, rs3775291 no gene de tlr3 e rs179008 no gene de tlr7. Estes SNPs foram avaliados por ensaios com sonda TaqMan, utilizando-se qPCR. Foi encontrada uma alta frequência de alelos mutados nos genes de tlr7 e de tirap. O SNP analisado para tlr3 não foi encontrado nas 16 amostras. Com nossos resultados concluímos que os SNPs encontrados em tlr7 e tirap podem estar envolvidos no desfecho mais grave dos pacientes estudados e que não foi encontrado SNP em tlr3. |
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