Recovery of Norovirus from lettuce (Lactuca sativa) using an adsorption — elution method with a negatively charged membrane: comparison of two elution buffers
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Data de Publicação: | 2014 |
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Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/10816 |
Resumo: | Salina tamponada fosfatada (STF) e tampão glicina (TG) foram avaliados como eluentes em um método de adsorção-eluição, utilizando membrana carregada negativamente associada com reação quantitativa de polimerase em cadeia (qPCR) e semi-nested PCR, para detecção de Norovírus do genogrupo II (NoV GII) a partir de alface. Nesta metodologia, o bacteriófago PP7 foi utilizado como controle do processo. A qPCR apresentou maior sensibilidade do que o semi-nested PCR na detecção de NoV GII. A eficiência de recuperação, utilizando STF e TG, variou de 24,72 a 60,78% e de 19,48 a 137,26% para NoV GII e de 0,01 a 0,15% e de 0,13 a 6,04% para o bacteriófago PP7, respectivamente. A eluição com TG foi mais eficiente na recuperação do bacteriófago PP7 (p = 0,03) embora nenhuma diferença tenha sido observada para NoV GII (p = 0,57). O TG apresentou melhor desempenho que a STF como solução para eluição e pode ser considerada uma melhoria do método. |
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Brandão, Marcelo Luiz LimaAlmeida, Davi de OliveiraMarin, Victor AugustusMiagostovich, Marize Pereira2015-06-12T13:57:50Z2015-06-12T13:57:50Z2014BRANDÃO. Marcelo Luiz Lima et al. Recovery of Norovirus from lettuce (Lactuca sativa) using an adsorption — elution method with a negatively charged membrane: comparison of two elution buffers. Visa em Debate, v.2, n.3, p.58-63, 2014.2317-269Xhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/1081610.3395/vd.v2i3.195Salina tamponada fosfatada (STF) e tampão glicina (TG) foram avaliados como eluentes em um método de adsorção-eluição, utilizando membrana carregada negativamente associada com reação quantitativa de polimerase em cadeia (qPCR) e semi-nested PCR, para detecção de Norovírus do genogrupo II (NoV GII) a partir de alface. Nesta metodologia, o bacteriófago PP7 foi utilizado como controle do processo. A qPCR apresentou maior sensibilidade do que o semi-nested PCR na detecção de NoV GII. A eficiência de recuperação, utilizando STF e TG, variou de 24,72 a 60,78% e de 19,48 a 137,26% para NoV GII e de 0,01 a 0,15% e de 0,13 a 6,04% para o bacteriófago PP7, respectivamente. A eluição com TG foi mais eficiente na recuperação do bacteriófago PP7 (p = 0,03) embora nenhuma diferença tenha sido observada para NoV GII (p = 0,57). O TG apresentou melhor desempenho que a STF como solução para eluição e pode ser considerada uma melhoria do método.Phosphate saline buffer (PBS) and glycine buffer (GB) were evaluated as elution buffers in an adsorption-elution method using a negatively charged membrane associated with quantitative polymerase chain reaction (qPCR) and semi-nested PCR for detection of Norovirus genogroup II (NoV GII) from lettuce. In this methodology, PP7 bacteriophage was used as a virus sample for process control. The qPCR showed more sensitivity than semi-nested PCR for NoV GII detection. The recovery efficiency, using PBS and GB, ranged from 24.72 to 60.78% and 19.48 to 137.26% for NoV GII, and from 0.01 to 0.15% and 0.13 to 6.04% for PP7 bacteriophage, respectively. Elution with GB was more efficient for PP7 bacteriophage recovery (p = 0.03), but no difference was seen for NoV GII (p = 0.57). The GB performed better than PBS as an eluent solution and can be considered a methodological improvement.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde (INCQS). Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia (Inmetro). Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro (Unirio). Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.engFundação Oswaldo CruzNorovírusFiltraçãoAlfaceBacteriófago PP7Controle Interno de ProcessoNorovirusFiltrationLettucePP7 BacteriophageInternal Control ProcessRecovery of Norovirus from lettuce (Lactuca sativa) using an adsorption — elution method with a negatively charged membrane: comparison of two elution buffersRecuperação de Norovirus a partir de alface (Lactuca sativa) utilizando um método de adsorção-eluição com membrana negativamente carregada — comparação de dois tampões de eluiçãoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1914https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/10816/1/license.txt7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81fMD51ORIGINALmarize_miagostovich2etal_IOC_2014.pdfapplication/pdf307688https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/10816/2/marize_miagostovich2etal_IOC_2014.pdf0e6806e8c4c9a412075b82a945bd33c6MD52TEXTmarize_miagostovich2etal_IOC_2014.pdf.txtmarize_miagostovich2etal_IOC_2014.pdf.txtExtracted texttext/plain29709https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/10816/3/marize_miagostovich2etal_IOC_2014.pdf.txt24c035f060687c0bcbdaa85fa1881179MD53icict/108162022-06-24 12:17:41.347oai:www.arca.fiocruz.br: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ório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352022-06-24T15:17:41Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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