Isolamento e identificação de amebas de vida livre presentes no microbioma intestinal de primatas não humanos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Cardoso, Igor Rodrigues
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/49204
Resumo: Amebas de vida livre (AVLs) são protozoários cosmopolitas amplamente encontrados em ambientes de água doce, naturais e artificiais, no solo e em poeira. Notoriamente, algumas espécies dos gêneros Acanthamoeba spp., Balamuthia spp., Sappinia spp. e Naegleria spp., são potencialmente patogênicas para o ser humano e para outros animais e são consideradas carreadoras de microrganismos por meio de relações transitórias ou simbióticas. A presença de AVLs no microbioma intestinal tem sido aventada, mas pouco explorada. Assim, este estudo teve como objetivo realizar a caracterização morfológica e molecular de AVLs isoladas do microbioma intestinal de primatas não humanos (PNHs). Para tanto, amostras de fezes de PNHs foram diluídas, filtradas e semeadas em meio ágar-não nutriente. As análises morfológicas foram realizadas por observação direta no microscópico invertido e pelas técnicas de coloração Giemsa, Panótico® e Tricrômico. Para a identificação molecular dos isolados foi empregada a reação em cadeia da polimerase (PCR), seguido da reação de sequenciamento para o alvo molecular 18S rDNA, mitocondrial SSU-rDNA, COI e ITS. Foram coletadas 96 amostras de PNHs do serviço de Criação de Primatas não Humanos (SCPrim) do Instituto de Ciências e Tecnologia em Biomodelos (ICTB, Fiocruz) e cinco amostras de Callithrix spp. de vida livre, da Estação Biológica FIOCRUZ Mata Atlântica. Das 101 amostras de fezes analisadas, 46 foram positivas para AVLs na cultura. As análises morfológicas revelaram que 17 amostras apresentaram majoritariamente cistos com formatos poligonais e/ou trofozoítos com projeções, do tipo acantopódios, representando uma sinapomorfia do gênero Acanthamoeba. As demais amostras, apresentaram cistos arredondados e/ou trofozoítos com pseudópodos tipo lobópodes, três amostras apresentaram a forma flagelar, sugestiva do gênero Naegleria. As técnicas de coloração, Giemsa e Panótico® foram eficientes para evidenciar as estruturas citoplasmáticas das formas trofozoítos e cistos. Todavia, a coloração por Panótico® destacou-se por ser simples, rápida e evidenciou os acantopódios, não observados por meio da coloração de Giemsa. Das 46 amostras positivas, 28 foram amplificadas pela PCR para o alvo 18S do rDNA específico para o gênero Acanthamoeba spp e 33 amostras foram amplificadas quando utilizamos os NA1 e NA2 (amplifica Vermamoeba spp. e Vanella spp.). O sequenciamento de DNA revelou a presença de Acanthamoeba, genótipo T4 em quatro amostras e, em uma amostra identificamos Vermamoeba vermiformis. Todavia, não obtivemos êxito no sequenciamento das demais amostras em virtude da presença de picos duplos e da obtenção de sequências curtas. Os resultados obtidos mostram-nos notavelmente um velho inimigo apresentando novos desafios. A presença de AVLs no intestino de PNHs precisa ser investigada, com potencial relevância para estudos futuros sobre a homeostase intestinal, imunologia da mucosa e potencial patogênico das AVLs e seus organismos intracelulares, podendo ser considerado um campo emergente de suma importância para a saúde publica.
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spelling Cardoso, Igor RodriguesSantos, Helena Lúcia CarneiroToma, Helena Keiko2021-09-29T15:35:06Z2021-09-29T15:35:06Z2021CARDOSO, Igor Rodrigues. Isolamento e identificação de amebas de vida livre presentes no microbioma intestinal de primatas não humanos. 2021. 94 f. Dissertação (Mestrado em Medicina Tropical) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2021.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/49204Amebas de vida livre (AVLs) são protozoários cosmopolitas amplamente encontrados em ambientes de água doce, naturais e artificiais, no solo e em poeira. Notoriamente, algumas espécies dos gêneros Acanthamoeba spp., Balamuthia spp., Sappinia spp. e Naegleria spp., são potencialmente patogênicas para o ser humano e para outros animais e são consideradas carreadoras de microrganismos por meio de relações transitórias ou simbióticas. A presença de AVLs no microbioma intestinal tem sido aventada, mas pouco explorada. Assim, este estudo teve como objetivo realizar a caracterização morfológica e molecular de AVLs isoladas do microbioma intestinal de primatas não humanos (PNHs). Para tanto, amostras de fezes de PNHs foram diluídas, filtradas e semeadas em meio ágar-não nutriente. As análises morfológicas foram realizadas por observação direta no microscópico invertido e pelas técnicas de coloração Giemsa, Panótico® e Tricrômico. Para a identificação molecular dos isolados foi empregada a reação em cadeia da polimerase (PCR), seguido da reação de sequenciamento para o alvo molecular 18S rDNA, mitocondrial SSU-rDNA, COI e ITS. Foram coletadas 96 amostras de PNHs do serviço de Criação de Primatas não Humanos (SCPrim) do Instituto de Ciências e Tecnologia em Biomodelos (ICTB, Fiocruz) e cinco amostras de Callithrix spp. de vida livre, da Estação Biológica FIOCRUZ Mata Atlântica. Das 101 amostras de fezes analisadas, 46 foram positivas para AVLs na cultura. As análises morfológicas revelaram que 17 amostras apresentaram majoritariamente cistos com formatos poligonais e/ou trofozoítos com projeções, do tipo acantopódios, representando uma sinapomorfia do gênero Acanthamoeba. As demais amostras, apresentaram cistos arredondados e/ou trofozoítos com pseudópodos tipo lobópodes, três amostras apresentaram a forma flagelar, sugestiva do gênero Naegleria. As técnicas de coloração, Giemsa e Panótico® foram eficientes para evidenciar as estruturas citoplasmáticas das formas trofozoítos e cistos. Todavia, a coloração por Panótico® destacou-se por ser simples, rápida e evidenciou os acantopódios, não observados por meio da coloração de Giemsa. Das 46 amostras positivas, 28 foram amplificadas pela PCR para o alvo 18S do rDNA específico para o gênero Acanthamoeba spp e 33 amostras foram amplificadas quando utilizamos os NA1 e NA2 (amplifica Vermamoeba spp. e Vanella spp.). O sequenciamento de DNA revelou a presença de Acanthamoeba, genótipo T4 em quatro amostras e, em uma amostra identificamos Vermamoeba vermiformis. Todavia, não obtivemos êxito no sequenciamento das demais amostras em virtude da presença de picos duplos e da obtenção de sequências curtas. Os resultados obtidos mostram-nos notavelmente um velho inimigo apresentando novos desafios. A presença de AVLs no intestino de PNHs precisa ser investigada, com potencial relevância para estudos futuros sobre a homeostase intestinal, imunologia da mucosa e potencial patogênico das AVLs e seus organismos intracelulares, podendo ser considerado um campo emergente de suma importância para a saúde publica.Free-living amoebae (FLA) are cosmopolitan protozoa widely found in freshwater, natural and artificial environments, in soil and in dust. Notoriously, some species of the genera Acanthamoeba spp., Balamuthia spp., Sappinia spp. and Naegleria spp., are potentially pathogenic for humans and other animals and are considered carriers of microorganisms through transient or symbiotic relationships. The presence of FLA in the intestinal microbiome has been suggested, but little explored. Thus, this study aimed to perform the morphological and molecular characterization of FLAs isolated from the intestinal microbiome of non-human primates (PNHs). For that, stool samples from PNHs were diluted, filtered and seeded on nonnutrient agar medium. Morphological analyzes were performed by direct observation in the inverted microscope and by Giemsa, Panotic® and Trichrome staining techniques. For the molecular identification of the isolates, the polymerase chain reaction (PCR) was used, followed by the sequencing reaction for the molecular target 18S rDNA, mitochondrial SSUrDNA, COI and ITS. 96 samples of PNHs were collected from the Non-Human Primate breeding service (SCPrim) of the Institute of Biomodel Science and Technology (ICTB, Fiocruz) and five samples of free-living Callithrix spp., from the FIOCRUZ Mata Atlântica Biological Station. Of the 101 stool samples analyzed, 46 were positive in the culture. The morphological analyzes revealed that 17 samples presented mainly cysts with polygonal and / or trophozoite shapes with projections, of the acantopodia type, representing a synapomorphy of the genus Acanthamoeba spp. The remaining samples presented rounded and / or trophozoite cysts with lobopod-type pseudopodia, three samples presented the flagellar shape, suggestive of the Naegleria spp. genus. The staining techniques, Panotic® staining show us to be simple, fast and efficient. Of the 46 positive samples, 28 were amplified by PCR for the 18S rDNA target specific to the genus Acanthamoeba spp. and 33 samples were amplified when using NA1 and NA2 (amplifies Vermamoeba spp. and Vanella spp). DNA sequencing revealed the presence of Acanthamoeba spp., T4 genotype in four samples and, in one sample, we identified Vermamoeba vermiformis. However, we were not successful in sequencing the other samples due to the presence of double peaks and short sequences. The results obtained show us remarkably an old enemy presenting new challenges. The presence of FLAs in the PNH intestine needs to be investigated, with potential relevance for future studies on intestinal homeostasis, mucosal immunology and pathogenic potential of FLAs and their intracellular organisms, which can be considered an emerging field of paramount importance for public health.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porAmoebaMicrobioma GastrointestinalPrimatasAmoeba isolamento & purificaçãoMicrobioma GastrointestinalPrimatasIsolamento e identificação de amebas de vida livre presentes no microbioma intestinal de primatas não humanosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2021Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Medicina Tropicalinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/49204/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINAL000247791.pdfapplication/pdf3102849https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/49204/2/000247791.pdfb48145dfe01328100a74b4cb11316f06MD52icict/492042021-09-29 20:02:16.161oai:www.arca.fiocruz.br:icict/49204Tk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352021-09-29T23:02:16Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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