Caracterização dos genes vp4, vp6, vp7 e nsp4 de rotavírus a em casos de gastroenterite aguda em crianças hospitalizadas no Rio de Janeiro, 1986-2004
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Data de Publicação: | 2006 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/37298 |
Resumo: | A primeira associação dos vírus como agentes etiológicos da gastroenterite foi feita em 1972 por Kapikian e colaboradores que, pela microscopia eletrônica, identificaram o vírus Norwalk e estabeleceram sua associação com a gastroenterite em jovens e adultos. Estudos posteriores revelaram a grande importância dos vírus na etiologia da diarréia, destacando-se entre eles, os Rotavírus humanos (RV). Os RV são transmitidos principalmente via fecal-oral e atualmente representam são um dos mais importantes agentes etiológicos da gastroenterite infantil aguda. A classificação dos RV é feita com base em estudos moleculares dos genes VP4 e VP7, que caracterizam os genótipos P e G, respectivamente. É utilizada a reação em cadeia pela polimerase precedida de transcrição reversa (RT-PCR) e reações de semi-nested PCR ou ainda o seqüenciamento de amplicons consensuais obtidos das regiões dos genes VP4 e VP7. Os genótipos P[8]G1, P[4]G2, P[8]G3 e P[8]G4 representam os mais comuns na maior parte do mundo, entretanto genes que codificam outras proteínas também estão sendo estudados a fim de se ampliar o conhecimento do papel de cada um destes no processo de infecção e estabelecimento da doença A proteína estrutural VP6 é a responsável pela definição de grupo e especificidade de subgrupo, sendo os RV do grupo A epidemiologicamente os mais importantes e os principais responsáveis pelos episódios de diarréia infantil aguda em todo mundo. A proteína não-estrutural NSP4 é uma glicoproteína que tem participação no processo de maturação dos RV e já foi proposta como enterotoxina viral. Essas características fazem das proteínas VP6 e NSP4 alvo de nosso estudo de seqüenciamento e análise filogenética, juntamente com as proteínas VP4 e VP7. Os dados a serem obtidos no estudo individual dessas proteínas podem esclarecer o perfil de infecção e gravidade da doença, trazendo informações úteis para o monitoramento de vacinas anti-RV. |
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Araújo, Irene TrigueirosLeite, José Paulo Gagliardi2019-11-22T15:19:11Z2019-11-22T15:19:11Z2006ARAÚJO, Irene Trigueiros. Caracterização dos genes vp4, vp6, vp7 e nsp4 de rotavírus a em casos de gastroenterite aguda em crianças hospitalizadas no Rio de Janeiro, 1986-2004. 2006. 83 f. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular)-Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2006.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/37298A primeira associação dos vírus como agentes etiológicos da gastroenterite foi feita em 1972 por Kapikian e colaboradores que, pela microscopia eletrônica, identificaram o vírus Norwalk e estabeleceram sua associação com a gastroenterite em jovens e adultos. Estudos posteriores revelaram a grande importância dos vírus na etiologia da diarréia, destacando-se entre eles, os Rotavírus humanos (RV). Os RV são transmitidos principalmente via fecal-oral e atualmente representam são um dos mais importantes agentes etiológicos da gastroenterite infantil aguda. A classificação dos RV é feita com base em estudos moleculares dos genes VP4 e VP7, que caracterizam os genótipos P e G, respectivamente. É utilizada a reação em cadeia pela polimerase precedida de transcrição reversa (RT-PCR) e reações de semi-nested PCR ou ainda o seqüenciamento de amplicons consensuais obtidos das regiões dos genes VP4 e VP7. Os genótipos P[8]G1, P[4]G2, P[8]G3 e P[8]G4 representam os mais comuns na maior parte do mundo, entretanto genes que codificam outras proteínas também estão sendo estudados a fim de se ampliar o conhecimento do papel de cada um destes no processo de infecção e estabelecimento da doença A proteína estrutural VP6 é a responsável pela definição de grupo e especificidade de subgrupo, sendo os RV do grupo A epidemiologicamente os mais importantes e os principais responsáveis pelos episódios de diarréia infantil aguda em todo mundo. A proteína não-estrutural NSP4 é uma glicoproteína que tem participação no processo de maturação dos RV e já foi proposta como enterotoxina viral. Essas características fazem das proteínas VP6 e NSP4 alvo de nosso estudo de seqüenciamento e análise filogenética, juntamente com as proteínas VP4 e VP7. Os dados a serem obtidos no estudo individual dessas proteínas podem esclarecer o perfil de infecção e gravidade da doença, trazendo informações úteis para o monitoramento de vacinas anti-RV.Group A Rotaviruses represent the main cause of acute gastroenteritis in children under five years old worldwide. Epidemiological surveys and molecular analysis of strains are required for gastroenteritis control and prevention. Thirty human rotavirus strains isolated in Rio de Janeiro from 1986-2004 comprising genotypes P8G1, P8G5, P8G9 and P4G2 were sequenced and analyzed for VP4, VP6, VP7 and NSP4 genes. Two distinct genetic groups could be recognized for the NSP4 gene, with G2 and non-G2 strains correlated to genotypes NSP4A-KUN and NSP4B-Wa, respectively. The VP6 analysis allowed subgrouping of strains and revealed that strains with SGI specificity were associated with NSP4A-KUN and strains with SGII specificity were associated with NSP4B-Wa. Analysis on the VP7 gene showed G1 strains within two lineages (G1-3 and G1-4); G2 strains within one lineage (G2-1); G5 strains clustered with other Brazilians G5 isolates and G9 strains within one lineage (G9-3). The VP4 gene analysis on P8 strains revealed two major genetic lineages, P8-2 and P8-3. This report describes an intragenotype diversity represented by lineages within rotavirus strains circulating in Rio de Janeiro. It will be important to continue molecular surveillance of rotavirus infections, particularly after introduction of vaccine in child population. These finding will help understand how rotavirus evolve and to measure how genetic diversity might affect the effectiveness of vaccination.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porRotavírusGastroenteriteGenotipoRotavírusGastroenteriteGenotipoCaracterização dos genes vp4, vp6, vp7 e nsp4 de rotavírus a em casos de gastroenterite aguda em crianças hospitalizadas no Rio de Janeiro, 1986-2004info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2006Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecularinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/37298/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALirene_araujo_ioc_dout_2006.pdfapplication/pdf1565381https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/37298/2/irene_araujo_ioc_dout_2006.pdf1db7625fab93d844c77ae8b97ccd3faeMD52TEXTirene_araujo_ioc_dout_2006.pdf.txtirene_araujo_ioc_dout_2006.pdf.txtExtracted texttext/plain160701https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/37298/3/irene_araujo_ioc_dout_2006.pdf.txtc5a7d391cc2dd402a03d1e06ec623cd6MD53icict/372982019-11-23 02:02:58.099oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-11-23T05:02:58Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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