Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sejas, Claudia Gladys Flores
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/54401
Resumo: Klebsiella pneumoniae, uma das principais causas de infecções hospitalares é considerada patógeno oportunista, causador de vários tipos de infecções, principalmente em indivíduos hospitalizados. A incidência de K. pneumoniae resistente aos carbapenêmicos (KPRC) tem aumentado em todo o mundo, tornandose uma ameaça à saúde pública. Desta forma, a busca de pacientes colonizados e/ou infectados através de cultura de vigilância ativa tem sido adotada como medida de prevenção e controle da disseminação da resistência. O objetivo desse estudo foi a determinação da diversidade clonal, associada aos perfis genéticos de resistência aos carbapenêmicos em isolados de culturas de vigilância ativa, de um hospital no Rio de Janeiro. Para isso, foi realizado: a) identificação de KPRC de pacientes admitidos em UTI; b) pesquisa de genes de resistência; c) estabelecimento de relações clonais pelo ERIC-PCR; d) avaliação da diversidade genética de K. pneumoniae carreando blaNDM por MLST. Dos 108 isolados identificados como K. pneumoniae pelo VITEK II, 103 foram confirmados pela PCR. Todos os isolados (103/103) foram resistentes aos β-lactâmicos testados, 94% (97/103) à ciprofloxacina, 84 % (87/103) à tigeciclina, 77% (79/103) à gentamicina, 62% (64/103) à amicacina e 35% (36/103) à colistina. O gene blaKPC foi encontrado em 89% (92/103) dos isolados, blaOXA-48 em 37% (38/103), mcr-1 em 23% (18/103), blaVIM e blaNDM em 11% (11/103), blaBKC em apenas um isolado, blaIMP e blaSPM não foram encontrados e dois isolados foram negativos para todos os genes. O ERICPCR resultou em 83 perfis genéticos e 7 possíveis grupos clonais com percentual de identidade acima de 80%. Onze isolados blaNDM positivos foram agrupados em três perfis de resistência e quatro genótipos de resistência. A análise genotípica revelou 11 STs diferentes, sendo 8 novos e 3 descritos e dois complexos clonais (CC258 e CC15). No presente estudo, relatamos, pela primeira vez K. pneumoniae de culturas de vigilância carreando blaNDM, KPC, OXA-48 e VIM, pertencentes ao ST515. Os dados aqui apresentados nos permitem concluir que a abordagem de cultura de vigilância ativa deve ser considerada essencial no combate da resistência antimicrobiana no ambiente hospitalar
id CRUZ_85d6cf62d2ca99fdcd91e526b4f69e6a
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/54401
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Sejas, Claudia Gladys FloresRomão, Célia Maria Carvalho Pereira AraújoClementino, Maysa Beatriz Mandetta2022-08-04T11:54:08Z2022-08-04T11:54:08Z2020SEJAS, Claudia Gladys Flores. Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro. 2020. 131f. Tese, (Doutorado)-Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2020.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/54401Klebsiella pneumoniae, uma das principais causas de infecções hospitalares é considerada patógeno oportunista, causador de vários tipos de infecções, principalmente em indivíduos hospitalizados. A incidência de K. pneumoniae resistente aos carbapenêmicos (KPRC) tem aumentado em todo o mundo, tornandose uma ameaça à saúde pública. Desta forma, a busca de pacientes colonizados e/ou infectados através de cultura de vigilância ativa tem sido adotada como medida de prevenção e controle da disseminação da resistência. O objetivo desse estudo foi a determinação da diversidade clonal, associada aos perfis genéticos de resistência aos carbapenêmicos em isolados de culturas de vigilância ativa, de um hospital no Rio de Janeiro. Para isso, foi realizado: a) identificação de KPRC de pacientes admitidos em UTI; b) pesquisa de genes de resistência; c) estabelecimento de relações clonais pelo ERIC-PCR; d) avaliação da diversidade genética de K. pneumoniae carreando blaNDM por MLST. Dos 108 isolados identificados como K. pneumoniae pelo VITEK II, 103 foram confirmados pela PCR. Todos os isolados (103/103) foram resistentes aos β-lactâmicos testados, 94% (97/103) à ciprofloxacina, 84 % (87/103) à tigeciclina, 77% (79/103) à gentamicina, 62% (64/103) à amicacina e 35% (36/103) à colistina. O gene blaKPC foi encontrado em 89% (92/103) dos isolados, blaOXA-48 em 37% (38/103), mcr-1 em 23% (18/103), blaVIM e blaNDM em 11% (11/103), blaBKC em apenas um isolado, blaIMP e blaSPM não foram encontrados e dois isolados foram negativos para todos os genes. O ERICPCR resultou em 83 perfis genéticos e 7 possíveis grupos clonais com percentual de identidade acima de 80%. Onze isolados blaNDM positivos foram agrupados em três perfis de resistência e quatro genótipos de resistência. A análise genotípica revelou 11 STs diferentes, sendo 8 novos e 3 descritos e dois complexos clonais (CC258 e CC15). No presente estudo, relatamos, pela primeira vez K. pneumoniae de culturas de vigilância carreando blaNDM, KPC, OXA-48 e VIM, pertencentes ao ST515. Os dados aqui apresentados nos permitem concluir que a abordagem de cultura de vigilância ativa deve ser considerada essencial no combate da resistência antimicrobiana no ambiente hospitalarFundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porRelações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2020Instituto Nacional de Controle de Qualidade em SaúdeFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Vigilância SanitáriaKlebsiella pneumoniaeCarbapenêmicosGenótipoTécnicas de Genotipageminfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/54401/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINAL2020_tese_claudia-sejas.pdfapplication/pdf855028https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/54401/2/2020_tese_claudia-sejas.pdf86095fdbbcdddb8a6eda79e5527c097fMD52icict/544012022-08-04 08:54:08.988oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352022-08-04T11:54:08Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro
title Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro
spellingShingle Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro
Sejas, Claudia Gladys Flores
Klebsiella pneumoniae
Carbapenêmicos
Genótipo
Técnicas de Genotipagem
title_short Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro
title_full Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro
title_fullStr Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro
title_full_unstemmed Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro
title_sort Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro
author Sejas, Claudia Gladys Flores
author_facet Sejas, Claudia Gladys Flores
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Sejas, Claudia Gladys Flores
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Romão, Célia Maria Carvalho Pereira Araújo
Clementino, Maysa Beatriz Mandetta
contributor_str_mv Romão, Célia Maria Carvalho Pereira Araújo
Clementino, Maysa Beatriz Mandetta
dc.subject.decs.pt_BR.fl_str_mv Klebsiella pneumoniae
Carbapenêmicos
Genótipo
Técnicas de Genotipagem
topic Klebsiella pneumoniae
Carbapenêmicos
Genótipo
Técnicas de Genotipagem
description Klebsiella pneumoniae, uma das principais causas de infecções hospitalares é considerada patógeno oportunista, causador de vários tipos de infecções, principalmente em indivíduos hospitalizados. A incidência de K. pneumoniae resistente aos carbapenêmicos (KPRC) tem aumentado em todo o mundo, tornandose uma ameaça à saúde pública. Desta forma, a busca de pacientes colonizados e/ou infectados através de cultura de vigilância ativa tem sido adotada como medida de prevenção e controle da disseminação da resistência. O objetivo desse estudo foi a determinação da diversidade clonal, associada aos perfis genéticos de resistência aos carbapenêmicos em isolados de culturas de vigilância ativa, de um hospital no Rio de Janeiro. Para isso, foi realizado: a) identificação de KPRC de pacientes admitidos em UTI; b) pesquisa de genes de resistência; c) estabelecimento de relações clonais pelo ERIC-PCR; d) avaliação da diversidade genética de K. pneumoniae carreando blaNDM por MLST. Dos 108 isolados identificados como K. pneumoniae pelo VITEK II, 103 foram confirmados pela PCR. Todos os isolados (103/103) foram resistentes aos β-lactâmicos testados, 94% (97/103) à ciprofloxacina, 84 % (87/103) à tigeciclina, 77% (79/103) à gentamicina, 62% (64/103) à amicacina e 35% (36/103) à colistina. O gene blaKPC foi encontrado em 89% (92/103) dos isolados, blaOXA-48 em 37% (38/103), mcr-1 em 23% (18/103), blaVIM e blaNDM em 11% (11/103), blaBKC em apenas um isolado, blaIMP e blaSPM não foram encontrados e dois isolados foram negativos para todos os genes. O ERICPCR resultou em 83 perfis genéticos e 7 possíveis grupos clonais com percentual de identidade acima de 80%. Onze isolados blaNDM positivos foram agrupados em três perfis de resistência e quatro genótipos de resistência. A análise genotípica revelou 11 STs diferentes, sendo 8 novos e 3 descritos e dois complexos clonais (CC258 e CC15). No presente estudo, relatamos, pela primeira vez K. pneumoniae de culturas de vigilância carreando blaNDM, KPC, OXA-48 e VIM, pertencentes ao ST515. Os dados aqui apresentados nos permitem concluir que a abordagem de cultura de vigilância ativa deve ser considerada essencial no combate da resistência antimicrobiana no ambiente hospitalar
publishDate 2020
dc.date.issued.fl_str_mv 2020
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-08-04T11:54:08Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-08-04T11:54:08Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SEJAS, Claudia Gladys Flores. Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro. 2020. 131f. Tese, (Doutorado)-Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2020.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/54401
identifier_str_mv SEJAS, Claudia Gladys Flores. Relações clonais e genótipos de resistência de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos em culturas de vigilância ativa no Rio de Janeiro. 2020. 131f. Tese, (Doutorado)-Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2020.
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/54401
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/54401/1/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/54401/2/2020_tese_claudia-sejas.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
86095fdbbcdddb8a6eda79e5527c097f
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1798324865238827008