Genomic epidemiology of the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil
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Data de Publicação: | 2022 |
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Tipo de documento: | Artigo |
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Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/55792 https://doi.org/10.1038/s41564-022-01191-z |
Resumo: | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Department of Science and Technology for Humans and the Environment. University of Campus Bio-Medico di Roma. Rome, Italy. |
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Giovanetti, MartaSlavov, Svetoslav NanevFonseca, VagnerWilkinson, EduanTegally, HouriiyahPatané, José Salvatore LeisterViala, Vincent LouisSan, Emmanuel JamesRodrigues, Evandra StrazzaSantos, Elaine VieiraAburjaile, FlaviaXavier, JoilsonFritsch, HeggerAdelino, Talita Emile RibeiroPereira, FelicidadeLeal, ArabelaIani, Felipe Campos de MeloPereira, Glauco de CarvalhoVazquez, CynthiaSanabria, Gladys Mercedes EstigarribiaOliveira, Elaine Cristina deDemarchi, LuizCroda, JulioBezerra, Rafael dos SantosLima, Loyze Paola Oliveira deMartins, Antonio JorgeBarros, Claudia Renata dos SantosMarqueze, Elaine CristinaBernardino, Jardelina de Souza TodaoMoretti, Debora BotequioBrassaloti, Ricardo AugustoCassano, Raquel de Lello Rocha CamposMariani, Pilar Drummond Sampaio CorrêaKitajima, João PauloSantos, BibianaProto-Siqueira, RodrigoCantarelli, Vlademir VicenteTosta, StephaneNardy, Vanessa BrandãoSilva, Luciana Reboredo de Oliveira daGómez, Marcela Kelly AsteteLima, Jaqueline GomesRibeiro, Adriana AparecidaGuimarães, Natália RochaWatanabe, Luiz TakaoSilva, Luana Barbosa daFerreira, Raquel da SilvaPenha, Mara Patricia F. daOrtega, María JoséFuente, Andrea Gómez de laVillalba, ShirleyTorales, JuanGamarra, María LizAquino, CarolinaFigueredo, Gloria Patricia MartínezFava, Wellington SantosMotta-Castro, Ana Rita C.Venturini, JamesOliveira, Sandra Maria do Vale Leone deGonçalves, Crhistinne Cavalheiro MaymoneRossa, Maria do Carmo DeburBecker, Guilherme NardiGiacomini, Mayra PresibellaMarques, Nelson QuallioRiediger, Irina NastassjaRaboni, SoniaMattoso, GabrielaCataneo, Allan Henrique DepieriZanluca, CamilaSantos, Claudia Nunes Duarte dosAssato, Patricia AkemiCosta, Felipe Allan da Silva daPoleti, Mirele DaianaLesbon, Jessika Cristina ChagasMattos, Elisangela ChicaroniBanho, Cecilia ArticoSacchetto, LíviaMoraes, Marília MazziGrotto, Rejane Maria TommasiniSouza-Neto, Jayme A.Nogueira, Maurício LacerdaFukumasu, HeidgeCoutinho, Luiz LehmannCalado, Rodrigo TocantinsMachado Neto, RaulFilippis, Ana Maria Bispo deCunha, Rivaldo Venancio daFreitas, CarlaPeterka, Cassio Roberto LeonelFernandes, Cássia de Fátima RangelNavegantes, WildoSaid, Rodrigo Fabiano do CarmoMelo, Carlos F. Campelo de A eAlmiron, MariaLourenço, JoséOliveira, Tulio deHolmes, Edward C.Haddad, RicardoSampaio, Sandra CoccuzzoElias, Maria CarolinaKashima, SimoneAlcantara, Luiz Carlos Junior deCovas, Dimas Tadeu2022-11-25T13:56:04Z2022-11-25T13:56:04Z2022GIOVANETTI, Marta et al. Genomic epidemiology of the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil. Nature Microbiology, v. 7, p. 1490–1500, 2022.2058-5276https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/55792https://doi.org/10.1038/s41564-022-01191-zporNatureCOVID-19PandemicsLatin AmericaAmérica LatinaSARS-CoV-2PandemiasAmérica LatinaGenomic epidemiology of the SARS-CoV-2 epidemic in Brazilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Department of Science and Technology for Humans and the Environment. University of Campus Bio-Medico di Roma. Rome, Italy.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. / Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Pan American Health Organization (PAHO)/World Health Organization (WHO), Brasilia, Distrito Federal, Brazil / Centre for Epidemic Response and Innovation. School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. University of KwaZulu–Natal. Durban, South Africa.Centre for Epidemic Response and Innovation. School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. University of KwaZulu–Natal. Durban, South Africa.Centre for Epidemic Response and Innovation. School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. University of KwaZulu–Natal. Durban, South Africa.Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.Centre for Epidemic Response and Innovation. School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. University of KwaZulu–Natal. Durban, South Africa.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Bahia. Salvador, BA, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Bahia. Salvador, BA, Brasil.Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.Laboratório Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.Laboratório Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay / Instituto Regional de Investigación em Salud. Universidad Nacional del Caaguazú. Caaguazú, Paraguay / Laboratório de Biología Molecular. Hospital Regional de Coronel Oviedo. Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social. Asunción, Paraguay.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso. 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Rio Grande do Sul, Pelotas, Brasil.Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre / Universidade Feevale / Grupo Exame Laboratórios. Rio Grande do Sul, RS, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Bahia. Salvador, BA, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Bahia. Salvador, BA, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Bahia. Salvador, BA, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Bahia. Salvador, BA, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Bahia. Salvador, BA, Brasil.Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.Vigilância em Saúde do Estado de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.Laboratório Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.Laboratório Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.Laboratório Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.Laboratório Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.Laboratório Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.Laboratório Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.Laboratório Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay / Instituto Regional de Investigación em Salud. Universidad Nacional del Caaguazú. Caaguazú, Paraguay / Laboratório de Biología Molecular. Hospital Regional de Coronel Oviedo. Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social. Asunción, Paraguay.Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.Secretaria de Saúde do Estado do Mato Grosso do Sul. MS, Brasil.Laboratório de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil.Laboratório de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil.Laboratório de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil.Laboratório de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil.Laboratório de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil.Universidade Federal do Paraná. Hospital das Clínicas. Curitiba, PR, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil.Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil.Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil.Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil.Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil.Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil / Universidade Estadual de São Paulo. Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu. Laboratório de Biotecnologia Aplicada, Laboratório de Biologia Molecular. Botucatu, SP, Brasil.Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil.Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral de Arboviroses. Brasília, DF, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Departamento de Imunização e Doenças Transmissíveis. Brasília, DF, Brasil.Pan American Health Organization (PAHO)/World Health Organization (WHO), Brasilia, Distrito Federal, Brazil.Pan American Health Organization (PAHO)/World Health Organization (WHO), Brasilia, Distrito Federal, Brazil.Pan American Health Organization (PAHO)/World Health Organization (WHO), Brasilia, Distrito Federal, Brazil.Pan American Health Organization (PAHO)/World Health Organization (WHO), Brasilia, Distrito Federal, Brazil.Department of Zoology. University of Oxford. Oxford, UK / Universidade de Lisboa. Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas. Lisboa, PT, Portugal.Centre for Epidemic Response and Innovation. School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. University of KwaZulu–Natal. Durban, South Africa / Centre for the AIDS Programme of Research in South Africa. Durban, South Africa. / Department of Global Health. University of Washington. Seattle, WA, USA.Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity. School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences. University of Sydney. Sydney, New South Wales, Australia.Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil./ Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. / Instituto Butantan. 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Slavov, Svetoslav Nanev Fonseca, Vagner Wilkinson, Eduan Tegally, Houriiyah Patané, José Salvatore Leister Viala, Vincent Louis San, Emmanuel James Rodrigues, Evandra Strazza Santos, Elaine Vieira Aburjaile, Flavia Xavier, Joilson Fritsch, Hegger Adelino, Talita Emile Ribeiro Pereira, Felicidade Leal, Arabela Iani, Felipe Campos de Melo Pereira, Glauco de Carvalho Vazquez, Cynthia Sanabria, Gladys Mercedes Estigarribia Oliveira, Elaine Cristina de Demarchi, Luiz Croda, Julio Bezerra, Rafael dos Santos Lima, Loyze Paola Oliveira de Martins, Antonio Jorge Barros, Claudia Renata dos Santos Marqueze, Elaine Cristina Bernardino, Jardelina de Souza Todao Moretti, Debora Botequio Brassaloti, Ricardo Augusto Cassano, Raquel de Lello Rocha Campos Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa Kitajima, João Paulo Santos, Bibiana Proto-Siqueira, Rodrigo Cantarelli, Vlademir Vicente Tosta, Stephane Nardy, Vanessa Brandão Silva, Luciana Reboredo de Oliveira da Gómez, Marcela Kelly Astete Lima, Jaqueline Gomes Ribeiro, Adriana Aparecida Guimarães, Natália Rocha Watanabe, Luiz Takao Silva, Luana Barbosa da Ferreira, Raquel da Silva Penha, Mara Patricia F. da Ortega, María José Fuente, Andrea Gómez de la Villalba, Shirley Torales, Juan Gamarra, María Liz Aquino, Carolina Figueredo, Gloria Patricia Martínez Fava, Wellington Santos Motta-Castro, Ana Rita C. Venturini, James Oliveira, Sandra Maria do Vale Leone de Gonçalves, Crhistinne Cavalheiro Maymone Rossa, Maria do Carmo Debur Becker, Guilherme Nardi Giacomini, Mayra Presibella Marques, Nelson Quallio Riediger, Irina Nastassja Raboni, Sonia Mattoso, Gabriela Cataneo, Allan Henrique Depieri Zanluca, Camila Santos, Claudia Nunes Duarte dos Assato, Patricia Akemi Costa, Felipe Allan da Silva da Poleti, Mirele Daiana Lesbon, Jessika Cristina Chagas Mattos, Elisangela Chicaroni Banho, Cecilia Artico Sacchetto, Lívia Moraes, Marília Mazzi Grotto, Rejane Maria Tommasini Souza-Neto, Jayme A. Nogueira, Maurício Lacerda Fukumasu, Heidge Coutinho, Luiz Lehmann Calado, Rodrigo Tocantins Machado Neto, Raul Filippis, Ana Maria Bispo de Cunha, Rivaldo Venancio da Freitas, Carla Peterka, Cassio Roberto Leonel Fernandes, Cássia de Fátima Rangel Navegantes, Wildo Said, Rodrigo Fabiano do Carmo Melo, Carlos F. Campelo de A e Almiron, Maria Lourenço, José Oliveira, Tulio de Holmes, Edward C. Haddad, Ricardo Sampaio, Sandra Coccuzzo Elias, Maria Carolina Kashima, Simone Alcantara, Luiz Carlos Junior de Covas, Dimas Tadeu |
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Giovanetti, Marta Slavov, Svetoslav Nanev Fonseca, Vagner Wilkinson, Eduan Tegally, Houriiyah Patané, José Salvatore Leister Viala, Vincent Louis San, Emmanuel James Rodrigues, Evandra Strazza Santos, Elaine Vieira Aburjaile, Flavia Xavier, Joilson Fritsch, Hegger Adelino, Talita Emile Ribeiro Pereira, Felicidade Leal, Arabela Iani, Felipe Campos de Melo Pereira, Glauco de Carvalho Vazquez, Cynthia Sanabria, Gladys Mercedes Estigarribia Oliveira, Elaine Cristina de Demarchi, Luiz Croda, Julio Bezerra, Rafael dos Santos Lima, Loyze Paola Oliveira de Martins, Antonio Jorge Barros, Claudia Renata dos Santos Marqueze, Elaine Cristina Bernardino, Jardelina de Souza Todao Moretti, Debora Botequio Brassaloti, Ricardo Augusto Cassano, Raquel de Lello Rocha Campos Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa Kitajima, João Paulo Santos, Bibiana Proto-Siqueira, Rodrigo Cantarelli, Vlademir Vicente Tosta, Stephane Nardy, Vanessa Brandão Silva, Luciana Reboredo de Oliveira da Gómez, Marcela Kelly Astete Lima, Jaqueline Gomes Ribeiro, Adriana Aparecida Guimarães, Natália Rocha Watanabe, Luiz Takao Silva, Luana Barbosa da Ferreira, Raquel da Silva Penha, Mara Patricia F. da Ortega, María José Fuente, Andrea Gómez de la Villalba, Shirley Torales, Juan Gamarra, María Liz Aquino, Carolina Figueredo, Gloria Patricia Martínez Fava, Wellington Santos Motta-Castro, Ana Rita C. Venturini, James Oliveira, Sandra Maria do Vale Leone de Gonçalves, Crhistinne Cavalheiro Maymone Rossa, Maria do Carmo Debur Becker, Guilherme Nardi Giacomini, Mayra Presibella Marques, Nelson Quallio Riediger, Irina Nastassja Raboni, Sonia Mattoso, Gabriela Cataneo, Allan Henrique Depieri Zanluca, Camila Santos, Claudia Nunes Duarte dos Assato, Patricia Akemi Costa, Felipe Allan da Silva da Poleti, Mirele Daiana Lesbon, Jessika Cristina Chagas Mattos, Elisangela Chicaroni Banho, Cecilia Artico Sacchetto, Lívia Moraes, Marília Mazzi Grotto, Rejane Maria Tommasini Souza-Neto, Jayme A. Nogueira, Maurício Lacerda Fukumasu, Heidge Coutinho, Luiz Lehmann Calado, Rodrigo Tocantins Machado Neto, Raul Filippis, Ana Maria Bispo de Cunha, Rivaldo Venancio da Freitas, Carla Peterka, Cassio Roberto Leonel Fernandes, Cássia de Fátima Rangel Navegantes, Wildo Said, Rodrigo Fabiano do Carmo Melo, Carlos F. Campelo de A e Almiron, Maria Lourenço, José Oliveira, Tulio de Holmes, Edward C. Haddad, Ricardo Sampaio, Sandra Coccuzzo Elias, Maria Carolina Kashima, Simone Alcantara, Luiz Carlos Junior de Covas, Dimas Tadeu |
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