Estudo da diminuição da sensibilidade à Polimixina B em isolados clínicos de Acinetobacter baumannii geneticamente relacionados

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Lilian Caroliny Amorim
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60601
Resumo: A emergência da resistência a quase todos os antimicrobianos disponíveis entre isolados clínicos de Acinetobacter baumannii representa um desafio para o manejo de pacientes hospitalizados, sendo as polimixinas muitas vezes a última opção terapêutica contra infecções por esses patógenos oportunistas. No entanto, a resistência às polimixinas, anteriormente pouco relatada, vem sendo observada após o seu crescente uso na prática clínica e os mecanismos de resistência a este composto não foram completamente elucidados. O objetivo do presente estudo foi investigar os aspectos da heterorresistência e resposta adaptativa à polimixina B de isolados clínicos de A. baumannii intimamente relacionados epidemiologicamente, exibindo distinto perfil de susceptibilidade à polimixina. Para isso, foram realizadas análises que incluem curvas de crescimento e morte bacteriana sob diferentes condições laboratoriais e a análise dos perfis genômico e transcriptômico dos isolados avaliados. Os resultados demonstraram diferenças no fenótipo de resistência à Polimixina B entre as duas cepas clínicas estudadas, no entanto, o padrão de crescimento em condições normais ou de estresse bacteriano não diferiram entre as cepas sensível e resistente à polimixina. A análise genômica não demonstrou a presença de nenhum gene ou modificação relacionada a resistência à polimixina na cepa resistente, além disso, foi possível observar que ambos os isolados possuem os genomas idênticos, sem nenhuma diferença em sua sequência que possa justificar a discrepância no perfil de suspeptibilidade. A análise transcriptômica foi realizada comparando as cepas sob diferentes condições de cultivo, na presença e ausência de polimixina, os resultados demonstraram vários genes diferencialmente expressos, envolvidos em diferentes vias biológicas, sendo em sua maioria proteínas responsáveis pela resposta a estresses e exposição à antibióticos, tais como os membros de bombas de efluxo MacA, MprA, EmrAB, EmrKY, YbhRS, AcrA, a proteína ribossômica RpmG e as topoisomerases tipo IV BacA e ParE. Os resultados reunidos neste trabalho sugerem diferentes vias pouco estudadas que podem desempenhar papéis importantes na resistência à polimixina em A. baumannii e destacam que a análise da expressão gênica em cepas resistentes à antibióticos pode revelar possíveis alvos no desenvolvimento de novos estudos com foco no combate à bactérias resistentes à múltiplas drogas.
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No entanto, a resistência às polimixinas, anteriormente pouco relatada, vem sendo observada após o seu crescente uso na prática clínica e os mecanismos de resistência a este composto não foram completamente elucidados. O objetivo do presente estudo foi investigar os aspectos da heterorresistência e resposta adaptativa à polimixina B de isolados clínicos de A. baumannii intimamente relacionados epidemiologicamente, exibindo distinto perfil de susceptibilidade à polimixina. Para isso, foram realizadas análises que incluem curvas de crescimento e morte bacteriana sob diferentes condições laboratoriais e a análise dos perfis genômico e transcriptômico dos isolados avaliados. Os resultados demonstraram diferenças no fenótipo de resistência à Polimixina B entre as duas cepas clínicas estudadas, no entanto, o padrão de crescimento em condições normais ou de estresse bacteriano não diferiram entre as cepas sensível e resistente à polimixina. A análise genômica não demonstrou a presença de nenhum gene ou modificação relacionada a resistência à polimixina na cepa resistente, além disso, foi possível observar que ambos os isolados possuem os genomas idênticos, sem nenhuma diferença em sua sequência que possa justificar a discrepância no perfil de suspeptibilidade. A análise transcriptômica foi realizada comparando as cepas sob diferentes condições de cultivo, na presença e ausência de polimixina, os resultados demonstraram vários genes diferencialmente expressos, envolvidos em diferentes vias biológicas, sendo em sua maioria proteínas responsáveis pela resposta a estresses e exposição à antibióticos, tais como os membros de bombas de efluxo MacA, MprA, EmrAB, EmrKY, YbhRS, AcrA, a proteína ribossômica RpmG e as topoisomerases tipo IV BacA e ParE. Os resultados reunidos neste trabalho sugerem diferentes vias pouco estudadas que podem desempenhar papéis importantes na resistência à polimixina em A. baumannii e destacam que a análise da expressão gênica em cepas resistentes à antibióticos pode revelar possíveis alvos no desenvolvimento de novos estudos com foco no combate à bactérias resistentes à múltiplas drogas.The emergence of resistance to almost all available antimicrobials among clinical isolates of Acinetobacter baumannii represents a challenge for the management of hospitalized patients, with polymyxins often being the last therapeutic option against infections by these opportunistic pathogens. However, resistance to polymyxins, previously little reported, has been observed after its increasing use in clinical practice and the mechanisms of resistance to this compound have not been fully elucidated. The aim of the present study was to investigate aspects of heteroresistance and adaptive response to polymyxin B in closely related epidemiologically related clinical isolates of A. baumannii, exhibiting a distinct profile of sensitivity to polymyxin. For this, analyzes were performed that include bacterial growth and death curves under different laboratory conditions and the analysis of the genomic and transcriptomic profiles of the evaluated isolates. The results showed differences in the Polymyxin B resistance phenotype between the two clinical strains studied, however, the growth pattern under normal or bacterial stress conditions did not differ between the strains sensitive and resistant to polymyxin. The genomic analysis did not demonstrate the presence of any gene or modification related to polymyxin resistance in the resistant strain, in addition, it was possible to observe that both isolates have identical genomes, with no difference in their sequence that could justify the discrepancy in the profile of sensitivity. The transcriptomic analysis was performed comparing the strains under different culture conditions, in the presence and absence of polymyxin, the results showed a range of differentially expressed genes, involved in different biological pathways, being mostly proteins responsible for the response to stress and exposure to antibiotics, such as the efflux pump members MacA, MprA, EmrAB, EmrKY, YbhRS, AcrA, the ribosomal protein RpmG and the type IV topoisomerases BacA and ParE. The results gathered in this work suggest different understudied pathways that may play important roles in polymyxin resistance in A. baumannii and highlight that the analysis of gene expression in antibiotic-resistant strains may reveal possible targets in the development of new studies focused on combating this multidrug resistant bacteria.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.Universidade Federal do Rio Grande do Norte. Natal, RN, Brasil.Universidade Federal da Paraíba. João Pessoa, PB, Brasil.porResistência à drogasAcinetobacter baumanniiPolimixinasAntibióticosRNA-seqDrug resistanceAcinetobacter baumanniiPolymyxinsAntibioticsRNA-seqResistencia a las drogasAcinetobacter baumanniipolimixinasantibióticossecuencia de ARNLa résistance aux médicamentsAcinetobacter baumanniiPolymyxinesAntibiotiquesSéquence d'ARNEstudo da diminuição da sensibilidade à Polimixina B em isolados clínicos de Acinetobacter baumannii geneticamente relacionadosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2022-07-27Instituto Aggeu MagalhãesRecifePrograma de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia em Saúdeinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALlilian_silva_iam_dout_2022.pdflilian_silva_iam_dout_2022.pdfapplication/pdf3797711https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/60601/2/lilian_silva_iam_dout_2022.pdf14567108cf95d9198ba2308bee2481b9MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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