Estabelecimento de uma RT-qPCR multiplex, capaz de realizar o diagnóstico, diferencial, dos arbovírus Chikungunya X Mayaro

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Celerino, Tarciana Fernanda da Silva
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/59898
Resumo: As arboviroses constituem um importante problema de saúde pública mundial, responsáveis por milhares de infecções anualmente. O Brasil, assim como outros países de clima tropical, apresenta condições favoráveis para a manutenção e disseminação de seus agentes infecciosos, devido a sua vasta diversidade ambiental e animal. Esses fatores também contribuem para a facilidade de adaptação de seus vetores, alguns destes capazes de transmitir mais de um patógeno. A similaridade clínica entre as infecções, principalmente quando ocasionadas por arbovírus pertencentes a mesma família, representa um grande desafio para os sistemas de saúde. Os vírus Chikungunya (CHIKV) e Mayaro (MAYV), ambos Alphavirus, da família Togaviridae, possuem características clínicas relevantes, sendo capazes de deixar o indivíduo portador da infecção debilitado por meses e até anos, muitas vezes incapacitados de desenvolverem sequer as suas atividades diárias normalmente, devido a artralgia severa, gerando impactos econômicos significativos. Por estarem sintomatologicamente relacionados, estes arbovírus são frequentemente confundidos entre si, havendo a necessidade de diagnósticos diferenciais entre eles. Este trabalho teve por objetivo, estabelecer um protocolo de diagnóstico molecular (através da técnica de RT-qPCR) para diferenciar CHIKV e MAYV em uma única reação, visando permitir o diagnóstico diferencial dessas doenças para os serviços de saúde. O ensaio duplex para o diagnóstico diferencial do CHIKV X MAYV demonstrou uma boa performance para o diagnóstico do CHIKV, ao ser comparado com o ensaio simples de CHIKV, já estabelecido. O limite de detecção apresentou resultados similares aos encontrados na literatura, com parâmetros de eficiência ainda superiores. Por outro lado, para detecção do MAYV, o ensaio não demonstrou eficiência aceitável. Ajustes precisam ser realizados, buscando a melhor performance. O diagnóstico preciso destas infecções tem ainda a finalidade de melhorar a qualidade das notificações, evitando subnotificação ou notificações errôneas, servindo inclusive de suporte para inquéritos epidemiológicos.
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A similaridade clínica entre as infecções, principalmente quando ocasionadas por arbovírus pertencentes a mesma família, representa um grande desafio para os sistemas de saúde. Os vírus Chikungunya (CHIKV) e Mayaro (MAYV), ambos Alphavirus, da família Togaviridae, possuem características clínicas relevantes, sendo capazes de deixar o indivíduo portador da infecção debilitado por meses e até anos, muitas vezes incapacitados de desenvolverem sequer as suas atividades diárias normalmente, devido a artralgia severa, gerando impactos econômicos significativos. Por estarem sintomatologicamente relacionados, estes arbovírus são frequentemente confundidos entre si, havendo a necessidade de diagnósticos diferenciais entre eles. Este trabalho teve por objetivo, estabelecer um protocolo de diagnóstico molecular (através da técnica de RT-qPCR) para diferenciar CHIKV e MAYV em uma única reação, visando permitir o diagnóstico diferencial dessas doenças para os serviços de saúde. O ensaio duplex para o diagnóstico diferencial do CHIKV X MAYV demonstrou uma boa performance para o diagnóstico do CHIKV, ao ser comparado com o ensaio simples de CHIKV, já estabelecido. O limite de detecção apresentou resultados similares aos encontrados na literatura, com parâmetros de eficiência ainda superiores. Por outro lado, para detecção do MAYV, o ensaio não demonstrou eficiência aceitável. Ajustes precisam ser realizados, buscando a melhor performance. O diagnóstico preciso destas infecções tem ainda a finalidade de melhorar a qualidade das notificações, evitando subnotificação ou notificações errôneas, servindo inclusive de suporte para inquéritos epidemiológicos.Arboviruses are an important public health problem worldwide, responsible for thousands of infections annually. Brazil, like other tropical countries, has favorable conditions for the maintenance and dissemination of its infectious agents, due to its vast environmental and animal diversity. These factors also contribute to the ease of adaptation of their vectors, some of which are capable of transmitting more than one pathogen. The clinical similarity between infections, especially when caused by arboviruses belonging to the same family, represents a major challenge for health systems. The Chikungunya (CHIKV) and Mayaro (MAYV) viruses, both Alphavirus, from the Togaviridae family, have relevant clinical characteristics, being able to leave the infected individual debilitated for months and even years, often unable to perform even their daily activities, usually due to severe arthralgia, generating significant economic impacts. Because they are symptomatically related, these arboviruses are often confused with each other, requiring differential diagnoses between them. This study aimed to establish a molecular diagnosis protocol (through the RT-qPCR technique) to differentiate CHIKV and MAYV in a single reaction, aiming to allow the differential diagnosis of these diseases for health services. The duplex assay for the differential diagnosis of CHIKV X MAYV demonstrated a good performance for the diagnosis of CHIKV, when compared with the simple assay of CHIKV, already established. The detection limit presented results similar to those found in the literature, with even higher efficiency parameters. On the other hand, for the detection of MAYV, the assay did not demonstrate acceptable efficiency. Adjustments need to be made, seeking the best performance. The accurate diagnosis of these infections also aims to improve the quality of notifications, avoiding underreporting or erroneous notifications, even serving as support for epidemiological surveys.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.porAlphavirusFebre de ChikungunyaInfecções por alphavirusReação em cadeia da polimeraseTécnicas de diagnóstico molecularAlphaviruschikungunya feveralphavirus infectionspolymerase chain reactionMolecular diagnostic techniquesAlfavirusfiebre chikungunyainfecciones por alfavirusreacción en cadena de la polimerasaTécnicas de diagnóstico molecularAlphavirusfièvre chikungunyainfections à alphavirusréaction en chaîne par polyméraseTechniques de diagnostic moléculaireReação em Cadeia da Polimerase via Transcriptase ReversaReação em Cadeia da Polimerase MultiplexInfecções por AlphavirusFebre de ChikungunyaAlphavirusVírus ChikungunyaSensibilidade e EspecificidadeDiagnóstico DiferencialTécnicas de Diagnóstico MolecularLimite de DetecçãoEstabelecimento de uma RT-qPCR multiplex, capaz de realizar o diagnóstico, diferencial, dos arbovírus Chikungunya X Mayaroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2022-10-07Instituto Aggeu MagalhãesFundação Oswaldo CruzMestrado AcadêmicoRecifePrograma de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia em Saúdeinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALtarciana_celerino_iam_mest_2022.pdftarciana_celerino_iam_mest_2022.pdfapplication/pdf6690584https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/59898/2/tarciana_celerino_iam_mest_2022.pdfceac58cd356dfa4d13d8510d9dba8b78MD52LICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/59898/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51icict/598982023-08-04 10:33:11.948oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-08-04T13:33:11Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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