Estudos de associação de polimorfismos de base única em genes candidatos na Hanseníase
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Data de Publicação: | 2006 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35815 |
Resumo: | A Hanseníase é uma doença infecciosa crônica causada por um patógeno intracellular obrigatório, o Mycobacterium leprae, com tropismo por células de Schwann nos nervos periféricos e macrófagos na pele. O espectro com cinco formas clínicas diferentes é determinado pela interação patógeno-hospedeiro através da influência do M. leprae sobre a resposta imune do hospedeiro associada à dicotomia Th1 x Th2, a qual é representada pelas formas tuberculoides e lepromatosas da doença. A análise de seqüências do M. leprae demonstrou uma baixa variabilidade, de forma que tanto o desenvolvimento de Hanseníase quanto de seu espectro de manifestações depende majoritariamente das características do hospedeiro. Esta observação tem estimulado estudos visando à identificação de marcadores de suscetibilidade à Hanseníase per se ou a uma das formas clínicas. O objetivo deste estudo foi a reprodução de resultados já publicados de associação entre polimorfismos de base única (SNPs) e a suscetibilidade à Hanseníase. Um estudo tipo caso-controle utilizando uma população composta por 233 contatos domiciliares sadios e 212 pacientes de todas as formas clínicas da hanseníase foi desenhado. As amostras foram genotipadas através dos métodos de PCR-RFLP ou discriminação alélica por tempo real para SNPs dos genes TNFA (-308), LTA (+252) e PARK2 (-2599 e rs1040079). Desvios em relação ao Equilíbrio de Hardy-Weinberg foram detectados em SNPs do lócus de TNF (-308 nos contatos e +252 nos pacientes) e no SNP \20132599 do gene PARK2 em ambas as populações. As análises baseadas em populações confirmam a proteção anteriormente detectada para o alelo TNF-308A (OR=0,59; P=0,03) e para o haplótipo \2013308A/+252A, embora este segundo resultado não seja significativo (OR=0,47; P=0,06) Os estudos de SNPs e haplótipos do gene PARK2 não detectaram associação. Um novo SNP (asp110ala) no gene de ninjurina (NINJ1) também foi investigado de modo a verificar uma possível associação com a Hanseníase. Nenhuma evidência de associação deste SNP com a suscetibilidade e severidade foi detectada, embora uma primeira analise tenha sugerido associação com dano neural avaliado pelo grau de incapacidade. Assim utilizando uma população estendida de pacientes (n=765) foi confirmada a associação do alelo 110ala e o grau de incapacidade (OR=1,54; P=0,007). A quantificação alelo-específica dos transcritos por tempo real demonstrou que o alelo 110asp tem expressão aumentada quando comparada à do alelo 110ala. Neste trabalho foi confirmada a associação do alelo -308A com a resistência a hanseníase per se em Brasileiros. As análises de ninjurina demonstraram que o SNP asp110ala pode ser um marcador prognóstico valioso já que o carreadores do alelo 110ala têm suscetibilidade aumentada ao dano neural, possivelmente causada por uma expressão reduzida desta molécula de adesão mediada por esse alelo. |
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Cardoso, Cynthia ChesterMoraes, Milton Ozório2019-09-23T18:26:32Z2019-09-23T18:26:32Z2006CARDOSO, Cynthia Chester. Estudos de associação de polimorfismos de base única em genes candidatos na Hanseníase. 2006. 87 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitária)-Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2006.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/35815A Hanseníase é uma doença infecciosa crônica causada por um patógeno intracellular obrigatório, o Mycobacterium leprae, com tropismo por células de Schwann nos nervos periféricos e macrófagos na pele. O espectro com cinco formas clínicas diferentes é determinado pela interação patógeno-hospedeiro através da influência do M. leprae sobre a resposta imune do hospedeiro associada à dicotomia Th1 x Th2, a qual é representada pelas formas tuberculoides e lepromatosas da doença. A análise de seqüências do M. leprae demonstrou uma baixa variabilidade, de forma que tanto o desenvolvimento de Hanseníase quanto de seu espectro de manifestações depende majoritariamente das características do hospedeiro. Esta observação tem estimulado estudos visando à identificação de marcadores de suscetibilidade à Hanseníase per se ou a uma das formas clínicas. O objetivo deste estudo foi a reprodução de resultados já publicados de associação entre polimorfismos de base única (SNPs) e a suscetibilidade à Hanseníase. Um estudo tipo caso-controle utilizando uma população composta por 233 contatos domiciliares sadios e 212 pacientes de todas as formas clínicas da hanseníase foi desenhado. As amostras foram genotipadas através dos métodos de PCR-RFLP ou discriminação alélica por tempo real para SNPs dos genes TNFA (-308), LTA (+252) e PARK2 (-2599 e rs1040079). Desvios em relação ao Equilíbrio de Hardy-Weinberg foram detectados em SNPs do lócus de TNF (-308 nos contatos e +252 nos pacientes) e no SNP \20132599 do gene PARK2 em ambas as populações. As análises baseadas em populações confirmam a proteção anteriormente detectada para o alelo TNF-308A (OR=0,59; P=0,03) e para o haplótipo \2013308A/+252A, embora este segundo resultado não seja significativo (OR=0,47; P=0,06) Os estudos de SNPs e haplótipos do gene PARK2 não detectaram associação. Um novo SNP (asp110ala) no gene de ninjurina (NINJ1) também foi investigado de modo a verificar uma possível associação com a Hanseníase. Nenhuma evidência de associação deste SNP com a suscetibilidade e severidade foi detectada, embora uma primeira analise tenha sugerido associação com dano neural avaliado pelo grau de incapacidade. Assim utilizando uma população estendida de pacientes (n=765) foi confirmada a associação do alelo 110ala e o grau de incapacidade (OR=1,54; P=0,007). A quantificação alelo-específica dos transcritos por tempo real demonstrou que o alelo 110asp tem expressão aumentada quando comparada à do alelo 110ala. Neste trabalho foi confirmada a associação do alelo -308A com a resistência a hanseníase per se em Brasileiros. As análises de ninjurina demonstraram que o SNP asp110ala pode ser um marcador prognóstico valioso já que o carreadores do alelo 110ala têm suscetibilidade aumentada ao dano neural, possivelmente causada por uma expressão reduzida desta molécula de adesão mediada por esse alelo.Leprosy is a chronic infectious disease caused by the intracellular pathogen Mycobacterium leprae, which has tropism for Schwann cells in peripheral nerves and macrophages in the skin. The spectrum with five different clinical forms is determined by host:pathogen interactions that influences a polarized immune response represented as the tuberculoid and lepromatous forms of the disease, which are associated to Th1 x Th2 immunological patterns, respectively. The sequence analysis of M. leprae showed low genetic variability in a way that both leprosy per se and the spectrum of manifestations are explained mostly due to host responses. This observation has encouraged many studies aiming the identification of markers of susceptibility to leprosy per se or to one of the clinical forms. The aim of this study was to replicate in a new population previous published results that reported association between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and leprosy susceptibility. It was designed a casecontrol study using 233 healthy unrelated household contacts and 212 patients from all clinical forms of leprosy. Samples were genotyped using PCR-RFLP or allelic discrimination method for SNPs in TNFA (-308), LTA (+252) and PARK2 (-2599 and rs1040079) genes. Deviations from the Hardy-Weinberg Equilibrium were detected in SNPs located at TNF locus (-308 in patients and +252 in control group) and for the SNP –2599 at PARK2 gene in both populations. The population-based analysis replicated the protection previously reported for allele TNF-308A (OR=0,59; P=0,03) and also for –308A/+252A haplotype, although it was not significant (OR=0,47 P=0,06). Analysis with PARK2 SNPs and haplotypes did not show any association. A novel SNP (asp110ala) at NINJ1 gene was also investigated so as to determine a possible association with leprosy. There was no evidence of association of this SNP and leprosy susceptibility and severity, but the first analysis suggested an association with neurological damage as assessed by the disability grade. So, using an extended patients population (n=765) we confirmed the association between allele 110ala and incapacity grade (OR=1,54; P=0,007). Functional analysis detected a higher ninjurin mRNA and protein expression in response to M. leprae stimulus. Allele-specific transcript quantitation demonstrated that allele 110asp was augmented as compared to 110ala. Here, we confirm the association of -308A allele with resistance of leprosy per se among Brazilians. Ninjurin analysis showed that asp110ala could be a valuable prognostic marker, since carriers of ala110 allele have increased susceptibility to nerve damage possibly because this allele shows a decreased expression of this adhesion molecule.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porMycobacterium lepraeHanseníasePolimorfismo de Nucleotídeo ÚnicoEstudos de associação de polimorfismos de base única em genes candidatos na Hanseníaseinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2006Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Biologia Parasitáriainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35815/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALcynthia_cardoso_ioc_mest_2006.pdfapplication/pdf1276695https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35815/2/cynthia_cardoso_ioc_mest_2006.pdf8394bbf5e857ec93dc341eec48701e68MD52TEXTcynthia_cardoso_ioc_mest_2006.pdf.txtcynthia_cardoso_ioc_mest_2006.pdf.txtExtracted texttext/plain200024https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/35815/3/cynthia_cardoso_ioc_mest_2006.pdf.txtd11c6e85c7701069da4dc4e0bafeb86cMD53icict/358152019-09-24 02:03:56.336oai:www.arca.fiocruz.br:icict/35815Tk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-09-24T05:03:56Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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