Epidemiologia e caracterização molecular de Pegivirus humano tipo 1 (HPgV-1) em indivíduos coinfectados pelos vírus da hepatite C (HCV) e/ou vírus da imunodeficiência humana (HIV)
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Data de Publicação: | 2020 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/43959 |
Resumo: | O Pegivirus humano 1 (HPgV-1) é um vírus de RNA de fita simples de polaridade positiva membro da família Flaviviridae, e que possui similaridade genômica com o vírus da hepatite C (HCV). No entanto, diferentemente do HCV, o HPgV-1 é linfotrópico e estabelece uma infecção subclínica. Vários estudos relataram que a infecção pelo HPgV-1 está associada à progressão tardia da doença pelo HIV, com indivíduos infectados demonstrando maiores contagens de células TCD4+, menor carga viral do HIV, uma progressão mais lenta para AIDS e, consequentemente, uma expectativa de vida prolongada. Em pacientes com coinfecção crônica por HCV e HIV, o RNA do HPgV-1 foi associado a níveis significativamente mais baixos de ALT e AST e a uma melhora na sobrevida livre de cirrose, sugerindo um efeito benéfico da infecção pelo HPgV-1 em ambas as infecções. Para a melhor compreensão do impacto do HPgV-1 nas co-infecções, se faz necessário conhecer as características epidemiológicas desse vírus. O objetivo deste estudo foi determinar a prevalência e distribuição genotípica do HPgV-1 em doadores de sangue e pacientes HCV e HIV positivos atendidos em um hospital no Rio de Janeiro entre os anos de 2017 a 2018 Um ensaio de RT-PCR para amplificação específica da região 5'UTR do genoma viral foi realizado em 236 amostras de soro, sendo 56 amostras de coinfecção HCV/HIV, 60 de HCV mono-infectadas, 60 de HIV mono-infectadas e 60 de doadores de sangue. Todas as amostras positivas foram submetidas ao seqüenciamento direto do genoma viral para genotipagem e caracterização molecular. A prevalência geral de HPgV-1 foi de 15,7% (37/236). Maiores frequências de HPgV-1 foram encontradas no grupo de indivíduos com HIV 28,3% (17/60), seguido pelos grupos de indivíduos co-infectados com HCV/HIV (14,3%), doadores de sangue (11,6%) e em co-infecção com HCV (8,3%). A análise filogenética revelou a presença dos genótipos 2a (22,8%), 2b (57,1%), 3 (8,5%) e 1 (8,5%) de HPgV-1. Este é o primeiro estudo que caracteriza a infecção pelo HPgV-1 em pacientes com HCV e HCV/HIV na cidade do Rio de Janeiro e que visa contribuir com maiores informações sobre características epidemiológicas e clínicas do HPgV-1 no curso natural da infecções pelo HCV e/ou HIV. |
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Pereira, Jéssica GonçalvesPaula, Vanessa Salete deSoares, Caroline Cordeiro2020-10-13T13:40:58Z2020-10-13T13:40:58Z2020PEREIRA, Jéssica Gonçalves. Epidemiologia e caracterização molecular de Pegivirus humano tipo 1 (HPgV-1) em indivíduos coinfectados pelos vírus da hepatite C (HCV) e/ou vírus da imunodeficiência humana (HIV). 2020. 78 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitária) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2020.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/43959O Pegivirus humano 1 (HPgV-1) é um vírus de RNA de fita simples de polaridade positiva membro da família Flaviviridae, e que possui similaridade genômica com o vírus da hepatite C (HCV). No entanto, diferentemente do HCV, o HPgV-1 é linfotrópico e estabelece uma infecção subclínica. Vários estudos relataram que a infecção pelo HPgV-1 está associada à progressão tardia da doença pelo HIV, com indivíduos infectados demonstrando maiores contagens de células TCD4+, menor carga viral do HIV, uma progressão mais lenta para AIDS e, consequentemente, uma expectativa de vida prolongada. Em pacientes com coinfecção crônica por HCV e HIV, o RNA do HPgV-1 foi associado a níveis significativamente mais baixos de ALT e AST e a uma melhora na sobrevida livre de cirrose, sugerindo um efeito benéfico da infecção pelo HPgV-1 em ambas as infecções. Para a melhor compreensão do impacto do HPgV-1 nas co-infecções, se faz necessário conhecer as características epidemiológicas desse vírus. O objetivo deste estudo foi determinar a prevalência e distribuição genotípica do HPgV-1 em doadores de sangue e pacientes HCV e HIV positivos atendidos em um hospital no Rio de Janeiro entre os anos de 2017 a 2018 Um ensaio de RT-PCR para amplificação específica da região 5'UTR do genoma viral foi realizado em 236 amostras de soro, sendo 56 amostras de coinfecção HCV/HIV, 60 de HCV mono-infectadas, 60 de HIV mono-infectadas e 60 de doadores de sangue. Todas as amostras positivas foram submetidas ao seqüenciamento direto do genoma viral para genotipagem e caracterização molecular. A prevalência geral de HPgV-1 foi de 15,7% (37/236). Maiores frequências de HPgV-1 foram encontradas no grupo de indivíduos com HIV 28,3% (17/60), seguido pelos grupos de indivíduos co-infectados com HCV/HIV (14,3%), doadores de sangue (11,6%) e em co-infecção com HCV (8,3%). A análise filogenética revelou a presença dos genótipos 2a (22,8%), 2b (57,1%), 3 (8,5%) e 1 (8,5%) de HPgV-1. Este é o primeiro estudo que caracteriza a infecção pelo HPgV-1 em pacientes com HCV e HCV/HIV na cidade do Rio de Janeiro e que visa contribuir com maiores informações sobre características epidemiológicas e clínicas do HPgV-1 no curso natural da infecções pelo HCV e/ou HIV.Human Pegivirus-1 (HPgV-1), formerly known as GBV-C virus, is a member of the Flaviviridae family, a single-stranded positive RNA virus and that has genetic similarity to the hepatitis C virus (HCV). However, unlike HCV, HPgV-1 is lymphotropic and is involved in a subclinical infection. Several studies related to HPgV-1 infections are associated with the late progression of HIV disease, demonstrate higher counts of TCD4 + cells, lower HIV viral load, slower progression to AIDS and, consequently, longer life expectancy of the patients. Moreover, in patients with chronic co-infection by HCV and HIV, the HPgV-1 RNA was associated with lower levels of ALT and AST and an improvement in cirrhosis-free survival, suggesting a beneficial effect of HPgV-1 infection for both HCV and HIV infections.To better understand the impact of HPgV-1 on co-infections, the knowledge on the epidemiological characteristics of the virus is necessary The aim of this study was to determine the prevalence and genetic distribution of HPgV-1 in blood donors and patients with HCV and HIV assisted in a hospital in Rio de Janeiro between 2017 and 2018 An RTPCR assay for specific amplification of the 5'UTR region of the viral genome was performed on 236 serum samples that were classified into four groups: 56 HCV/HIV co-infected samples, 60 HCV-infected, 60 HIV-infected and 60 from blood donors. All positive samples were subjected to direct viral genome sequencing for genotyping and molecular characterization. The overall prevalence of HPgV-1 was 15.7% (37/236). Among the HCV/HIV co-infected group, the prevalence of HPgV-1 was 14.3% (8/56), in the HCV coinfected one was 8.3% (5/60), in the HIV co-infected was 28.3% (17/60) and in blood donors 11.6% (7/60). From all positive samples, 35 were successfully sequenced. Phylogenetic analysis revealed the presence of HPgV-1 genotypes 2a (22.8%), 2b (57.1%), 3 (8.5%) and 1 (8.5%). Moreover, our results demonstrate that the highest frequencies of HPgV-1 were found in HIV and HCV/HIV co-infected individuals. The circulating HPgV-1 genotypes characterized here have already been reported in Brazil, however, this is the first study on HPgV-1 infection in patients with HCV and HCV/HIV in the city of Rio de Janeiro and aims to contribute with more information on epidemiological and clinical aspects of HPgV-1 in the natural course of the HCV and/or HIV infections.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porHIVHepatite CTécnicas de GenotipagemInfecções por FlaviviridaeEpidemiologiaHIVHepatite CTécnicas de GenotipagemInfecções por FlaviviridaeEpidemiologiaEpidemiologia e caracterização molecular de Pegivirus humano tipo 1 (HPgV-1) em indivíduos coinfectados pelos vírus da hepatite C (HCV) e/ou vírus da imunodeficiência humana (HIV)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2020Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Biologia Parasitáriainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/43959/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALjessica_pereira_ioc_mest_2020.pdfapplication/pdf6184845https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/43959/2/jessica_pereira_ioc_mest_2020.pdf4eb03afc64fa55bb308b43aa6e4a2a97MD52TEXTjessica_pereira_ioc_mest_2020.pdf.txtjessica_pereira_ioc_mest_2020.pdf.txtExtracted texttext/plain113619https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/43959/3/jessica_pereira_ioc_mest_2020.pdf.txt5b394718073e2b158eea266e2d7a9f3dMD53icict/439592020-10-15 02:07:51.712oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352020-10-15T05:07:51Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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