Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2017 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/25218 |
Resumo: | A Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo (do termo em inglês Cartilage Hair Hypoplasia \2013 CHH; #250250) é uma displasia esquelética (DE) de etiologia autossômica recessiva caracterizada por anormalidades esqueléticas, predominantemente metafisárias, além de cabelos finos e esparsos. Também podem ocorrer alterações imunológicas e predisposição para alguns tipos de câncer. Essa patologia é causada por mutações no gene RMRP, que não é traduzido em proteína e codifica um RNA integrante do complexo RNAse MRP, envolvido no processamento do rRNA de 5.8S, na replicação do DNA mitocondrial e na progressão do ciclo celular. Este trabalho visou identificar mutações no gene RMRP e avaliar os níveis do seu transcrito, assim como a abundância de rRNA 5.8s, um de seus alvos, em pacientes com suspeita de CHH. Para isso, o DNA genômico dos pacientes foi extraído a partir de sangue periférico pelo método de Salting Out. Para a discriminação alélica as regiões promotora e transcrita foram amplificadas por PCR, clonadas em plasmídeo pGEM-T e os plasmídeos recombinantes resultantes, foram utilizados para transformar bactérias competentes da cepa DH5\03B1. Após seleção por PCR, as colônias positivas foram sequenciadas pelo método de Sanger. Também foram analisadas amostras dos progenitores, quando disponíveis, para determinar a origem parental dos alelos. Neste estudo, em uma série de 20 pacientes brasileiros reportamos 22 mutações diferentes do tipo duplicações, triplicações, inserções e mutações pontuais, das quais 11 ainda não foram descritas na literatura. Todas as alterações ocorreram em heterozigose composta (uma mutação na região promotora associada à uma alteração na região transcrita ou duas alterações distintas na região transcrita). Concomitantemente, também foram identificados 7 tipos de polimorfismos já descritos na literatura. Vale ressaltar que a mutação g.71A>G, mais frequentemente descrita na literatura para CHH, não foi encontrada em nosso grupo de estudo. Em contrapartida, a mutação g.196C>T foi encontrada em mais de 50% dos nossos pacientes, uma frequência ainda não descrita em outros países. Para análise dos níveis de transcritos de RMRP e 5.8S não processados, foram realizadas reações de RT-qPCR em um estudo piloto. Cinco pacientes analisados apresentaram uma tendência à redução da atividade de transcrição do gene RMRP. Além disso, dois pacientes apresentaram uma tendência ao aumento nos níveis de transcritos de rRNA de 5.8S não clivado em relação ao indivíduo controle. O resultado molecular confirma a etiologia da doença e permite o aconselhamento genético das famílias, visando detectar precocemente complicações clínicas graves, como varicela em pacientes não imunizados e desenvolvimento de câncer infantil (particularmente linfoma). Em conjunto esses dados podem contribuir para o melhor entendimento dos mecanismos envolvidos nessa patologia e para futuros estudos epidemiológicos. |
id |
CRUZ_cb188648e1851f480c386343d3a6747a |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.arca.fiocruz.br:icict/25218 |
network_acronym_str |
CRUZ |
network_name_str |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
repository_id_str |
2135 |
spelling |
Gomes, Maria Eduarda de SouzaLlerena Junior, Juan ClintonGonzalez, Sayonara Maria de Carvalho2018-03-12T13:58:50Z2018-03-12T13:58:50Z2017GOMES, Maria Eduarda de Souza. Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo. 2017. 116 f. Dissertação (Mestrado em Ciências)-Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira, Rio de Janeiro, 2017.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/25218A Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo (do termo em inglês Cartilage Hair Hypoplasia \2013 CHH; #250250) é uma displasia esquelética (DE) de etiologia autossômica recessiva caracterizada por anormalidades esqueléticas, predominantemente metafisárias, além de cabelos finos e esparsos. Também podem ocorrer alterações imunológicas e predisposição para alguns tipos de câncer. Essa patologia é causada por mutações no gene RMRP, que não é traduzido em proteína e codifica um RNA integrante do complexo RNAse MRP, envolvido no processamento do rRNA de 5.8S, na replicação do DNA mitocondrial e na progressão do ciclo celular. Este trabalho visou identificar mutações no gene RMRP e avaliar os níveis do seu transcrito, assim como a abundância de rRNA 5.8s, um de seus alvos, em pacientes com suspeita de CHH. Para isso, o DNA genômico dos pacientes foi extraído a partir de sangue periférico pelo método de Salting Out. Para a discriminação alélica as regiões promotora e transcrita foram amplificadas por PCR, clonadas em plasmídeo pGEM-T e os plasmídeos recombinantes resultantes, foram utilizados para transformar bactérias competentes da cepa DH5\03B1. Após seleção por PCR, as colônias positivas foram sequenciadas pelo método de Sanger. Também foram analisadas amostras dos progenitores, quando disponíveis, para determinar a origem parental dos alelos. Neste estudo, em uma série de 20 pacientes brasileiros reportamos 22 mutações diferentes do tipo duplicações, triplicações, inserções e mutações pontuais, das quais 11 ainda não foram descritas na literatura. Todas as alterações ocorreram em heterozigose composta (uma mutação na região promotora associada à uma alteração na região transcrita ou duas alterações distintas na região transcrita). Concomitantemente, também foram identificados 7 tipos de polimorfismos já descritos na literatura. Vale ressaltar que a mutação g.71A>G, mais frequentemente descrita na literatura para CHH, não foi encontrada em nosso grupo de estudo. Em contrapartida, a mutação g.196C>T foi encontrada em mais de 50% dos nossos pacientes, uma frequência ainda não descrita em outros países. Para análise dos níveis de transcritos de RMRP e 5.8S não processados, foram realizadas reações de RT-qPCR em um estudo piloto. Cinco pacientes analisados apresentaram uma tendência à redução da atividade de transcrição do gene RMRP. Além disso, dois pacientes apresentaram uma tendência ao aumento nos níveis de transcritos de rRNA de 5.8S não clivado em relação ao indivíduo controle. O resultado molecular confirma a etiologia da doença e permite o aconselhamento genético das famílias, visando detectar precocemente complicações clínicas graves, como varicela em pacientes não imunizados e desenvolvimento de câncer infantil (particularmente linfoma). Em conjunto esses dados podem contribuir para o melhor entendimento dos mecanismos envolvidos nessa patologia e para futuros estudos epidemiológicos.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porHipoplasia de Cartilagem-CabeloMutações PatogênicasDisplasia EsqueléticaGene RMRPAnálise da Expressão GênicaAvaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabeloinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2017Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes FigueiraFundação Oswaldo CruzRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Saúde da Mulher e da Criançainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/25218/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALmaria_gomes_iff_mest_2017.pdfapplication/pdf3078061https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/25218/2/maria_gomes_iff_mest_2017.pdf1706ce4521bfdc455d93d4c45b36b2d7MD52TEXTmaria_gomes_iff_mest_2017.pdf.txtmaria_gomes_iff_mest_2017.pdf.txtExtracted texttext/plain155767https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/25218/3/maria_gomes_iff_mest_2017.pdf.txtbb1145b58a0722306c129f4bddb0f959MD53icict/252182019-01-09 16:12:59.764oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-01-09T18:12:59Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo |
title |
Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo |
spellingShingle |
Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo Gomes, Maria Eduarda de Souza Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo Mutações Patogênicas Displasia Esquelética Gene RMRP Análise da Expressão Gênica |
title_short |
Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo |
title_full |
Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo |
title_fullStr |
Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo |
title_full_unstemmed |
Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo |
title_sort |
Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo |
author |
Gomes, Maria Eduarda de Souza |
author_facet |
Gomes, Maria Eduarda de Souza |
author_role |
author |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Gomes, Maria Eduarda de Souza |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Llerena Junior, Juan Clinton Gonzalez, Sayonara Maria de Carvalho |
contributor_str_mv |
Llerena Junior, Juan Clinton Gonzalez, Sayonara Maria de Carvalho |
dc.subject.other.pt_BR.fl_str_mv |
Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo Mutações Patogênicas |
topic |
Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo Mutações Patogênicas Displasia Esquelética Gene RMRP Análise da Expressão Gênica |
dc.subject.decs.pt_BR.fl_str_mv |
Displasia Esquelética Gene RMRP Análise da Expressão Gênica |
description |
A Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo (do termo em inglês Cartilage Hair Hypoplasia \2013 CHH; #250250) é uma displasia esquelética (DE) de etiologia autossômica recessiva caracterizada por anormalidades esqueléticas, predominantemente metafisárias, além de cabelos finos e esparsos. Também podem ocorrer alterações imunológicas e predisposição para alguns tipos de câncer. Essa patologia é causada por mutações no gene RMRP, que não é traduzido em proteína e codifica um RNA integrante do complexo RNAse MRP, envolvido no processamento do rRNA de 5.8S, na replicação do DNA mitocondrial e na progressão do ciclo celular. Este trabalho visou identificar mutações no gene RMRP e avaliar os níveis do seu transcrito, assim como a abundância de rRNA 5.8s, um de seus alvos, em pacientes com suspeita de CHH. Para isso, o DNA genômico dos pacientes foi extraído a partir de sangue periférico pelo método de Salting Out. Para a discriminação alélica as regiões promotora e transcrita foram amplificadas por PCR, clonadas em plasmídeo pGEM-T e os plasmídeos recombinantes resultantes, foram utilizados para transformar bactérias competentes da cepa DH5\03B1. Após seleção por PCR, as colônias positivas foram sequenciadas pelo método de Sanger. Também foram analisadas amostras dos progenitores, quando disponíveis, para determinar a origem parental dos alelos. Neste estudo, em uma série de 20 pacientes brasileiros reportamos 22 mutações diferentes do tipo duplicações, triplicações, inserções e mutações pontuais, das quais 11 ainda não foram descritas na literatura. Todas as alterações ocorreram em heterozigose composta (uma mutação na região promotora associada à uma alteração na região transcrita ou duas alterações distintas na região transcrita). Concomitantemente, também foram identificados 7 tipos de polimorfismos já descritos na literatura. Vale ressaltar que a mutação g.71A>G, mais frequentemente descrita na literatura para CHH, não foi encontrada em nosso grupo de estudo. Em contrapartida, a mutação g.196C>T foi encontrada em mais de 50% dos nossos pacientes, uma frequência ainda não descrita em outros países. Para análise dos níveis de transcritos de RMRP e 5.8S não processados, foram realizadas reações de RT-qPCR em um estudo piloto. Cinco pacientes analisados apresentaram uma tendência à redução da atividade de transcrição do gene RMRP. Além disso, dois pacientes apresentaram uma tendência ao aumento nos níveis de transcritos de rRNA de 5.8S não clivado em relação ao indivíduo controle. O resultado molecular confirma a etiologia da doença e permite o aconselhamento genético das famílias, visando detectar precocemente complicações clínicas graves, como varicela em pacientes não imunizados e desenvolvimento de câncer infantil (particularmente linfoma). Em conjunto esses dados podem contribuir para o melhor entendimento dos mecanismos envolvidos nessa patologia e para futuros estudos epidemiológicos. |
publishDate |
2017 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2017 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2018-03-12T13:58:50Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2018-03-12T13:58:50Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
GOMES, Maria Eduarda de Souza. Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo. 2017. 116 f. Dissertação (Mestrado em Ciências)-Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira, Rio de Janeiro, 2017. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/25218 |
identifier_str_mv |
GOMES, Maria Eduarda de Souza. Avaliação fenotípica, genotípica e dos níveis de transcritos de RMRP e pré-rRNA 5.8S em pacientes com Hipoplasia de Cartilagem-Cabelo. 2017. 116 f. Dissertação (Mestrado em Ciências)-Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira, Rio de Janeiro, 2017. |
url |
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/25218 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) instacron:FIOCRUZ |
instname_str |
Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
instacron_str |
FIOCRUZ |
institution |
FIOCRUZ |
reponame_str |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
collection |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/25218/1/license.txt https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/25218/2/maria_gomes_iff_mest_2017.pdf https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/25218/3/maria_gomes_iff_mest_2017.pdf.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 1706ce4521bfdc455d93d4c45b36b2d7 bb1145b58a0722306c129f4bddb0f959 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio.arca@fiocruz.br |
_version_ |
1813008949392179200 |