Caracterização dos mecanismos de controle e persistência viral em uma coorte de indivíduos infectados pelo HIV-1 com supressão natural da viremia e da evolução para a aids
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/34429 |
Resumo: | Controladores do HIV (HIVc), são um grupo raro e singular de indivíduos infectados pelo HIV que controlam a replicação viral, mantendo a viremia em níveis baixos (<2000 cópias de HIV/ml, do inglês, viremic controllers \2013 VC) ou indetectáveis (do inglês, elite controllers \2013 EC), na ausência tratamento antirretroviral. Sugere-se que um conjunto de fatores genéticos e adquiridos do hospedeiro, bem como características virais específicas, contribuem para a restrição viral. No entanto, os mecanismos subjacentes ao controle natural da infecção pelo HIV-1 são complexos e multifatoriais, uma vez que a presença ou ausência de um fator isoladamente não é suficiente para desenvolver o perfil HIVc. Nosso objetivo neste estudo foi a caracterização de mecanismos responsáveis pelo controle e persistência viral em uma coorte de indivíduos infectados pelo HIV com diferentes níveis de supressão natural da viremia e evolução para a aids. Inicialmente, observamos que a diversidade das quasispécies provirais do HIV-1 associada ao PBMC (do inglês, peripheral blood mononuclear cell) em EC é significativamente menor do que em VC, mas não significativamente diferente entre subgrupos de EC exibindo carga viral indetectável persistente (do inglês, persistent elite controllers \2013 PEC) ou episódios ocasionais de viremia transitória (do inglês, ebbing elite controllers \2013 EEC). Alguns PEC e EEC exibiram populações provirais altamente homogêneas com grandes grupos de sequências idênticas (ECLD), enquanto outros exibiram populações provirais relativamente diversas com uma elevada proporção de sequências únicas (ECHD) Apesar das diferenças na diversidade genética proviral, os subgrupos ECLD e ECHD apresentaram níveis comparáveis de células T CD8+ ativadas e biomarcadores inflamatórios plasmáticos (IP-10, IL-18, RANTES, PDGF-AA e CTACK) associados a predição da progressão virológica e/ou imunológica. Encontramos também dois indivíduos (um EC e um VC) com superinfecção intersubtipo pelo HIV-1. Através da caracterização longitudinal do reservatório proviral, descobrimos que ambos mantiveram o controle virológico sem evidência de evolução viral ou progressão imunológica por pelo menos 2 anos após o evento de superinfecção. Essas evidências sugerem que os fatores do hospedeiro provavelmente estariam envolvidos no controle virológico alcançado em pelo menos alguns indivíduos dessa coorte. Portanto, investigamos se fatores de restrição do hospedeiro (FR), proteínas da resposta imune inata, teriam um papel no controle natural da infecção pelo HIV-1 observado nesses indivíduos. Encontramos um aumento significativo do RNAm de p21 e MCPIP1 em PBMC de HIVc em comparação com indivíduos infectados pelo HIV em supressão pela terapia e não infectados pelo HIV, e a expressão desses dois FR foi significativamente correlacionada positivamente. Confirmamos a superexpressão de p21 em HIVc e mostramos pela primeira vez a superexpressão de MCPIP1 associada à supressão natural da replicação do HIV-1 in vivo. Juntos, esses resultados indicam que não há relação simples entre supressão viral sistêmica e a diversidade proviral intra-hospedeiro em HIVc cronicamente infectados e que os FR do hospedeiro, como p21 e MCPIP1, podem ter um papel importante no controle do HIV-1 em HIVc. A compreensão das vias regulatórias e o efeito desses FR da resposta inata criam novas perspectivas para prevenir a replicação do HIV-1 e a progressão da doença em indivíduos infectados pelo HIV-1. |
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A set of host genetic and acquired factors, as well as specific viral characteristics, were suggested to contribute to the viral containment. However, the mechanisms underlying the natural control of HIV-1 infection are complex and multifactorial, as the presence or absence of one factor alone is not sufficient to achieve the HIVc profile. In this study, we aimed the characterization of mechanisms responsible for the viral control and persistence in a cohort of HIV+ individuals with different levels of natural suppression of viremia and evolution to AIDS. First, we found that HIV-1 diversity of the PBMC-associated proviral quasispecies in EC is significantly lower than in VC, but not significantly different between EC subgroups exhibiting persistent (PEC) undetectable viral load or occasional episodes of transient (EEC) viremia. Some PEC and EEC displayed highly homogenous proviral populations with large clusters of identical sequences (ECLD), while others exhibited relatively diverse proviral populations with a high proportion of unique sequences (ECHD). Despite the differences in proviral genetic diversity, the ECLD and ECHD subgroups displayed comparable levels of activated CD8+ T cells and plasmatic inflammatory biomarkers (IP-10, IL-18, RANTES, PDGF-AA, and CTACK) associated with virologic and/or immunologic progression prediction. We also found two individuals (one EC and one VC) that undergone intersubtype HIV-1 superinfection. Through longitudinal characterization of the proviral reservoir, we found that both individuals maintained virologic control with no evidence of viral evolution or immunologic progression for at least 2 years after the superinfection event. These evidences suggested that host factors would probably be involved in the virologic control achieved in at least some individuals of this cohort. Thus, we investigated if host restriction factors (RF), proteins of the immune response, had a role in the natural control of HIV-1 infection observed in these individuals. We found a significant upregulation of p21 and MCPIP1 mRNA in PBMC from HIVc compared with both ART-suppressed and HIV-negative subjects, and the expression of these two RF was significantly positively correlated. We confirmed the overexpression of p21 in HIVc and showed for the first time the overexpression of MCPIP1 associated with natural suppression of HIV-1 replication in vivo. Together, these results indicate that there is no simple relationship between systemic viral suppression and intra-host proviral diversity in chronically infected HIVc and that host RF such as p21 and MCPIP1 may have a major role on HIV-1 control in HIVc. The understanding of the regulatory pathways and the effect of these RF of innate response creates novel perspectives to prevent HIV-1 replication and disease progression in HIV+ individuals.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porSíndrome de Imunodeficiência AdquiridaAidsSupressãoReplicação ViralHIV-1Replicação ViralViremiaCarga ViralSupressãoCaracterização dos mecanismos de controle e persistência viral em uma coorte de indivíduos infectados pelo HIV-1 com supressão natural da viremia e da evolução para a aidsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2019Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo CruzRio de Janeiro/RJPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecularinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34429/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALsuwellen_azevedo_ioc_dout_2019.pdfsuwellen_azevedo_ioc_dout_2019.pdfapplication/pdf12145036https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34429/2/suwellen_azevedo_ioc_dout_2019.pdf45cf84077618ced3abb49d6a08f90d83MD52TEXTsuwellen_azevedo_ioc_dout_2019.pdf.txtsuwellen_azevedo_ioc_dout_2019.pdf.txtExtracted texttext/plain212346https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/34429/3/suwellen_azevedo_ioc_dout_2019.pdf.txt8a1aeec452667eb8b09289adba68595cMD53icict/344292019-07-26 10:11:38.454oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-07-26T13:11:38Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false |
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