Utilização de RNAs não codificadores pequenos na distinção de amostras humanas de câncer de pulmão e de células do sangue

• Autor(a) principal: Jorge, Natasha Andressa Nogueira
• Data de Publicação: 2017
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
• Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/25160
• topic: RNA Nucleolar Pequeno; Tabagismo; Hematopoese; RNA Interferente Pequeno

Os RNAs não codificadores pequenos, como piRNAs, snoRNAs e miRNAs, atuam em diversas etapas do metabolismo celular, participando de processos como controle da expressão gênica, metilação e pseudouridilação de rRNAs e diferenciação celular. Neste trabalho, utilizamos dados públicos de sequenciamento de alta vazão de RNAs pequenos para avaliar a importância de RNAs não codificadores pequenos na biologia das células sadias e de neoplasia maligna. Na primeira análise, utilizamos dados de amostras normais e tumorais de pacientes de adenocarcinoma de pulmão obtidos no banco de dados do TCGA. Estas amostras foram utilizadas para avaliar o perfil de expressão de snoRNAs e piRNAs. Nesta análise, revelamos que o fumo inibe diversos snoRNAs relacionados à manutenção celular e promove a expressão de outros snoRNAs também encontrados mais expressos em diversos tumores, alterando, assim, o perfil de expressão de células normais para um que se assemelha mais a tumores. Também monstramos que os tumores de pulmão de não fumantes e fumantes são bastante heterogêneos e aconselhamos que sejam estudados separadamente Nesta mesma análise, apontamos também snoRNAs cuja expressão não se altera em nenhuma das condições avaliadas, podendo assim serem usados como parâmetro para normalização de experimentos de biologia molecular. A segunda análise envolve a identificação de miRNAs diferencialmente expressos entre linfócitos T CD4 virgens, megacariócitos, eritroblatos, neutrófilos, monócitos e macrófagos M1 e M2 do projeto Blueprint. Nesta etapa, além de identificar os miRNAs, utilizamos dados de sequenciamento de alta vazão de mRNAs e um banco de dados de alvos validados para identificar as vias metabólicas inibidas por miRNAs durante o processo de diferenciação destes tipos celulares. Esta análise corrobora dados da literatura do papel de miRNAs no processo de diferenciação e ativação de diversas células da linhagem hematopoética. Em conjunto, as duas análises reforçam o papel dos RNAs não codificadores na manutenção do metabolismo celular