The ongoing COVID-19 epidemic in Minas Gerais, Brazil: insights from epidemiological data and SARS-CoV-2 whole genome sequencing
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| Data de Publicação: | 2020 |
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| Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
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Resumo: | A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/ |
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Emerging Microbes & Infections, p. 1-26, May 2020.2222-1751https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/4340710.1101/2020.05.05.20091611A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. 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Belo Horizonte, MG, Brasil.Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública,. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Ministério da Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública/Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública.. Belo Horizonte, MG, Brasil.Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública.. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Minas Gerais. 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South Africa.Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences, University of Sydney. Sydney, NSW, Australia.University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil.The recent emergence of a previously unknown coronavirus (SARS-CoV-2), first confirmed in the city of Wuhan in China in December 2019, has caused serious public health and economic issues due to its rapid dissemination worldwide. Although 61,888 confirmed cases had been reported in Brazil by 28 April 2020, little was known about the SARS-CoV-2 epidemic in the country. To better understand the recent epidemic in the second most populous state in southeast Brazil (Minas Gerais, MG), we looked at existing epidemiological data from 3 states and sequenced 40 complete genomes from MG cases using Nanopore. We found evidence of multiple independent introductions from outside MG, both from genome analyses and the overly dispersed distribution of reported cases and deaths. Epidemiological estimates of the reproductive number using different data sources and theoretical assumptions all suggest a reduction in transmission potential since the first reported case, but potential for sustained transmission in the near future. The estimated date of introduction in Brazil was consistent with epidemiological data from the first case of a returning-traveler from Lombardia, Italy. These findings highlight the unique reality of MGs epidemic and reinforce the need for real-time and continued genomic surveillance strategies as a way of understanding and therefore preparing against the epidemic spread of emerging viral pathogens.engTaylor & FrancisCOVID-19Dados epidemiológicosMinas GeraisBrasilSequenciamento do genoma inteiroSARS-CoV-2Rede Genômica FiocruzGENOMAHCOVCOVID-19Epidemiological dataSARS-CoV-2Whole genome sequencingState of Minas GeraisBrazilThe ongoing COVID-19 epidemic in Minas Gerais, Brazil: insights from epidemiological data and SARS-CoV-2 whole genome sequencinginfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; 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