Utilização do exoma na identificação de variantes genéticas relacionadas as Imunodeficiências Primárias (PIDs)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Dutra, Juliana Teixeira
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/44511
Resumo: As imunodeficiências primárias (PIDs) são doenças genéticas que têm como principal característica alterações do sistema imune, caracterizadas por deficiências de desenvolvimento e/ou função desse sistema, levando o paciente à maior suscetibilidade às infecções de repetição, doenças auto-imunes e/ou neoplasias. Estão agrupadas como um único grupo de doenças e a sua classificação, varia de acordo com a natureza da deficiência imunológica subjacente, podendo ser por deficiências de anticorpos, imunodeficiências combinadas, desordens de células fagocitárias, entre outras. Estimam-se sua incidência entre 1:2.000 crianças nascidas vivas e o diagnóstico precoce dessas doenças, é essencial para a redução da morbidade e mortalidade desses pacientes. A identificação precoce e o tratamento eficiente das PIDs são pontos chaves para a sobrevivência e melhor qualidade de vida dos pacientes imunodeficientes, modificando de maneira decisiva o prognóstico destas doenças. Na busca de um diagnóstico mais rápido e eficaz, esse trabalho dispôs de uma análise multigênica de pacientes com pelo menos 1 dos 10 sinais de alerta para PID. Foram sequenciados e analisados 34 casos, sendo 25 do sexo masculino e 9 do sexo feminino. Utilizou-se ferramentas de nova geração e filtros específicos, baseados nos resultados do sequenciamento total do exoma, possibilitando assim , o diagnóstico de 7 casos de Agamaglobulinemia (gene BTK), 2 casos de Wiskott-Aldrich (gene WAS), 1 caso de Doença Granulomatosa Crônica (gene CYBB), 1 caso de Síndrome de Hiper-IgM do tipo I (gene CD40LG) e a investigação parental dos 23 casos sem diagnóstico concluído. Esses achados foram confirmados através do Sequenciamento de Sanger, considerado como padrão ouro para o estudo.
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Estão agrupadas como um único grupo de doenças e a sua classificação, varia de acordo com a natureza da deficiência imunológica subjacente, podendo ser por deficiências de anticorpos, imunodeficiências combinadas, desordens de células fagocitárias, entre outras. Estimam-se sua incidência entre 1:2.000 crianças nascidas vivas e o diagnóstico precoce dessas doenças, é essencial para a redução da morbidade e mortalidade desses pacientes. A identificação precoce e o tratamento eficiente das PIDs são pontos chaves para a sobrevivência e melhor qualidade de vida dos pacientes imunodeficientes, modificando de maneira decisiva o prognóstico destas doenças. Na busca de um diagnóstico mais rápido e eficaz, esse trabalho dispôs de uma análise multigênica de pacientes com pelo menos 1 dos 10 sinais de alerta para PID. Foram sequenciados e analisados 34 casos, sendo 25 do sexo masculino e 9 do sexo feminino. Utilizou-se ferramentas de nova geração e filtros específicos, baseados nos resultados do sequenciamento total do exoma, possibilitando assim , o diagnóstico de 7 casos de Agamaglobulinemia (gene BTK), 2 casos de Wiskott-Aldrich (gene WAS), 1 caso de Doença Granulomatosa Crônica (gene CYBB), 1 caso de Síndrome de Hiper-IgM do tipo I (gene CD40LG) e a investigação parental dos 23 casos sem diagnóstico concluído. Esses achados foram confirmados através do Sequenciamento de Sanger, considerado como padrão ouro para o estudo.Primary immunodeficiencies are genetic diseases that have as main characteristic alterations of the immune system, characterized by deficiencies of development and / or function of this system, leading the patient to greater susceptibility to recurrent infections, autoimmune diseases and / or neoplasias. They are grouped as a single group of diseases and their classification varies according to the nature of the underlying immunological deficiency, and may be due to antibody deficiencies, combined immunodeficiencies, phagocytic cell disorders, among others. Their incidence is estimated between 1: 2000 live births and the early diagnosis of these diseases is essential to reduce the morbidity and mortality of these patients. Early identification and efficient treatment of PIDs are key points for the survival and better quality of life of immunodeficient patients, modifying the prognosis of these diseases in a decisive way. In the search for a faster and more effective diagnosis, this work had a multigenic analysis of patients with at least 1 of the 10 warning signs for PID. Thirty-four cases were sequenced and analyzed, of which 25 were male and 9 were female. New generation tools and specific filters were used based on the results of the complete exome sequencing, allowing the diagnosis of 7 cases of agammaglobulinemia (BTK gene), 2 cases of Wiskott-Aldrich (WAS gene), 1 case of disease Chronic Granulomatose (CYBB gene), 1 case of Type I Hyper-IgM Syndrome (CD40LG gene) and parental investigation of the 23 cases without a completed diagnosis. These findings were confirmed using the Sanger Sequencing, considered the gold standard for the study.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porImunodeficiências primáriasSequenciamento de nova geraçãoSequenciamento total de ExomaVariantes genéticasSequenciamento de SangerDoenças da imunodeficiência primáriaSequenciamento completo do ExomaUtilização do exoma na identificação de variantes genéticas relacionadas as Imunodeficiências Primárias (PIDs)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2019Instituto Nacional de Saúde da Mulher da Criança e do Adolescente Fernandes FigueiraFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Saúde da Criança e da Mulherinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/44511/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALjuliana_dutra_iff_mest_2019.pdfapplication/pdf4439811https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/44511/2/juliana_dutra_iff_mest_2019.pdf6d1072a769fdea1f981119b0ad025c18MD52TEXTjuliana_dutra_iff_mest_2019.pdf.txtjuliana_dutra_iff_mest_2019.pdf.txtExtracted texttext/plain179839https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/44511/3/juliana_dutra_iff_mest_2019.pdf.txt484b93f459b404be820a2282ce21ab5cMD53icict/445112020-12-02 22:30:12.839oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352020-12-03T01:30:12Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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