Investigação molecular da circulação de flavivírus e hepacivírus em suínos domésticos do Distrito Federal, Brasil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Vieira, Yara Cavalcante
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/50710
Resumo: A família Flaviviridae é composta por quatro gêneros de grande importância médica e veterinária \2013 Flavivirus, Pestivirus, Hepacivirus e Pegivirus. Os flavivírus têm sido responsáveis por sucessivas epidemias de arboviroses no Brasil e podem infectar uma ampla variedade de hospedeiros, entretanto, estudos sobre a circulação destes vírus em suínos domésticos no Brasil são limitados. Da mesma forma, os hepacivírus com mais de uma dezena de espécies descritas em diversos hospedeiros na última década, também vem sendo pouco investigados em suínos domésticos. Desta forma, o objetivo deste estudo foi investigar, através de métodos moleculares, a circulação de flavivírus e hepacivírus em populações hígidas de suínos domésticos (Sus scrofa domesticus) provenientes de pequenas criações de subsistência do Distrito Federal e do Sistema Intensivo de Criação de Suínos ao Ar Livre da Universidade de Brasília. Trezentos e vinte oito amostras de soro de suínos domésticos foram analisadas neste estudo, sendo 318 coletadas em 2016 pela Secretaria de Estado da Agricultura, Abastecimento e Desenvolvimento Rural do Distrito Federal e 10 amostras coletadas em 2019 de suínos da Fazenda Água Limpa - Universidade de Brasília As amostras de soro foram submetidas à extração de ácido ribonucleico (RNA), seguida de transcrição reversa e reação em cadeia da polimerase com iniciadores de grupo para o gênero Flavivirus (One Step RT-qPCR) e para o gênero Hepacivirus (NESTED-RT-PCR). Todas as amostras analisadas neste estudo foram negativas para a presença dos vírus investigados, sugerindo ausência de infecção aguda por flavivírus e hepacivírus nos animais estudados. Mais estudos são necessários, especialmente estudos longitudinais, para uma mais ampla investigação de potenciais ciclos enzoóticos silenciosos desses importantes vírus em suínos domésticos brasileiros.
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spelling Vieira, Yara CavalcantePinto, Marcelo Alves2022-01-10T16:53:16Z2022-01-10T16:53:16Z2020VIEIRA, Yara Cavalcante. Investigação molecular da circulação de flavivírus e hepacivírus em suínos domésticos do Distrito Federal, Brasil. 2020. xviii, 94f. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitária) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2020.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/50710A família Flaviviridae é composta por quatro gêneros de grande importância médica e veterinária \2013 Flavivirus, Pestivirus, Hepacivirus e Pegivirus. Os flavivírus têm sido responsáveis por sucessivas epidemias de arboviroses no Brasil e podem infectar uma ampla variedade de hospedeiros, entretanto, estudos sobre a circulação destes vírus em suínos domésticos no Brasil são limitados. Da mesma forma, os hepacivírus com mais de uma dezena de espécies descritas em diversos hospedeiros na última década, também vem sendo pouco investigados em suínos domésticos. Desta forma, o objetivo deste estudo foi investigar, através de métodos moleculares, a circulação de flavivírus e hepacivírus em populações hígidas de suínos domésticos (Sus scrofa domesticus) provenientes de pequenas criações de subsistência do Distrito Federal e do Sistema Intensivo de Criação de Suínos ao Ar Livre da Universidade de Brasília. Trezentos e vinte oito amostras de soro de suínos domésticos foram analisadas neste estudo, sendo 318 coletadas em 2016 pela Secretaria de Estado da Agricultura, Abastecimento e Desenvolvimento Rural do Distrito Federal e 10 amostras coletadas em 2019 de suínos da Fazenda Água Limpa - Universidade de Brasília As amostras de soro foram submetidas à extração de ácido ribonucleico (RNA), seguida de transcrição reversa e reação em cadeia da polimerase com iniciadores de grupo para o gênero Flavivirus (One Step RT-qPCR) e para o gênero Hepacivirus (NESTED-RT-PCR). Todas as amostras analisadas neste estudo foram negativas para a presença dos vírus investigados, sugerindo ausência de infecção aguda por flavivírus e hepacivírus nos animais estudados. Mais estudos são necessários, especialmente estudos longitudinais, para uma mais ampla investigação de potenciais ciclos enzoóticos silenciosos desses importantes vírus em suínos domésticos brasileiros.The family Flaviviridae is composed of four genera of great medical and veterinary importance - Flavivirus, Pestivirus, Hepacivirus, and Pegivirus. Flaviviruses have been responsible for successive arbovirus epidemics in Brazil and can infect a wide variety of hosts. However, studies on the circulation of flaviviruses in domestic swine in Brazil are limited. In the same way, hepaciviruses with more than a dozen species described in different hosts in the last decade, have also been poorly investigated in domestic swine. Thus, the objective of this study was to investigate, through molecular methods, the circulation of flaviviruses and hepaciviruses in healthy populations of domestic swine (Sus scrofa domesticus) from small subsistence farms in the Federal District, West-Central Brazil and the outdoor pig production system from University of Brasília. A total of 328 serum samples from domestic swine were analyzed in this study, being 318 collected in 2016 by the Secretary of State for Agriculture, Supply and Rural Development of the Distrito Federal, and 10 samples collected in 2019 from Água Limpa Farm \2013 University of Brasilia Serum samples were sumbitted to ribonucleic acid (RNA) extraction, followed by reverse transcription and polymerase chain reaction with universal primers for the genus Flavivirus (One Step RT-qPCR), and for the genus Hepacivirus (NESTED-RTPCR). All samples analyzed in this study were negative for flaviviruses and hepaciviruses, suggesting the absence of acute infection in the animals sampled. More studies are needed, especially longitudinal studies, for a broader investigation of potential silent enzootic cycles of these important viruses in Brazilian domestic pigs.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porFlavivirusHepacivirusSuínosFlavivirusHepacivirusSuínosInvestigação molecular da circulação de flavivírus e hepacivírus em suínos domésticos do Distrito Federal, Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis2020Instituto Oswaldo CruzFundação Oswaldo CruzRio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Biologia Parasitáriainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txttext/plain1748https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/50710/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINAL000248317.pdfapplication/pdf2284775https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/50710/2/000248317.pdfaf94c08363a11600b5c09538133dd57aMD52icict/507102022-01-10 13:53:16.921oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352022-01-10T16:53:16Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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