Estudo de reposicionamento de fármacos para doenças negligenciadas causadas por protozoários através da integração de bases de dados biológicas usando Web Semântica

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Fonseca, Rodrigo Jardim Monteiro da
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/7027
Resumo: A pesquisa e desenvolvimento de novos fármacos constituem um processo lento e oneroso. Novas técnicas têm sido propostas para agilizar esse processo. Uma dessas técnicas é chamada de reposicionamento de fármacos, cujo objetivo principal é utilizar fármacos já comercializados para tratamento de outras doenças. A proposição de um novo composto, fármaco ou nova utilização de um fármaco é um processo que necessita integrar informações de diversos campos do conhecimento. Na biologia, diversos dados têm sido gerados através das técnicas de larga escala e armazenados em bases de dados de diversos formatos, dificultando a integração desses dados e a consequente geração de novas informações. Neste estudo é proposta uma abordagem de integração de bases biológicas públicas, utilizando os preceitos do Linked Open Data, através da utilização de web semântica, RDF e URI, para propor uma lista de possíveis fármacos que possuem potencial para estudos mais aprofundados com a finalidade de serem reposicionados para tratamento de doenças causadas por protozoários.
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A proposição de um novo composto, fármaco ou nova utilização de um fármaco é um processo que necessita integrar informações de diversos campos do conhecimento. Na biologia, diversos dados têm sido gerados através das técnicas de larga escala e armazenados em bases de dados de diversos formatos, dificultando a integração desses dados e a consequente geração de novas informações. Neste estudo é proposta uma abordagem de integração de bases biológicas públicas, utilizando os preceitos do Linked Open Data, através da utilização de web semântica, RDF e URI, para propor uma lista de possíveis fármacos que possuem potencial para estudos mais aprofundados com a finalidade de serem reposicionados para tratamento de doenças causadas por protozoários.The research and development of new drugs constitute a slow and expensive process. New techniques have been proposed to accelerate this process. One of such technique is called drugs repositioning whose objective is to use drugs already marketed for the treatment of other diseases. The proposal of a new compound, drug or new use of a drug is a process that needs to integrate information from different fields of knowledge. In biology, many data have been generated through by means of high throughput techniques and stored in databases of different formats, making it difficult to integrate these data and the consequent generation of new information. In this study we propose an approach for integrating public biological databases, using the precepts of Linked Open Data, through the use of semantic web, RDF and URI, propose a list of possible drugs that have potential for further study in order to be repositioned for treatment of protozoal diseases.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.porInstituto Oswaldo CruzReposicionamentoFármacosIntegraçãoWebSemânticaEstudo de reposicionamento de fármacos para doenças negligenciadas causadas por protozoários através da integração de bases de dados biológicas usando Web Semânticainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2013-03-01Vice Direção de Ensino, Informação e ComunicaçãoInstituto Oswaldo CruzInstituto Oswaldo CruzPós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemasinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZORIGINALRodrigo Jardim Monteiro da Fonseca_Tese.pdfRodrigo Jardim Monteiro da Fonseca_Tese.pdfapplication/pdf5849918https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/7027/1/Rodrigo%20Jardim%20Monteiro%20da%20Fonseca_Tese.pdf9f96fe381e913b6770a61fadb509616eMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81867https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/7027/2/license.txt89d048e714e969a1adcda05fdb1978beMD52TEXTRodrigo Jardim Monteiro da Fonseca_Tese.pdf.txtRodrigo Jardim Monteiro da Fonseca_Tese.pdf.txtExtracted texttext/plain203844https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/7027/5/Rodrigo%20Jardim%20Monteiro%20da%20Fonseca_Tese.pdf.txt836e03c953360417730946583b0477f7MD55THUMBNAILRodrigo Jardim Monteiro da Fonseca_Tese.pdf.jpgRodrigo Jardim Monteiro da Fonseca_Tese.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1397https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/7027/4/Rodrigo%20Jardim%20Monteiro%20da%20Fonseca_Tese.pdf.jpgafb3d5ec14d568f52a6f045cbb41ab13MD54icict/70272019-05-07 16:46:20.809oai:www.arca.fiocruz.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352019-05-07T19:46:20Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
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