Multi-parameter approach to evaluate the timing of memory status after 17DD-YF primary vaccination
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Data de Publicação: | 2018 |
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Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) |
Texto Completo: | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/27025 |
Resumo: | Nesta investigação, as técnicas melhoradas por máquina foram aplicadas para trazer insights científicos para identificar um conjunto mínimo de biomarcadores relacionados à memória fenotípica / funcional para o acompanhamento pós-vacinação da vacinação contra a febre amarela (FA). Para este propósito, o estado de memória das células T circulantes (Naïve / efetor-precoce / Memória-Central / Memória Efetiva) e células B (Naïve / memória não clássica / memória clássica) juntamente com o perfil de citocinas (IFN / TNF / IL-5 / IL-10) foram monitorizados antes do NV (dia 0) e em pontos de tempo distintos após a vacinação primária com 17DD-YF - VP (dia30-45); PV (ano1-9) e PV (ano10-11). Um conjunto de biomarcadores (eEfCD4; EMCD4; CMCD19; EMCD8; IFNCD4; IL-5CD8; TNFCD4; IFNCD8; TNFCD8; IL-5CD19; IL-5CD4) foi observado em PV (dia30-45), mas não em NV (dia0) , com a maioria deles ainda observada em VP (ano1-9). Deficiências de biomarcadores fenotípicos / funcionais foram observadas em NV (dia 0), enquanto a falta total de atributos relacionados à memória foi observada na PV (ano10-11), independentemente da idade na vacinação primária. Análise de diagrama de Venn pré-selecionada 10 atributos (eEfCD4, EMCD4, CMCD19, EMCD8, IFNCD4, IL-5CD8, TNFCD4, IFNCD8, TNFCD8 e IL-5CD4), dos quais a média geral apresentou moderada precisão para discriminar PV (dia30-45) e PV (year1-9) de NV (day0) e PV (year10-11). Abordagens multi-parâmetro e algoritmos de árvore de decisão definiram os atributos EMCD8 e IL-5CD4 como os dois principais preditores com desempenho moderado. Juntamente com os títulos PRNT, os dois principais biomarcadores levaram a um status de memória resultante observado em 80% e 51% dos voluntários em PV (dia30-45) e PV (ano1-9), contrastando com 0% e 29% encontrados em NV ( day0) e PV (year10-11), respectivamente. A deficiência de atributos relacionados à memória observada na PV (year10-11) ressalta a diminuição conspícua dependente do tempo da memória resultante após a vacinação primária com 17DD-YF, que pode ser útil para monitorar potenciais correlatos de proteção em áreas sob risco de transmissão da FA. |
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Pereira, Christiane CostaAzevedo, Ana Carolina CampiReis, Jordana Grazziela Coelho dosMagalhães, Vanessa PeruhypeAraújo, Márcio Sobreira SilvaAntonelli, Lis Ribeiro do ValeFonseca, Cristina ToscanoLemos, Jandira AparecidaMalaquias, Luiz Cosme CoteGomes, Matheus de SouzaAmaral, Laurence RodriguesRios, MariaChancey, CarenPersi, Harold RichardPereira, Jorge MarceloMaia, Maria de Lourdes de SousaFreire, Marcos da SilvaMartins, Reinaldo de MenezesHomma, AkiraSimões, MarisolYamamura, Anna YoshidaFarias, Roberto Henrique GuedesRomano, Alessandro Pecego MartinsDomingues, Carla MagdaTauil, Pedro LuizVasconcelos, Pedro Fernando CostaCaldas, Iramaya RodriguesCamacho, Luiz AntônioCarvalho, Andrea TeixeiraMartins Filho, Olindo Assis2018-06-20T18:52:14Z2018-06-20T18:52:14Z2018PEREIRA, Christiane Costa et al. Multi-parameter approach to evalute the timing of memory status after 17DD-YF primary vaccination. Plos Neglected Tropical Diseases, v. 12, n. 6, p. 1-17, Jun. 2018.1935-2727https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/2702510.1371/journal.pntd.0006462Nesta investigação, as técnicas melhoradas por máquina foram aplicadas para trazer insights científicos para identificar um conjunto mínimo de biomarcadores relacionados à memória fenotípica / funcional para o acompanhamento pós-vacinação da vacinação contra a febre amarela (FA). Para este propósito, o estado de memória das células T circulantes (Naïve / efetor-precoce / Memória-Central / Memória Efetiva) e células B (Naïve / memória não clássica / memória clássica) juntamente com o perfil de citocinas (IFN / TNF / IL-5 / IL-10) foram monitorizados antes do NV (dia 0) e em pontos de tempo distintos após a vacinação primária com 17DD-YF - VP (dia30-45); PV (ano1-9) e PV (ano10-11). Um conjunto de biomarcadores (eEfCD4; EMCD4; CMCD19; EMCD8; IFNCD4; IL-5CD8; TNFCD4; IFNCD8; TNFCD8; IL-5CD19; IL-5CD4) foi observado em PV (dia30-45), mas não em NV (dia0) , com a maioria deles ainda observada em VP (ano1-9). Deficiências de biomarcadores fenotípicos / funcionais foram observadas em NV (dia 0), enquanto a falta total de atributos relacionados à memória foi observada na PV (ano10-11), independentemente da idade na vacinação primária. Análise de diagrama de Venn pré-selecionada 10 atributos (eEfCD4, EMCD4, CMCD19, EMCD8, IFNCD4, IL-5CD8, TNFCD4, IFNCD8, TNFCD8 e IL-5CD4), dos quais a média geral apresentou moderada precisão para discriminar PV (dia30-45) e PV (year1-9) de NV (day0) e PV (year10-11). Abordagens multi-parâmetro e algoritmos de árvore de decisão definiram os atributos EMCD8 e IL-5CD4 como os dois principais preditores com desempenho moderado. Juntamente com os títulos PRNT, os dois principais biomarcadores levaram a um status de memória resultante observado em 80% e 51% dos voluntários em PV (dia30-45) e PV (ano1-9), contrastando com 0% e 29% encontrados em NV ( day0) e PV (year10-11), respectivamente. A deficiência de atributos relacionados à memória observada na PV (year10-11) ressalta a diminuição conspícua dependente do tempo da memória resultante após a vacinação primária com 17DD-YF, que pode ser útil para monitorar potenciais correlatos de proteção em áreas sob risco de transmissão da FA.In this investigation, machine-enhanced techniques were applied to bring about scientific insights to identify a minimum set of phenotypic/functional memory-related biomarkers for post-vaccination follow-up upon yellow fever (YF) vaccination. For this purpose, memory status of circulating T-cells (Naïve/early-effector/Central-Memory/Effector-Memory) and Bcells (Naïve/non-Classical-Memory/Classical-Memory) along with the cytokine profile (IFN/ TNF/IL-5/IL-10) were monitored before-NV(day0) and at distinct time-points after 17DD-YF primary vaccinationÐPV(day30-45); PV(year1-9) and PV(year10-11). A set of biomarkers (eEfCD4; EMCD4; CMCD19; EMCD8; IFNCD4; IL-5CD8; TNFCD4; IFNCD8; TNFCD8; IL-5CD19; IL-5CD4) were observed in PV(day30-45), but not in NV(day0), with most of them still observed in PV(year1-9). Deficiencies of phenotypic/functional biomarkers were observed in NV(day0), while total lack of memory-related attributes was observed in PV (year10-11), regardless of the age at primary vaccination. Venn-diagram analysis preselected 10 attributes (eEfCD4, EMCD4, CMCD19, EMCD8, IFNCD4, IL-5CD8, TNFCD4, IFNCD8, TNFCD8 and IL-5CD4), of which the overall mean presented moderate accuracy to discriminate PV(day30-45)&PV(year1-9) from NV(day0)&PV(year10-11). Multi-parameter approaches and decision-tree algorithms defined the EMCD8 and IL-5CD4 attributes as the top-two predictors with moderated performance. Together with the PRNT titers, the toptwo biomarkers led to a resultant memory status observed in 80% and 51% of volunteers in PV(day30-45) and PV(year1-9), contrasting with 0% and 29% found in NV(day0) and PV (year10-11), respectively. The deficiency of memory-related attributes observed at PV (year10-11) underscores the conspicuous time-dependent decrease of resultant memory following17DD-YF primary vaccination that could be useful to monitor potential correlates of protection in areas under risk of YF transmission.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.Governo do Estado de Minas Gerais. Secretaria de Estado de Saúde. Belo Horizonte, MG, Brasil.Universidade Federal de Alfenas. Alfenas, MG, Brasil.Universidade Federal de Uberlândia. Laboratório de Bioinformática e Análises Moleculares. Uberlândia, MG, Brasil.Food and Drug Administration. Center for Biologics Evaluation and Research. Silver Spring, Maryland, USA.Instituto de Biologia do Exército. Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil.Universidade de Brasília. Brasília, DF, Brasil.Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, Pará, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Brasília. Diretoria Regional de Brasília. Brasília, DF, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.engFebre AmarelaVacinaYellow FeverVaccineFebre AmarelaVacinasMulti-parameter approach to evaluate the timing of memory status after 17DD-YF primary vaccinationinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82991https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/27025/1/license.txt5a560609d32a3863062d77ff32785d58MD51ORIGINALMulti-parameter_approach_to_evaluate_the_timing_of.pdfMulti-parameter_approach_to_evaluate_the_timing_of.pdfapplication/pdf8388797https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/27025/2/Multi-parameter_approach_to_evaluate_the_timing_of.pdf234fb0f5fbecbf0d6e239427b5c7095dMD52TEXTMulti-parameter_approach_to_evaluate_the_timing_of.pdf.txtMulti-parameter_approach_to_evaluate_the_timing_of.pdf.txtExtracted 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