Mapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Souza, Joelma Rodrigues de
Data de Publicação: 2011
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
Texto Completo: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60899
Resumo: A dengue é uma das principais arboviroses humana, causada por um dosquatro sorotipos virais (DENV-1, DENV-2, DENV-3 e DENV-4). A infecção porqualquer um dos quatro sorotipos pode resultar desde uma forma clínicainaparente a manifestações clínicas graves. O genoma viral consiste de RNA,que após tradução e processamento, origina dez proteínas: três estruturais esete não estruturais (NS), envolvidas na replicação viral. Estudos buscamcorrelacionar fatores genéticos do hospedeiro com a predisposição àresistência, suscetibilidade ou gravidade da infecção pelo dengue. A respostaimune 72 de pacientes com dengue foi analisada ex-vivo, utilizando PeripheralBlood Mononuclear Cells (PBMC) de pacientes provenientes de uma coorte dedengue previamente iniciada no Departamento de Virologia e TerapiaExperimental (LAVITE/CPqAM). Essa análise foi realizada através de EnzymeLinked Immunospot (ELISPOT), utilizando-se peptídeos sintéticos abrangendoas proteínas NS1 e NS3 do DENV-3, para estimular células T CD4+ e CD8+. Asrespostas imunes foram analisadas quanto à associação com atributos clínicose imunogenéticos, tais quais: forma clínica, tipo de infecção e HumanLeukocyte Antigen (HLA) dos pacientes e seus supertipos. A identificação ex-vivo de epítopos para células T obtidas experimentalmente também foicomparada com as previsões teóricas utilizando-se algoritmos computacionaisavançados. Os resultados evidenciaram que seis peptídeos, sendo três da NS1e três da NS3, foram propostos como epítopos de células T. Em acréscimo, opeptídeo NS1_297_311 apresentou perfil de positividade alélica entre apopulação e o gene HLA-DRB1. Esses achados podem contribuir para odesenvolvimento de intervenções terapêuticas ou preventivas, como umavacina baseada em epítopos múltiplos contra a dengue.
id CRUZ_fb8b8270c452ee655aa0c149b0ca4424
oai_identifier_str oai:www.arca.fiocruz.br:icict/60899
network_acronym_str CRUZ
network_name_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
repository_id_str 2135
spelling Souza, Joelma Rodrigues deMontenegro, Silvia Maria de LucenaGil, Laura Helena Vega GonzalesMorais, Clarice Neuenschwander Lins deCordeiro, Marli TenórioMaia, Rita de Cássia CarvalhoMontenegro, Silvia Maria LucenaMarques Júnior, Ernesto Torres de AzevedoAbath, Frederico Guilherme Coutinho2023-10-25T12:51:41Z2023-10-25T12:51:41Z2011SOUZA, Joelma Rodrigues de. Mapeamento de Epítopos reativos para as células T das proteínas não estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3. 2011. Tese (Doutorado em Saúde Pública) – Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, Fundação Oswaldo Cruz, Recife, 2011.https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60899A dengue é uma das principais arboviroses humana, causada por um dosquatro sorotipos virais (DENV-1, DENV-2, DENV-3 e DENV-4). A infecção porqualquer um dos quatro sorotipos pode resultar desde uma forma clínicainaparente a manifestações clínicas graves. O genoma viral consiste de RNA,que após tradução e processamento, origina dez proteínas: três estruturais esete não estruturais (NS), envolvidas na replicação viral. Estudos buscamcorrelacionar fatores genéticos do hospedeiro com a predisposição àresistência, suscetibilidade ou gravidade da infecção pelo dengue. A respostaimune 72 de pacientes com dengue foi analisada ex-vivo, utilizando PeripheralBlood Mononuclear Cells (PBMC) de pacientes provenientes de uma coorte dedengue previamente iniciada no Departamento de Virologia e TerapiaExperimental (LAVITE/CPqAM). Essa análise foi realizada através de EnzymeLinked Immunospot (ELISPOT), utilizando-se peptídeos sintéticos abrangendoas proteínas NS1 e NS3 do DENV-3, para estimular células T CD4+ e CD8+. Asrespostas imunes foram analisadas quanto à associação com atributos clínicose imunogenéticos, tais quais: forma clínica, tipo de infecção e HumanLeukocyte Antigen (HLA) dos pacientes e seus supertipos. A identificação ex-vivo de epítopos para células T obtidas experimentalmente também foicomparada com as previsões teóricas utilizando-se algoritmos computacionaisavançados. Os resultados evidenciaram que seis peptídeos, sendo três da NS1e três da NS3, foram propostos como epítopos de células T. Em acréscimo, opeptídeo NS1_297_311 apresentou perfil de positividade alélica entre apopulação e o gene HLA-DRB1. Esses achados podem contribuir para odesenvolvimento de intervenções terapêuticas ou preventivas, como umavacina baseada em epítopos múltiplos contra a dengue.Dengue is the most important mosquito-borne viral disease caused by one offour serotypes (DENV-1, DENV-2, DENV-3 and DENV-4). Infection by any ofthe four serotypes may result from a clinical form with no symptoms to severeclinical manifestations. The viral genome consists of RNA, which aftertranslation and processing, will result in ten proteins: three structural and sevennonstructural (NS), which are involved in viral replication. Studies seek tocorrelate with genetic factors host predisposing to resistance, susceptibility orseverity of dengue infection. The immune response of dengue patients (n = 72)was analyzed ex vivo, using Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC) ofpatients from a cohort of dengue previously started at the Department ofVirology and Experimental Therapy (LaViTE/ CPqAM). This analysis wasperformed by Enzyme Linked Immunospot (ELISPOT), using synthetic peptidesspanning the proteins NS1 and NS3 of DENV-3, to stimulate CD4+ and CD8+ Tcells. Immune responses were analyzed for association with clinical andimmunogenetic attributes, such as: clinical form, type of infection and theHuman Leukocyte Antigen (HLA) of the patient and their supertypes. Theidentification of ex-vivo T-cell epitopes obtained experimentally was alsocompared with theoretical predictions using advanced computationalalgorithms. Our results showed that six peptides, three of NS1 and three of NS3proteins, were proposed as T cell epitopes. In addition, the peptideNS1_297_311 showed profile allele positivity among the population and HLA-DRB1 gene. These findings may contribute to the development of preventive ortherapeutic interventions, such as a multi-epitope-based vaccine againstdengue.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.porDengueEpítoposLinfócitos TDengueEpitopeT LymphocyteDengueEpítoposLinfócitos TMapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis2011-02-28Departamento de Saúde ColetivaInstituto Aggeu MagalhãesRecifePrograma de Pós-graduação em Saúde Públicainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)instacron:FIOCRUZLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82991https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/60899/1/license.txt5a560609d32a3863062d77ff32785d58MD51ORIGINALjoelma_souza_iam_dout_2011.pdfjoelma_souza_iam_dout_2011.pdfapplication/pdf4807015https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/60899/2/joelma_souza_iam_dout_2011.pdf56ca884d50af723abd6a08f664cde4eaMD52icict/608992023-10-25 09:51:42.578oai:www.arca.fiocruz.br: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ório InstitucionalPUBhttps://www.arca.fiocruz.br/oai/requestrepositorio.arca@fiocruz.bropendoar:21352023-10-25T12:51:42Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)false
dc.title.en_US.fl_str_mv Mapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3
title Mapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3
spellingShingle Mapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3
Souza, Joelma Rodrigues de
Dengue
Epítopos
Linfócitos T
Dengue
Epitope
T Lymphocyte
Dengue
Epítopos
Linfócitos T
title_short Mapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3
title_full Mapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3
title_fullStr Mapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3
title_full_unstemmed Mapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3
title_sort Mapeamento de epítopos relativos as células T das proteínas estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3
author Souza, Joelma Rodrigues de
author_facet Souza, Joelma Rodrigues de
author_role author
dc.contributor.member.none.fl_str_mv Montenegro, Silvia Maria de Lucena
Gil, Laura Helena Vega Gonzales
Morais, Clarice Neuenschwander Lins de
Cordeiro, Marli Tenório
Maia, Rita de Cássia Carvalho
dc.contributor.author.fl_str_mv Souza, Joelma Rodrigues de
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Montenegro, Silvia Maria Lucena
Marques Júnior, Ernesto Torres de Azevedo
Abath, Frederico Guilherme Coutinho
contributor_str_mv Montenegro, Silvia Maria Lucena
Marques Júnior, Ernesto Torres de Azevedo
Abath, Frederico Guilherme Coutinho
dc.subject.other.en_US.fl_str_mv Dengue
Epítopos
Linfócitos T
topic Dengue
Epítopos
Linfócitos T
Dengue
Epitope
T Lymphocyte
Dengue
Epítopos
Linfócitos T
dc.subject.en.en_US.fl_str_mv Dengue
Epitope
T Lymphocyte
dc.subject.decs.en_US.fl_str_mv Dengue
Epítopos
Linfócitos T
description A dengue é uma das principais arboviroses humana, causada por um dosquatro sorotipos virais (DENV-1, DENV-2, DENV-3 e DENV-4). A infecção porqualquer um dos quatro sorotipos pode resultar desde uma forma clínicainaparente a manifestações clínicas graves. O genoma viral consiste de RNA,que após tradução e processamento, origina dez proteínas: três estruturais esete não estruturais (NS), envolvidas na replicação viral. Estudos buscamcorrelacionar fatores genéticos do hospedeiro com a predisposição àresistência, suscetibilidade ou gravidade da infecção pelo dengue. A respostaimune 72 de pacientes com dengue foi analisada ex-vivo, utilizando PeripheralBlood Mononuclear Cells (PBMC) de pacientes provenientes de uma coorte dedengue previamente iniciada no Departamento de Virologia e TerapiaExperimental (LAVITE/CPqAM). Essa análise foi realizada através de EnzymeLinked Immunospot (ELISPOT), utilizando-se peptídeos sintéticos abrangendoas proteínas NS1 e NS3 do DENV-3, para estimular células T CD4+ e CD8+. Asrespostas imunes foram analisadas quanto à associação com atributos clínicose imunogenéticos, tais quais: forma clínica, tipo de infecção e HumanLeukocyte Antigen (HLA) dos pacientes e seus supertipos. A identificação ex-vivo de epítopos para células T obtidas experimentalmente também foicomparada com as previsões teóricas utilizando-se algoritmos computacionaisavançados. Os resultados evidenciaram que seis peptídeos, sendo três da NS1e três da NS3, foram propostos como epítopos de células T. Em acréscimo, opeptídeo NS1_297_311 apresentou perfil de positividade alélica entre apopulação e o gene HLA-DRB1. Esses achados podem contribuir para odesenvolvimento de intervenções terapêuticas ou preventivas, como umavacina baseada em epítopos múltiplos contra a dengue.
publishDate 2011
dc.date.issued.fl_str_mv 2011
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-10-25T12:51:41Z
dc.date.available.fl_str_mv 2023-10-25T12:51:41Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SOUZA, Joelma Rodrigues de. Mapeamento de Epítopos reativos para as células T das proteínas não estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3. 2011. Tese (Doutorado em Saúde Pública) – Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, Fundação Oswaldo Cruz, Recife, 2011.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60899
identifier_str_mv SOUZA, Joelma Rodrigues de. Mapeamento de Epítopos reativos para as células T das proteínas não estruturais NS1 e NS3 do vírus dengue 3. 2011. Tese (Doutorado em Saúde Pública) – Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães, Fundação Oswaldo Cruz, Recife, 2011.
url https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60899
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
instname:Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron:FIOCRUZ
instname_str Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
instacron_str FIOCRUZ
institution FIOCRUZ
reponame_str Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
collection Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA)
bitstream.url.fl_str_mv https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/60899/1/license.txt
https://www.arca.fiocruz.br/bitstream/icict/60899/2/joelma_souza_iam_dout_2011.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 5a560609d32a3863062d77ff32785d58
56ca884d50af723abd6a08f664cde4ea
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da FIOCRUZ (ARCA) - Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)
repository.mail.fl_str_mv repositorio.arca@fiocruz.br
_version_ 1813009075651215360