Identification of the B, Q, and native Brazilian biotypes of the Bemisia tabaci species complex using Scar markers

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Queiroz, Paulo Roberto
Data de Publicação: 2016
Outros Autores: Martins, Erica Soares, Klautau, Nazaré, Lima, Luzia, Praça, Lilian, Monnerat, Rose Gomes
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
Texto Completo: https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/20475
Resumo: The objective of this work was to develop sequence‑characterized amplified region (Scar) markers to identify the B, Q, and native Brazilian biotypes of the sweet potato whitefly [Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae)]. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) amplification products, exclusive to the B and Brazilian biotypes, were selected after the analysis of 12,000 samples, in order to design a specific Scar primer set. The BT‑B1 and BT‑B3 Scar markers, used to detect the B biotype, produced PCR fragments of 850 and 582 bp, respectively. The BT‑BR1 Scar marker, used to identify the Brazilian biotype, produced a PCR fragment of 700 bp. The Scar markers were tested against the Q biotype, and a flowchart was proposed to indicate the decision steps to use these primers, in order to correctly discriminate the biotypes. This procedure allowed to identify the biotypes that occur in field samples, such as the B biotype. The used set of primers allowed to discriminate the B, Q, and native Brazilian biotypes of B. tabaci. These primers can be successfully used to identify the B biotype of B. tabaci from field samples, showing only one specific biotype present in all cultures.
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spelling Identification of the B, Q, and native Brazilian biotypes of the Bemisia tabaci species complex using Scar markersIdentificação de biótipos B, Q e nativo brasileiro do complexo da espécie Bemisia tabaci por meio de marcadores ScarAleyrodidae; commodities; field samples; molecular marker; sweet potato whiteflyAleyrodidae; commodities; amostras de campo; marcador molecular; mosca-brancaThe objective of this work was to develop sequence‑characterized amplified region (Scar) markers to identify the B, Q, and native Brazilian biotypes of the sweet potato whitefly [Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae)]. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) amplification products, exclusive to the B and Brazilian biotypes, were selected after the analysis of 12,000 samples, in order to design a specific Scar primer set. The BT‑B1 and BT‑B3 Scar markers, used to detect the B biotype, produced PCR fragments of 850 and 582 bp, respectively. The BT‑BR1 Scar marker, used to identify the Brazilian biotype, produced a PCR fragment of 700 bp. The Scar markers were tested against the Q biotype, and a flowchart was proposed to indicate the decision steps to use these primers, in order to correctly discriminate the biotypes. This procedure allowed to identify the biotypes that occur in field samples, such as the B biotype. The used set of primers allowed to discriminate the B, Q, and native Brazilian biotypes of B. tabaci. These primers can be successfully used to identify the B biotype of B. tabaci from field samples, showing only one specific biotype present in all cultures.O objetivo deste trabalho foi desenvolver marcadores “sequence‑characterized amplified region” (Scar) para identificar os biótipos B, Q e nativo brasileiro da mosca-branca [Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae)]. Produtos de amplificação de DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD), exclusivos aos biótipos B e nativo brasileiro, foram selecionados após análise de 12.000 amostras, para desenhar um conjunto de iniciadores específicos de Scar. Os marcadores Scar BT‑B1 e BT‑B3, usados para detectar o biótipo B, produziram fragmentos de PCR de 850 e 582 pb, respectivamente. O marcador Scar BT‑BR1, utilizado para identificar o biótipo brasileiro, produziu um fragmento de PCR de 700 pb. Os marcadores Scar foram testados contra o biótipo Q, e um fluxograma foi proposto para indicar os passos para tomada de decisão sobre quando usar esses iniciadores, para discriminar corretamente os biótipos. Este procedimento permitiu identificar os biótipos que ocorrem em amostras de campo, como o biótipo B. O conjunto de iniciadores utilizados permitiu discriminar os biótipos B, Q e nativo brasileiro de B. tabaci. Esses iniciadores podem ser utilizados com sucesso para identificar o biótipo B de B. tabaci em amostras de campo, e mostram apenas um biótipo específico presente em todas as culturas.Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiraDesenvolvimento da Fruticultura Irrigada do Nordeste (Padfin)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Queiroz, Paulo RobertoMartins, Erica SoaresKlautau, NazaréLima, LuziaPraça, LilianMonnerat, Rose Gomes2016-08-03info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/20475Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.51, n.5, maio 2016: Número Temático Pesquisa, Desenvolvimento e Inovações em Face de Ameaças Sanitárias para a Agropecuária; 555-562Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.51, n.5, maio 2016: Número Temático Pesquisa, Desenvolvimento e Inovações em Face de Ameaças Sanitárias para a Agropecuária; 555-5621678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAenghttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/20475/13318https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/20475/13189Direitos autorais 2016 Pesquisa Agropecuária Brasileirainfo:eu-repo/semantics/openAccess2016-08-10T14:29:22Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/20475Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2016-08-10T14:29:22Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
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