Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na Bahia

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Magalhães, Marcelo
Data de Publicação: 2007
Outros Autores: Martinez, Romari Alejandra, Gaiotto, Fernanda Amato
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
Texto Completo: https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/7675
Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de estoques comerciais do camarão Litopenaeus vannamei, por meio de marcadores RAPD e diferentes métodos estatísticos de análises, em Canavieiras, BA. Vinte primers foram utilizados para a obtenção de 59 marcadores polimórficos. A análise com o programa AMOVA evidenciou diferenciação genética significativa entre os estoques, com ΦST = 0,186 (p < 0,001). Entretanto, as análises obtidas com o programa HICKORY sugeriram não existir estruturação (θβ = 0,002), mas considerável taxa de endogamia dentro dos estoques, em razão, provavelmente, do cruzamento entre indivíduos geneticamente mais similares (f = 0,729). Testes com bootstrap mostraram 48 como o número mínimo de marcadores RAPD adequados para estudos de variabilidade genética nessa espécie. Pelo dendrograma, gerado a partir da matriz de similaridade de Jaccard (Sj), observou-se que nos três estoques comerciais estudados existem animais geneticamente distintos.
id EMBRAPA-4_5104afd62b6aec981e3b3c48fef71eaf
oai_identifier_str oai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/7675
network_acronym_str EMBRAPA-4
network_name_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository_id_str
spelling Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na BahiaGenetic diversity of Litopenaeus vannamei cultivated in Bahia State, Brazilmarcadores moleculares; variabilidade genética; aqüicultura; RAPDmolecular markers; genetic variability; aquaculture; RAPDO objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de estoques comerciais do camarão Litopenaeus vannamei, por meio de marcadores RAPD e diferentes métodos estatísticos de análises, em Canavieiras, BA. Vinte primers foram utilizados para a obtenção de 59 marcadores polimórficos. A análise com o programa AMOVA evidenciou diferenciação genética significativa entre os estoques, com ΦST = 0,186 (p < 0,001). Entretanto, as análises obtidas com o programa HICKORY sugeriram não existir estruturação (θβ = 0,002), mas considerável taxa de endogamia dentro dos estoques, em razão, provavelmente, do cruzamento entre indivíduos geneticamente mais similares (f = 0,729). Testes com bootstrap mostraram 48 como o número mínimo de marcadores RAPD adequados para estudos de variabilidade genética nessa espécie. Pelo dendrograma, gerado a partir da matriz de similaridade de Jaccard (Sj), observou-se que nos três estoques comerciais estudados existem animais geneticamente distintos.The objective of this work was to evaluate the genetic variability of commercial stocks of shrimp Litopenaeus vannamei, using RAPD markers and different statistical methods of analysis in Canavieiras, BA, Brazil. Twenty primers were used to obtain 59 polymorphic markers. A significant differentiation among stocks, with ΦST= 0.186 (p < 0.001), was observed by analysis with the software AMOVA. However, an analysis with the software HICKORY suggested no genetic structure (θβ = 0.002), but considerable inbreeding within stocks, possibly due to consanguineous crossings (f = 0.729). Statistical tests with bootstrap indicated 48 as the minimum number of RAPD markers suitable for studies on genetic variability of this species. By the dendrogram produced from the Jaccard similarity matrix, it was observed that the analyzed stocks are composed of genetically different individuals.Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiraMagalhães, MarceloMartinez, Romari AlejandraGaiotto, Fernanda Amato2007-08-01info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/7675Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.42, n.8, ago. 2007; 1131-1136Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.42, n.8, ago. 2007; 1131-11361678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAporhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/7675/4594info:eu-repo/semantics/openAccess2014-10-13T17:09:04Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/7675Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2014-10-13T17:09:04Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
dc.title.none.fl_str_mv Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na Bahia
Genetic diversity of Litopenaeus vannamei cultivated in Bahia State, Brazil
title Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na Bahia
spellingShingle Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na Bahia
Magalhães, Marcelo
marcadores moleculares; variabilidade genética; aqüicultura; RAPD
molecular markers; genetic variability; aquaculture; RAPD
title_short Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na Bahia
title_full Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na Bahia
title_fullStr Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na Bahia
title_full_unstemmed Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na Bahia
title_sort Diversidade genética de Litopenaeus vannamei cultivado na Bahia
author Magalhães, Marcelo
author_facet Magalhães, Marcelo
Martinez, Romari Alejandra
Gaiotto, Fernanda Amato
author_role author
author2 Martinez, Romari Alejandra
Gaiotto, Fernanda Amato
author2_role author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv

dc.contributor.author.fl_str_mv Magalhães, Marcelo
Martinez, Romari Alejandra
Gaiotto, Fernanda Amato
dc.subject.por.fl_str_mv marcadores moleculares; variabilidade genética; aqüicultura; RAPD
molecular markers; genetic variability; aquaculture; RAPD
topic marcadores moleculares; variabilidade genética; aqüicultura; RAPD
molecular markers; genetic variability; aquaculture; RAPD
description O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de estoques comerciais do camarão Litopenaeus vannamei, por meio de marcadores RAPD e diferentes métodos estatísticos de análises, em Canavieiras, BA. Vinte primers foram utilizados para a obtenção de 59 marcadores polimórficos. A análise com o programa AMOVA evidenciou diferenciação genética significativa entre os estoques, com ΦST = 0,186 (p < 0,001). Entretanto, as análises obtidas com o programa HICKORY sugeriram não existir estruturação (θβ = 0,002), mas considerável taxa de endogamia dentro dos estoques, em razão, provavelmente, do cruzamento entre indivíduos geneticamente mais similares (f = 0,729). Testes com bootstrap mostraram 48 como o número mínimo de marcadores RAPD adequados para estudos de variabilidade genética nessa espécie. Pelo dendrograma, gerado a partir da matriz de similaridade de Jaccard (Sj), observou-se que nos três estoques comerciais estudados existem animais geneticamente distintos.
publishDate 2007
dc.date.none.fl_str_mv 2007-08-01
dc.type.none.fl_str_mv
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/7675
url https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/7675
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/7675/4594
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
dc.source.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.42, n.8, ago. 2007; 1131-1136
Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.42, n.8, ago. 2007; 1131-1136
1678-3921
0100-104x
reponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron:EMBRAPA
instname_str Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron_str EMBRAPA
institution EMBRAPA
reponame_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
collection Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository.name.fl_str_mv Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
repository.mail.fl_str_mv pab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br
_version_ 1793416701068443648