Selection of the most informative morphoagronomic descriptors for cassava germplasm
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Data de Publicação: | 2014 |
Outros Autores: | , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) |
Texto Completo: | https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/19840 |
Resumo: | O objetivo deste trabalho foi selecionar os descritores morfoagronômicos mais informativos para o germoplasma de mandioca (Manihot esculenta), e avaliar a capacidade de diferentes métodos em selecionar os descritores. Foram caracterizados 95 acessos com uso de 51 descritores morfoagronômicos. Os dados foram submetidos à análise de correspondência múltipla (ACM), cujas informações foram utilizadas nos seguintes quatro métodos de seleção de descritores: ordem inversa do descritor para o eixo fatorial pth da ACM (Jolliffe); análise de correspondência múltipla sequencial (ACMS); média das ordens de contribuição do descritor nos três primeiros eixos fatoriais (C3PE); e método C3PE ponderado pelos pesos dos respectivos autovalores da análise completa (C3PEPond). As correlações entre a matriz de dissimilaridade com todos os descritores e os descritores mais informativos foram altas e significativas (0,75, 0,77, 0,83 e 0,84 para C3PEPond, C3PE, ACMS e Jolliffe, respectivamente). Os descritores menos informativos foram descartados, tendo-se considerado apenas aqueles comuns entre os métodos de seleção e relevantes para os interesses do melhoramento. Assim, foram selecionados 32 descritores morfoagronômicos com correlação entre as matrizes de dissimilaridade (r=0,81), em razão de sua alta capacidade para discriminar o germoplasma de mandioca e de sua habilidade de manter alguns caracteres agronômicos preliminares, úteis para a caracterização inicial do germoplasma. |
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Selection of the most informative morphoagronomic descriptors for cassava germplasmSeleção dos descritores morfoagronômicos mais informativos para germoplasma de mandiocaManihot esculenta; descriptor selection; genetic resources; multiple correspondence analysisManihot esculenta; seleção de descritor; recursos genéticos; análise de correspondência múltiplaO objetivo deste trabalho foi selecionar os descritores morfoagronômicos mais informativos para o germoplasma de mandioca (Manihot esculenta), e avaliar a capacidade de diferentes métodos em selecionar os descritores. Foram caracterizados 95 acessos com uso de 51 descritores morfoagronômicos. Os dados foram submetidos à análise de correspondência múltipla (ACM), cujas informações foram utilizadas nos seguintes quatro métodos de seleção de descritores: ordem inversa do descritor para o eixo fatorial pth da ACM (Jolliffe); análise de correspondência múltipla sequencial (ACMS); média das ordens de contribuição do descritor nos três primeiros eixos fatoriais (C3PE); e método C3PE ponderado pelos pesos dos respectivos autovalores da análise completa (C3PEPond). As correlações entre a matriz de dissimilaridade com todos os descritores e os descritores mais informativos foram altas e significativas (0,75, 0,77, 0,83 e 0,84 para C3PEPond, C3PE, ACMS e Jolliffe, respectivamente). Os descritores menos informativos foram descartados, tendo-se considerado apenas aqueles comuns entre os métodos de seleção e relevantes para os interesses do melhoramento. Assim, foram selecionados 32 descritores morfoagronômicos com correlação entre as matrizes de dissimilaridade (r=0,81), em razão de sua alta capacidade para discriminar o germoplasma de mandioca e de sua habilidade de manter alguns caracteres agronômicos preliminares, úteis para a caracterização inicial do germoplasma.The objective of this work was to select the most informative morphoagronomic descriptors for cassava (Manihot esculenta) germplasm and to evaluate the ability of different methods to select the descriptors. Ninety‑five accessions were characterized using 51 morphoagronomic descriptors. Data were subjected to a multiple correspondence analysis (MCA), whose information was used in the following four methods of descriptor selection: reverse order of the descriptor for the pth factorial axis of the MCA (Jolliffe); sequential, multiple correspondence analysis (SMCA); mean of the contribution orders of the descriptor in the first three factorial axes (C3PA); and C3PA method weighted by the respective eigenvalues of the full analysis (C3PAWeig). The correlations between the dissimilarity matrix with all descriptors and the most informative descriptors were high and significant (0.75, 0.77, 0.83, and 0.84 for C3PAWeig, C3PA, SMCA, and Jolliffe, respectively). The less informative descriptors were discarded, considering those common among the selection methods and relevant for the breeding interests. Therefore, 32 morphoagronomic descriptors with correlation between the dissimilarity matrices (r=0.81) were selected, due to their high capacity to discriminate cassava germplasm and to their ability to maintain some preliminary agronomic traits, useful for the initial characterization of the germplasm.Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiraFapesb and CNPqOliveira, Eder Jorge deOliveira Filho, Osvaldo Sebastião deSantos, Vanderlei da Silva2014-12-08info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/19840Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.49, n.11, nov. 2014; 891-900Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.49, n.11, nov. 2014; 891-9001678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAenghttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/19840/12796https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/19840/12060info:eu-repo/semantics/openAccess2014-12-08T19:09:16Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/19840Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2014-12-08T19:09:16Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
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O objetivo deste trabalho foi selecionar os descritores morfoagronômicos mais informativos para o germoplasma de mandioca (Manihot esculenta), e avaliar a capacidade de diferentes métodos em selecionar os descritores. Foram caracterizados 95 acessos com uso de 51 descritores morfoagronômicos. Os dados foram submetidos à análise de correspondência múltipla (ACM), cujas informações foram utilizadas nos seguintes quatro métodos de seleção de descritores: ordem inversa do descritor para o eixo fatorial pth da ACM (Jolliffe); análise de correspondência múltipla sequencial (ACMS); média das ordens de contribuição do descritor nos três primeiros eixos fatoriais (C3PE); e método C3PE ponderado pelos pesos dos respectivos autovalores da análise completa (C3PEPond). As correlações entre a matriz de dissimilaridade com todos os descritores e os descritores mais informativos foram altas e significativas (0,75, 0,77, 0,83 e 0,84 para C3PEPond, C3PE, ACMS e Jolliffe, respectivamente). Os descritores menos informativos foram descartados, tendo-se considerado apenas aqueles comuns entre os métodos de seleção e relevantes para os interesses do melhoramento. Assim, foram selecionados 32 descritores morfoagronômicos com correlação entre as matrizes de dissimilaridade (r=0,81), em razão de sua alta capacidade para discriminar o germoplasma de mandioca e de sua habilidade de manter alguns caracteres agronômicos preliminares, úteis para a caracterização inicial do germoplasma. |
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