Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rangel, Priscila Nascimento
Data de Publicação: 2013
Outros Autores: Vianello, Rosana Pereira, Melo, Arthur Tavares Oliveira, Rangel, Paulo Hideo Nakano, Mendonça, João Antônio, Brondani, Claudio
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
Texto Completo: https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/13517
Resumo: The objective of this work was to evaluate the yield performance of two generations (BC2F2 and BC2F9) of introgression lines developed from the interspecific cross between Oryza sativa and O. glumaepatula, and to identify the SSR markers associated to yield. The wild accession RS‑16 (O. glumaepatula) was used as donor parent in the backcross with the high yielding cultivar Cica‑8 (O. sativa). A set of 114 BC2F1 introgression lines was genotyped with 141 polymorphic SSR loci distributed across the whole rice genome. Molecular analysis showed that in average 22% of the O. glumaepatula genome was introgressed into BC2F1 generation. Nine BC2F9 introgression lines had a significantly higher yield than the genitor Cica‑8, thus showing a positive genome interaction among cultivated rice and the wild O. glumaepatula. Seven QTL were identified in the overall BC2F2, with one marker interval (4879‑EST20) of great effect on yield. The alleles with positive effect on yield came from the cultivated parent Cica‑8.
id EMBRAPA-4_8cf87ca277a6f71b8c58c7ae1ffa0bc1
oai_identifier_str oai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/13517
network_acronym_str EMBRAPA-4
network_name_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository_id_str
spelling Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression linesAnálise de QTL da produtividade em linhagens de introgressão de Oryza sativa x O. glumaepatulaAB‑QTL; breeding; genetic pool; molecular markers; target genome region; yield performance.AB‑QTL; melhoramento; base genética; marcadores moleculares; região‑alvo do genoma; desempenho produtivo.The objective of this work was to evaluate the yield performance of two generations (BC2F2 and BC2F9) of introgression lines developed from the interspecific cross between Oryza sativa and O. glumaepatula, and to identify the SSR markers associated to yield. The wild accession RS‑16 (O. glumaepatula) was used as donor parent in the backcross with the high yielding cultivar Cica‑8 (O. sativa). A set of 114 BC2F1 introgression lines was genotyped with 141 polymorphic SSR loci distributed across the whole rice genome. Molecular analysis showed that in average 22% of the O. glumaepatula genome was introgressed into BC2F1 generation. Nine BC2F9 introgression lines had a significantly higher yield than the genitor Cica‑8, thus showing a positive genome interaction among cultivated rice and the wild O. glumaepatula. Seven QTL were identified in the overall BC2F2, with one marker interval (4879‑EST20) of great effect on yield. The alleles with positive effect on yield came from the cultivated parent Cica‑8.O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho produtivo de duas gerações (RC2F2 e RC2F9) de linhagens de introgressão, desenvolvidas a partir do cruzamento interespecífico entre Oryza sativa e O. glumaepatula, bem como identificar marcadores SSR associados à produtividade. O acesso selvagem RS‑16 (O. glumaepatula) foi utilizado como doador parental no retrocruzamento com a cultivar elite Cica‑8 (O. sativa). Uma série de 114 linhagens de introgressão RC2F1 foi genotipada com 141 locos SSR polimórficos distribuídos ao longo de todo o genoma do arroz. A análise molecular indicou que, em média, 22% do genoma de O. glumaepatula foi introgredida na geração RC2F1. Nove linhagens de introgressão RC2F9 tiveram produção significativamente maior que o genitor Cica‑8, o que mostra uma interação genômica positiva entre o arroz cultivado e a espécie silvestre O. glumaepatula. Sete QTL foram identificados em toda geração RC2F2, com um intervalo de marcadores (4879‑EST20) de grande efeito sobre a produtividade. Os alelos com efeitos positivos sobre a produtividade foram provenientes do genitor cultivado Cica‑8.Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiraEmbrapaRangel, Priscila NascimentoVianello, Rosana PereiraMelo, Arthur Tavares OliveiraRangel, Paulo Hideo NakanoMendonça, João AntônioBrondani, Claudio2013-06-06info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/13517Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.48, n.3, mar. 2013; 280-286Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.48, n.3, mar. 2013; 280-2861678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAenghttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/13517/11123https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/13517/9159https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/13517/9160info:eu-repo/semantics/openAccess2013-06-06T21:18:08Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/13517Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2013-06-06T21:18:08Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
dc.title.none.fl_str_mv Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines
Análise de QTL da produtividade em linhagens de introgressão de Oryza sativa x O. glumaepatula
title Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines
spellingShingle Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines
Rangel, Priscila Nascimento
AB‑QTL; breeding; genetic pool; molecular markers; target genome region; yield performance.
AB‑QTL; melhoramento; base genética; marcadores moleculares; região‑alvo do genoma; desempenho produtivo.
title_short Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines
title_full Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines
title_fullStr Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines
title_full_unstemmed Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines
title_sort Yield QTL analysis of Oryza sativa x O. glumaepatula introgression lines
author Rangel, Priscila Nascimento
author_facet Rangel, Priscila Nascimento
Vianello, Rosana Pereira
Melo, Arthur Tavares Oliveira
Rangel, Paulo Hideo Nakano
Mendonça, João Antônio
Brondani, Claudio
author_role author
author2 Vianello, Rosana Pereira
Melo, Arthur Tavares Oliveira
Rangel, Paulo Hideo Nakano
Mendonça, João Antônio
Brondani, Claudio
author2_role author
author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Embrapa
dc.contributor.author.fl_str_mv Rangel, Priscila Nascimento
Vianello, Rosana Pereira
Melo, Arthur Tavares Oliveira
Rangel, Paulo Hideo Nakano
Mendonça, João Antônio
Brondani, Claudio
dc.subject.por.fl_str_mv AB‑QTL; breeding; genetic pool; molecular markers; target genome region; yield performance.
AB‑QTL; melhoramento; base genética; marcadores moleculares; região‑alvo do genoma; desempenho produtivo.
topic AB‑QTL; breeding; genetic pool; molecular markers; target genome region; yield performance.
AB‑QTL; melhoramento; base genética; marcadores moleculares; região‑alvo do genoma; desempenho produtivo.
description The objective of this work was to evaluate the yield performance of two generations (BC2F2 and BC2F9) of introgression lines developed from the interspecific cross between Oryza sativa and O. glumaepatula, and to identify the SSR markers associated to yield. The wild accession RS‑16 (O. glumaepatula) was used as donor parent in the backcross with the high yielding cultivar Cica‑8 (O. sativa). A set of 114 BC2F1 introgression lines was genotyped with 141 polymorphic SSR loci distributed across the whole rice genome. Molecular analysis showed that in average 22% of the O. glumaepatula genome was introgressed into BC2F1 generation. Nine BC2F9 introgression lines had a significantly higher yield than the genitor Cica‑8, thus showing a positive genome interaction among cultivated rice and the wild O. glumaepatula. Seven QTL were identified in the overall BC2F2, with one marker interval (4879‑EST20) of great effect on yield. The alleles with positive effect on yield came from the cultivated parent Cica‑8.
publishDate 2013
dc.date.none.fl_str_mv 2013-06-06
dc.type.none.fl_str_mv
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/13517
url https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/13517
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/13517/11123
https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/13517/9159
https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/13517/9160
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
dc.source.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.48, n.3, mar. 2013; 280-286
Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.48, n.3, mar. 2013; 280-286
1678-3921
0100-104x
reponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron:EMBRAPA
instname_str Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron_str EMBRAPA
institution EMBRAPA
reponame_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
collection Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository.name.fl_str_mv Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
repository.mail.fl_str_mv pab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br
_version_ 1793416668856188928

Registros relacionados