Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2014 |
Outros Autores: | , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) |
Texto Completo: | https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670 |
Resumo: | O objetivo deste trabalho foi identificar SNPs em genes associados ao conteúdo de ácidos graxos em soja e implementar a metodologia “high resolution melting” (HRM) para genotipagem desses SNPs. Os iniciadores HRM foram desenhados para discriminar os alelos SNPs em duas populações de mapeamento (RILs e F2) e seguiram o padrão esperado de segregação. Os SNPs do gene ABI associaram-se significativamente ao conteúdo de ácido esteárico (R2 = 12,14), e os do gene FAD3B, aos conteúdos de ácido oleico (R2 = 14,69) e linolênico (R2 = 10,62). A técnica de genotipagem dos SNPs por HRM é eficiente na discriminação das classes genotípicas. |
id |
EMBRAPA-4_b654005a71bed3c43e8f61b520b062b9 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/17670 |
network_acronym_str |
EMBRAPA-4 |
network_name_str |
Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) |
repository_id_str |
|
spelling |
Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRMIdentification of SNPs for fatty acid content in soybean by the HRM techniquegenotipagem; marcador molecular; melhoramento vegetal; polimorfismos de nucleotídeo único; seleção assistida por marcadoresgenotyping; molecular marker; plant breeding; single nucleotide polymorphisms; marker assisted selectionO objetivo deste trabalho foi identificar SNPs em genes associados ao conteúdo de ácidos graxos em soja e implementar a metodologia “high resolution melting” (HRM) para genotipagem desses SNPs. Os iniciadores HRM foram desenhados para discriminar os alelos SNPs em duas populações de mapeamento (RILs e F2) e seguiram o padrão esperado de segregação. Os SNPs do gene ABI associaram-se significativamente ao conteúdo de ácido esteárico (R2 = 12,14), e os do gene FAD3B, aos conteúdos de ácido oleico (R2 = 14,69) e linolênico (R2 = 10,62). A técnica de genotipagem dos SNPs por HRM é eficiente na discriminação das classes genotípicas.The objective of this work was to identify SNPs in genes associated with fatty acid content in soybean and to implement the high resolution melting (HRM) technique for SNP genotyping. HRM primers were designed to discriminate SNP alleles in two mapping populations (RILs and F2) and followed the expected pattern of segregation. The ABI gene SNPs were significantly associated with stearic acid content (R2 = 12.14), and the ones from the FAD3B gene, with oleic (R2 = 14.69) and linolenic acid (R2 = 10.62) contents. The technique of genotyping SNPs by HRM is efficient to discriminate genotype classes.Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiracnpqCruz, Maria Fernanda Antunes daBueno, Rafael DelmondSouza, Franciele Barros deMoreira, Maurilio AlvesBarros, Everaldo Gonçalves de2014-03-18info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.48, n.12, dez. 2013; 1596-1600Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.48, n.12, dez. 2013; 1596-16001678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAporhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670/12489https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/17670/10675info:eu-repo/semantics/openAccess2014-03-21T21:14:18Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/17670Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2014-03-21T21:14:18Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM Identification of SNPs for fatty acid content in soybean by the HRM technique |
title |
Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM |
spellingShingle |
Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM Cruz, Maria Fernanda Antunes da genotipagem; marcador molecular; melhoramento vegetal; polimorfismos de nucleotídeo único; seleção assistida por marcadores genotyping; molecular marker; plant breeding; single nucleotide polymorphisms; marker assisted selection |
title_short |
Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM |
title_full |
Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM |
title_fullStr |
Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM |
title_full_unstemmed |
Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM |
title_sort |
Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM |
author |
Cruz, Maria Fernanda Antunes da |
author_facet |
Cruz, Maria Fernanda Antunes da Bueno, Rafael Delmond Souza, Franciele Barros de Moreira, Maurilio Alves Barros, Everaldo Gonçalves de |
author_role |
author |
author2 |
Bueno, Rafael Delmond Souza, Franciele Barros de Moreira, Maurilio Alves Barros, Everaldo Gonçalves de |
author2_role |
author author author author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
cnpq |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Cruz, Maria Fernanda Antunes da Bueno, Rafael Delmond Souza, Franciele Barros de Moreira, Maurilio Alves Barros, Everaldo Gonçalves de |
dc.subject.por.fl_str_mv |
genotipagem; marcador molecular; melhoramento vegetal; polimorfismos de nucleotídeo único; seleção assistida por marcadores genotyping; molecular marker; plant breeding; single nucleotide polymorphisms; marker assisted selection |
topic |
genotipagem; marcador molecular; melhoramento vegetal; polimorfismos de nucleotídeo único; seleção assistida por marcadores genotyping; molecular marker; plant breeding; single nucleotide polymorphisms; marker assisted selection |
description |
O objetivo deste trabalho foi identificar SNPs em genes associados ao conteúdo de ácidos graxos em soja e implementar a metodologia “high resolution melting” (HRM) para genotipagem desses SNPs. Os iniciadores HRM foram desenhados para discriminar os alelos SNPs em duas populações de mapeamento (RILs e F2) e seguiram o padrão esperado de segregação. Os SNPs do gene ABI associaram-se significativamente ao conteúdo de ácido esteárico (R2 = 12,14), e os do gene FAD3B, aos conteúdos de ácido oleico (R2 = 14,69) e linolênico (R2 = 10,62). A técnica de genotipagem dos SNPs por HRM é eficiente na discriminação das classes genotípicas. |
publishDate |
2014 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2014-03-18 |
dc.type.none.fl_str_mv |
|
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670 |
url |
https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.none.fl_str_mv |
https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670/12489 https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/17670/10675 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Pesquisa Agropecuaria Brasileira Pesquisa Agropecuária Brasileira |
publisher.none.fl_str_mv |
Pesquisa Agropecuaria Brasileira Pesquisa Agropecuária Brasileira |
dc.source.none.fl_str_mv |
Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.48, n.12, dez. 2013; 1596-1600 Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.48, n.12, dez. 2013; 1596-1600 1678-3921 0100-104x reponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA |
instname_str |
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
instacron_str |
EMBRAPA |
institution |
EMBRAPA |
reponame_str |
Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) |
collection |
Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) |
repository.name.fl_str_mv |
Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
repository.mail.fl_str_mv |
pab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br |
_version_ |
1793416715641552896 |