Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Cruz, Maria Fernanda Antunes da
Data de Publicação: 2014
Outros Autores: Bueno, Rafael Delmond, Souza, Franciele Barros de, Moreira, Maurilio Alves, Barros, Everaldo Gonçalves de
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
Texto Completo: https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670
Resumo: O objetivo deste trabalho foi identificar SNPs em genes associados ao conteúdo de ácidos graxos em soja e implementar a metodologia “high resolution melting” (HRM) para genotipagem desses SNPs. Os iniciadores HRM foram desenhados para discriminar os alelos SNPs em duas populações de mapeamento (RILs e F2) e seguiram o padrão esperado de segregação. Os SNPs do gene ABI associaram-se significativamente ao conteúdo de ácido esteárico (R2 = 12,14), e os do gene FAD3B, aos conteúdos de ácido oleico (R2 = 14,69) e linolênico (R2 = 10,62). A técnica de genotipagem dos SNPs por HRM é eficiente na discriminação das classes genotípicas.
id EMBRAPA-4_b654005a71bed3c43e8f61b520b062b9
oai_identifier_str oai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/17670
network_acronym_str EMBRAPA-4
network_name_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository_id_str
spelling Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRMIdentification of SNPs for fatty acid content in soybean by the HRM techniquegenotipagem; marcador molecular; melhoramento vegetal; polimorfismos de nucleotídeo único; seleção assistida por marcadoresgenotyping; molecular marker; plant breeding; single nucleotide polymorphisms; marker assisted selectionO objetivo deste trabalho foi identificar SNPs em genes associados ao conteúdo de ácidos graxos em soja e implementar a metodologia “high resolution melting” (HRM) para genotipagem desses SNPs. Os iniciadores HRM foram desenhados para discriminar os alelos SNPs em duas populações de mapeamento (RILs e F2) e seguiram o padrão esperado de segregação. Os SNPs do gene ABI associaram-se significativamente ao conteúdo de ácido esteárico (R2 = 12,14), e os do gene FAD3B, aos conteúdos de ácido oleico (R2 = 14,69) e linolênico (R2 = 10,62). A técnica de genotipagem dos SNPs por HRM é eficiente na discriminação das classes genotípicas.The objective of this work was to identify SNPs in genes associated with fatty acid content in soybean and to implement the high resolution melting (HRM) technique for SNP genotyping. HRM primers were designed to discriminate SNP alleles in two mapping populations (RILs and F2) and followed the expected pattern of segregation. The ABI gene SNPs were significantly associated with stearic acid content (R2 = 12.14), and the ones from the FAD3B gene, with oleic (R2 = 14.69) and linolenic acid (R2 = 10.62) contents. The technique of genotyping SNPs by HRM is efficient to discriminate genotype classes.Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiracnpqCruz, Maria Fernanda Antunes daBueno, Rafael DelmondSouza, Franciele Barros deMoreira, Maurilio AlvesBarros, Everaldo Gonçalves de2014-03-18info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.48, n.12, dez. 2013; 1596-1600Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.48, n.12, dez. 2013; 1596-16001678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAporhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670/12489https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/17670/10675info:eu-repo/semantics/openAccess2014-03-21T21:14:18Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/17670Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2014-03-21T21:14:18Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
dc.title.none.fl_str_mv Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM
Identification of SNPs for fatty acid content in soybean by the HRM technique
title Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM
spellingShingle Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM
Cruz, Maria Fernanda Antunes da
genotipagem; marcador molecular; melhoramento vegetal; polimorfismos de nucleotídeo único; seleção assistida por marcadores
genotyping; molecular marker; plant breeding; single nucleotide polymorphisms; marker assisted selection
title_short Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM
title_full Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM
title_fullStr Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM
title_full_unstemmed Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM
title_sort Identificação de SNPs para conteúdo de ácidos graxos em soja pela técnica HRM
author Cruz, Maria Fernanda Antunes da
author_facet Cruz, Maria Fernanda Antunes da
Bueno, Rafael Delmond
Souza, Franciele Barros de
Moreira, Maurilio Alves
Barros, Everaldo Gonçalves de
author_role author
author2 Bueno, Rafael Delmond
Souza, Franciele Barros de
Moreira, Maurilio Alves
Barros, Everaldo Gonçalves de
author2_role author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv cnpq

dc.contributor.author.fl_str_mv Cruz, Maria Fernanda Antunes da
Bueno, Rafael Delmond
Souza, Franciele Barros de
Moreira, Maurilio Alves
Barros, Everaldo Gonçalves de
dc.subject.por.fl_str_mv genotipagem; marcador molecular; melhoramento vegetal; polimorfismos de nucleotídeo único; seleção assistida por marcadores
genotyping; molecular marker; plant breeding; single nucleotide polymorphisms; marker assisted selection
topic genotipagem; marcador molecular; melhoramento vegetal; polimorfismos de nucleotídeo único; seleção assistida por marcadores
genotyping; molecular marker; plant breeding; single nucleotide polymorphisms; marker assisted selection
description O objetivo deste trabalho foi identificar SNPs em genes associados ao conteúdo de ácidos graxos em soja e implementar a metodologia “high resolution melting” (HRM) para genotipagem desses SNPs. Os iniciadores HRM foram desenhados para discriminar os alelos SNPs em duas populações de mapeamento (RILs e F2) e seguiram o padrão esperado de segregação. Os SNPs do gene ABI associaram-se significativamente ao conteúdo de ácido esteárico (R2 = 12,14), e os do gene FAD3B, aos conteúdos de ácido oleico (R2 = 14,69) e linolênico (R2 = 10,62). A técnica de genotipagem dos SNPs por HRM é eficiente na discriminação das classes genotípicas.
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014-03-18
dc.type.none.fl_str_mv
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670
url https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/17670/12489
https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/17670/10675
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
publisher.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira
Pesquisa Agropecuária Brasileira
dc.source.none.fl_str_mv Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.48, n.12, dez. 2013; 1596-1600
Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.48, n.12, dez. 2013; 1596-1600
1678-3921
0100-104x
reponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron:EMBRAPA
instname_str Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron_str EMBRAPA
institution EMBRAPA
reponame_str Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
collection Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
repository.name.fl_str_mv Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
repository.mail.fl_str_mv pab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br
_version_ 1793416715641552896