Caracterização molecular de acessos de Cratylia argentea e sua relação filogenética com outras leguminosas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Galdino, Alexsandro Sobreira
Data de Publicação: 2011
Outros Autores: Lima, João Paulo Matos Santos, Antunes, Renata de Souza Panarari, Prioli, José Alberto, Thiers, Paulo Roberto, da Silva, Glocimar Pereira, Grangeiro, Thalles Barbosa
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)
Texto Completo: https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/7770
Resumo: O objetivo deste trabalho foi realizar a caracterização molecular de 11 acessos de Cratylia argentea, com base no sequenciamento da região ITS (ITS1/5,8S/ITS2), bem como o estabelecimento de suas relações filogenéticas com outras leguminosas. As relações filogenéticas dessa espécie com outras 15 leguminosas foram estabelecidas com o uso de sequência do gene que codifica a subunidade 18S do rRNA (rDNA 18S). A amplificação do DNA da região ITS/5,8S dos 11 acessos revelou uma única banda de aproximadamente 650 pb. Sequências ITS/5,8S foram obtidas de todos os acessos analisados e depois alinhadas com a região ITS/5,8S da leguminosa Galactia striata. O tamanho das sequências ITS/5,8S dos acessos de C. argentea variou de 565 a 615 pb. Os conteúdos médios de G + C nas regiões ITS1 e ITS2 variaram entre 46 e 47%. O alinhamento múltiplo das seqüências ITS/5,8S dos acessos de C. argentea com Galactia striata revelou a presença de deleções e inserções. Os acessos de C. argentea constituíram um único clado politômico. A análise filogenética de C. argentea demonstrou que essa espécie está incluída no clado das Diocleinae verdadeiras e que os gêneros Calopogonium e Pachyrhizus estão fora desse clado.
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spelling Caracterização molecular de acessos de Cratylia argentea e sua relação filogenética com outras leguminosasMolecular characterization of Cratylia argentea accessions and its phylogenetic relationship with other legumesdistância genética; forrageiras; leguminosas arbustivas; variabilidade genéticagenetic distance; legume shrubs; genetic variabilityO objetivo deste trabalho foi realizar a caracterização molecular de 11 acessos de Cratylia argentea, com base no sequenciamento da região ITS (ITS1/5,8S/ITS2), bem como o estabelecimento de suas relações filogenéticas com outras leguminosas. As relações filogenéticas dessa espécie com outras 15 leguminosas foram estabelecidas com o uso de sequência do gene que codifica a subunidade 18S do rRNA (rDNA 18S). A amplificação do DNA da região ITS/5,8S dos 11 acessos revelou uma única banda de aproximadamente 650 pb. Sequências ITS/5,8S foram obtidas de todos os acessos analisados e depois alinhadas com a região ITS/5,8S da leguminosa Galactia striata. O tamanho das sequências ITS/5,8S dos acessos de C. argentea variou de 565 a 615 pb. Os conteúdos médios de G + C nas regiões ITS1 e ITS2 variaram entre 46 e 47%. O alinhamento múltiplo das seqüências ITS/5,8S dos acessos de C. argentea com Galactia striata revelou a presença de deleções e inserções. Os acessos de C. argentea constituíram um único clado politômico. A análise filogenética de C. argentea demonstrou que essa espécie está incluída no clado das Diocleinae verdadeiras e que os gêneros Calopogonium e Pachyrhizus estão fora desse clado. The objective of this work was to molecularly characterize 11 Cratylia argentea accessions, ITS (ITS1/5.8S/ITS2) region as well to establish its phylogenetic relationship using a gene sequence that codes the subunit 18S of the rRNA (rDNA 18S). DNA amplification of the ITS/5.8S region of these 11 accessions revealed an amplicon with around 650 bp. ITS/5.8S sequences were obtained from all accessions analysed, and then aligned with the region ITS/5.8S of Galactia striata legume. The size of ITS/5.8S region ranged from 565 to 615 bp. Average G + C contents in the ITS1 and ITS2 regions ranged between 46 and 47%. The multiple sequence alignment between the ITS sequences from C. argentea accessions and Galactia striata revealed the presence of deletions and insertions. C. argentea accessions formed a unique politomic clade. Cratylia argentea phylogenetic analysis demonstrated that this species is placed into the true Diocleinae Clade, and that Calopogonium and Pachyrhizus are not included in subtribe Diocleinae. Pesquisa Agropecuaria BrasileiraPesquisa Agropecuária BrasileiraEMBRAPA, FUNCAPEMBRAPA, FUNCAPGaldino, Alexsandro SobreiraLima, João Paulo Matos SantosAntunes, Renata de Souza PanarariPrioli, José AlbertoThiers, Paulo Robertoda Silva, Glocimar PereiraGrangeiro, Thalles Barbosa2011-01-27info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/7770Pesquisa Agropecuaria Brasileira; v.45, n.8, ago. 2010; 846-854Pesquisa Agropecuária Brasileira; v.45, n.8, ago. 2010; 846-8541678-39210100-104xreponame:Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPAporhttps://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/view/7770/6081https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/7770/3350https://seer.sct.embrapa.br/index.php/pab/article/downloadSuppFile/7770/3352info:eu-repo/semantics/openAccess2014-11-07T19:30:26Zoai:ojs.seer.sct.embrapa.br:article/7770Revistahttp://seer.sct.embrapa.br/index.php/pabPRIhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phppab@sct.embrapa.br || sct.pab@embrapa.br1678-39210100-204Xopendoar:2014-11-07T19:30:26Pesquisa Agropecuária Brasileira (Online) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
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