Cálculo analítico de parâmetros estruturais de proteínas usando a teoria Alpha Shapes.
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Data de Publicação: | 2007 |
Outros Autores: | , , , , |
Tipo de documento: | Livro |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório de Informação Tecnológica da Embrapa (Infoteca-e) |
Texto Completo: | http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1327 |
Resumo: | O modelo matemático da estrutura protéica é fundamental não só para a visualização, mas, principalmente, para o cálculo de parâmetros estruturais como área da superfície e volume. É possível usar a geometria computacional para efetuar o cálculo analítico de tais parâmetros. Neste trabalho, usando Alpha-shapes, um algoritmo para o cálculo analítico de área da superfície e volume de estruturas protéicas do Protein Data Bank (PBD) é descrito. Esta implementação supera as demais, pois consegue calcular tais parâmetros para estruturas protéicas onde as demais implementações falham |
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Cálculo analítico de parâmetros estruturais de proteínas usando a teoria Alpha Shapes.BioinformáticaGeometria computacionalTriangulação de DelaunayTeoria Alpha ShapesEstrutura de proteínaO modelo matemático da estrutura protéica é fundamental não só para a visualização, mas, principalmente, para o cálculo de parâmetros estruturais como área da superfície e volume. É possível usar a geometria computacional para efetuar o cálculo analítico de tais parâmetros. Neste trabalho, usando Alpha-shapes, um algoritmo para o cálculo analítico de área da superfície e volume de estruturas protéicas do Protein Data Bank (PBD) é descrito. Esta implementação supera as demais, pois consegue calcular tais parâmetros para estruturas protéicas onde as demais implementações falhamGEORGE BARRETO PEREIRA BEZERRA, UNIVERSIDADE DE NOVO MÉXICOMICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIAFABIO DANILO VIEIRA, CNPTIAEDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIAMARCELO GONCALVES NARCISO, CNPTIAPAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA.BEZERRA, G. B. P.YAMAGISHI, M. E. B.VIEIRA, F. D.SANTOS, E. H. dosNARCISO, M. G.FALCAO, P. R. K.2011-04-09T17:31:48Z2011-04-09T17:31:48Z2007-12-0320072011-04-10T11:11:11Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/book50 p.Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007.1677-9266http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1327por(Embrapa Informática Agropecuária. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 17).info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório de Informação Tecnológica da Embrapa (Infoteca-e)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2017-08-16T11:38:58Zoai:www.infoteca.cnptia.embrapa.br:doc/1327Repositório InstitucionalPUBhttps://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca-oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:2024-03-20T10:44:05.681654Repositório de Informação Tecnológica da Embrapa (Infoteca-e) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
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