Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: CARNEIRO JUNIOR, J. M.
Data de Publicação: 2007
Outros Autores: ASSIS, G. M. L. de, EUCLYDES, R. F., TORRES, R. de A., LOPES, P. S.
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
Texto Completo: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/505159
Resumo: Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans de comprimento considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas que formaram a população-base. A partir da população-base foram formadas duas populações iniciais, uma grande e outra pequena. Dois tipos de estruturas de heterogeneidade de variâncias foram inseridos nas populações iniciais: heterogeneidade de variância genética aditiva e heterogeneidade de variâncias genética aditiva e ambiental. Para obtenção destas estruturas, foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade desejada: alta, média ou baixa. Os componentes de variância foram estimados por meio da metodologia Bayesiana via Amostragem de Gibbs e pelo método REML. Para a metodologia Bayesiana, foram utilizados três níveis de informação a priori: não-informativo, pouco informativo e informativo. Os métodos comparados apresentaram resultados semelhantes quando priors não-informativos foram utilizados e as populações de tamanho grande, de modo geral, apresentaram melhores estimativas. Para as populações pequenas, as análises realizadas considerando os níveis de variabilidade separadamente apresentaram maiores problemas, em virtude do pequeno tamanho das subpopulações formadas. Observou-se, para a metodologia Bayesiana, que o aumento no nível de informação a priori influenciou positivamente as estimativas dos componentes de variância, principalmente para as populações pequenas. Portanto, na presença de heterogeneidade de variâncias, as metodologias se comportam de forma semelhante. Entretanto, para populações pequenas a metodologia Bayesiana conduz a melhores estimativas quando informações adicionais estão disponíveis.
id EMBR_28eac18e0e570b9345f0556cccd6ec5b
oai_identifier_str oai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/505159
network_acronym_str EMBR
network_name_str Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
repository_id_str 2154
spelling Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.Avaliação genéticaGenetic parametersAmostragem de GibbsGibbs samplingInferência BayesianaBayesian inferenceMetodologia REMLInformação a prioriHeterogeneidade de variânciaComponentes de variânciaSistema GenesysCruce de animalesHeterogeneidad genéticaSimulación por computadoraVarianza genéticaAnálisis estadísticoMelhoramento genético animalParâmetro genéticoEstimativaAnálise estatísticaGenomaModelo de simulaçãoAnimal breedingGenomeGenetic varianceGenetic heterogeneityStatistical analysisComputer simulationFoi simulado um genoma de 3.000 centimorgans de comprimento considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas que formaram a população-base. A partir da população-base foram formadas duas populações iniciais, uma grande e outra pequena. Dois tipos de estruturas de heterogeneidade de variâncias foram inseridos nas populações iniciais: heterogeneidade de variância genética aditiva e heterogeneidade de variâncias genética aditiva e ambiental. Para obtenção destas estruturas, foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade desejada: alta, média ou baixa. Os componentes de variância foram estimados por meio da metodologia Bayesiana via Amostragem de Gibbs e pelo método REML. Para a metodologia Bayesiana, foram utilizados três níveis de informação a priori: não-informativo, pouco informativo e informativo. Os métodos comparados apresentaram resultados semelhantes quando priors não-informativos foram utilizados e as populações de tamanho grande, de modo geral, apresentaram melhores estimativas. Para as populações pequenas, as análises realizadas considerando os níveis de variabilidade separadamente apresentaram maiores problemas, em virtude do pequeno tamanho das subpopulações formadas. Observou-se, para a metodologia Bayesiana, que o aumento no nível de informação a priori influenciou positivamente as estimativas dos componentes de variância, principalmente para as populações pequenas. Portanto, na presença de heterogeneidade de variâncias, as metodologias se comportam de forma semelhante. Entretanto, para populações pequenas a metodologia Bayesiana conduz a melhores estimativas quando informações adicionais estão disponíveis.Suplemento.JOSE MARQUES CARNEIRO JUNIOR, CPAF-AC; GISELLE MARIANO LESSA DE ASSIS, CPAF-AC; Ricardo Frederico Euclydes, Universidade Federal de Viçosa (UFV), MG; Robledo de Almeida Torres, Universidade Federal de Viçosa (UFV), MG; Paulo Sávio Lopes, Universidade Federal de Viçosa (UFV), MG.CARNEIRO JUNIOR, J. M.ASSIS, G. M. L. deEUCLYDES, R. F.TORRES, R. de A.LOPES, P. S.2011-04-10T11:11:11Z2011-04-10T11:11:11Z2008-01-1120072019-01-08T11:11:11Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleRevista Brasileira de Zootecnia, Piracicaba, v. 36, n. 5, p. 1539-1548, 2007.1516-3598 (impresso) / 1806-9290 (online)http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/50515910.1590/S1516-35982007000700012.porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2017-08-16T04:20:30Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/505159Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestopendoar:21542017-08-16T04:20:30falseRepositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542017-08-16T04:20:30Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false
dc.title.none.fl_str_mv Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.
title Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.
spellingShingle Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.
CARNEIRO JUNIOR, J. M.
Avaliação genética
Genetic parameters
Amostragem de Gibbs
Gibbs sampling
Inferência Bayesiana
Bayesian inference
Metodologia REML
Informação a priori
Heterogeneidade de variância
Componentes de variância
Sistema Genesys
Cruce de animales
Heterogeneidad genética
Simulación por computadora
Varianza genética
Análisis estadístico
Melhoramento genético animal
Parâmetro genético
Estimativa
Análise estatística
Genoma
Modelo de simulação
Animal breeding
Genome
Genetic variance
Genetic heterogeneity
Statistical analysis
Computer simulation
title_short Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.
title_full Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.
title_fullStr Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.
title_full_unstemmed Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.
title_sort Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.
author CARNEIRO JUNIOR, J. M.
author_facet CARNEIRO JUNIOR, J. M.
ASSIS, G. M. L. de
EUCLYDES, R. F.
TORRES, R. de A.
LOPES, P. S.
author_role author
author2 ASSIS, G. M. L. de
EUCLYDES, R. F.
TORRES, R. de A.
LOPES, P. S.
author2_role author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv JOSE MARQUES CARNEIRO JUNIOR, CPAF-AC; GISELLE MARIANO LESSA DE ASSIS, CPAF-AC; Ricardo Frederico Euclydes, Universidade Federal de Viçosa (UFV), MG; Robledo de Almeida Torres, Universidade Federal de Viçosa (UFV), MG; Paulo Sávio Lopes, Universidade Federal de Viçosa (UFV), MG.
dc.contributor.author.fl_str_mv CARNEIRO JUNIOR, J. M.
ASSIS, G. M. L. de
EUCLYDES, R. F.
TORRES, R. de A.
LOPES, P. S.
dc.subject.por.fl_str_mv Avaliação genética
Genetic parameters
Amostragem de Gibbs
Gibbs sampling
Inferência Bayesiana
Bayesian inference
Metodologia REML
Informação a priori
Heterogeneidade de variância
Componentes de variância
Sistema Genesys
Cruce de animales
Heterogeneidad genética
Simulación por computadora
Varianza genética
Análisis estadístico
Melhoramento genético animal
Parâmetro genético
Estimativa
Análise estatística
Genoma
Modelo de simulação
Animal breeding
Genome
Genetic variance
Genetic heterogeneity
Statistical analysis
Computer simulation
topic Avaliação genética
Genetic parameters
Amostragem de Gibbs
Gibbs sampling
Inferência Bayesiana
Bayesian inference
Metodologia REML
Informação a priori
Heterogeneidade de variância
Componentes de variância
Sistema Genesys
Cruce de animales
Heterogeneidad genética
Simulación por computadora
Varianza genética
Análisis estadístico
Melhoramento genético animal
Parâmetro genético
Estimativa
Análise estatística
Genoma
Modelo de simulação
Animal breeding
Genome
Genetic variance
Genetic heterogeneity
Statistical analysis
Computer simulation
description Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans de comprimento considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas que formaram a população-base. A partir da população-base foram formadas duas populações iniciais, uma grande e outra pequena. Dois tipos de estruturas de heterogeneidade de variâncias foram inseridos nas populações iniciais: heterogeneidade de variância genética aditiva e heterogeneidade de variâncias genética aditiva e ambiental. Para obtenção destas estruturas, foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade desejada: alta, média ou baixa. Os componentes de variância foram estimados por meio da metodologia Bayesiana via Amostragem de Gibbs e pelo método REML. Para a metodologia Bayesiana, foram utilizados três níveis de informação a priori: não-informativo, pouco informativo e informativo. Os métodos comparados apresentaram resultados semelhantes quando priors não-informativos foram utilizados e as populações de tamanho grande, de modo geral, apresentaram melhores estimativas. Para as populações pequenas, as análises realizadas considerando os níveis de variabilidade separadamente apresentaram maiores problemas, em virtude do pequeno tamanho das subpopulações formadas. Observou-se, para a metodologia Bayesiana, que o aumento no nível de informação a priori influenciou positivamente as estimativas dos componentes de variância, principalmente para as populações pequenas. Portanto, na presença de heterogeneidade de variâncias, as metodologias se comportam de forma semelhante. Entretanto, para populações pequenas a metodologia Bayesiana conduz a melhores estimativas quando informações adicionais estão disponíveis.
publishDate 2007
dc.date.none.fl_str_mv 2007
2008-01-11
2011-04-10T11:11:11Z
2011-04-10T11:11:11Z
2019-01-08T11:11:11Z
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv Revista Brasileira de Zootecnia, Piracicaba, v. 36, n. 5, p. 1539-1548, 2007.
1516-3598 (impresso) / 1806-9290 (online)
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/505159
10.1590/S1516-35982007000700012.
identifier_str_mv Revista Brasileira de Zootecnia, Piracicaba, v. 36, n. 5, p. 1539-1548, 2007.
1516-3598 (impresso) / 1806-9290 (online)
10.1590/S1516-35982007000700012.
url http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/505159
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron:EMBRAPA
instname_str Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
instacron_str EMBRAPA
institution EMBRAPA
reponame_str Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
collection Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
repository.mail.fl_str_mv cg-riaa@embrapa.br
_version_ 1794503399697285120