Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare.
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2015 |
Outros Autores: | , , , |
Tipo de documento: | Capítulo de livro |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
Texto Completo: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053611 |
Resumo: | Fusarium decemcellulare é caracterizado por ser endófito ou patogênico a diversas plantas em regiões tropicais e subtropicais. Em guaranazeiro é o agente causal de superbrotamento um dos principais problemas da cultura. O estudo do sistema mating type, idiomorfos MAT-1 e MAT-2, além de fornecer uma compreensão detalhada para delimitar espécies dentro de complexos de espécies, é fundamental para estudo da dinâmica e do potencial de variação genética de um patógeno. Primers degenerados disponíveis na literatura para determinar mating type em várias espécies de Fusarium, não foi capaz de amplificar o MAT-1 em Fdc. Assim, este trabalho teve como objetivo desenvolver primers específicos para determinar MAT-1 em F. decemcellulare. Inicialmente primers degenerados foram desenhados com base nas sequencias do MAT-1 disponíveis no NCBI, amplificado em Fdc e o fragmento do tamanho esperado foi clonado e sequenciado para o desenho de iniciadores específicos que foram validados usando população de isolados de Fdc de diferentes locais de coleta. |
id |
EMBR_605298ff4a387baaa4857ef21d39408c |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/1053611 |
network_acronym_str |
EMBR |
network_name_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository_id_str |
2154 |
spelling |
Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare.HeterotalismoHomotalismoGene MATDoença de PlantaFusarium DecemcellulareGuaranáSuperbrotamentoFusarium decemcellulare é caracterizado por ser endófito ou patogênico a diversas plantas em regiões tropicais e subtropicais. Em guaranazeiro é o agente causal de superbrotamento um dos principais problemas da cultura. O estudo do sistema mating type, idiomorfos MAT-1 e MAT-2, além de fornecer uma compreensão detalhada para delimitar espécies dentro de complexos de espécies, é fundamental para estudo da dinâmica e do potencial de variação genética de um patógeno. Primers degenerados disponíveis na literatura para determinar mating type em várias espécies de Fusarium, não foi capaz de amplificar o MAT-1 em Fdc. Assim, este trabalho teve como objetivo desenvolver primers específicos para determinar MAT-1 em F. decemcellulare. Inicialmente primers degenerados foram desenhados com base nas sequencias do MAT-1 disponíveis no NCBI, amplificado em Fdc e o fragmento do tamanho esperado foi clonado e sequenciado para o desenho de iniciadores específicos que foram validados usando população de isolados de Fdc de diferentes locais de coleta.V. K. S. SIQUEIRA, INPA; K. S. MATOS, INPA; R. E. HANADA, INPA; G. F. GUALBERTO; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA.SIQUEIRA, V. K. S.MATOS, K. S.HANADA, R. E.GUALBERTO, G. F.SILVA, G. F. da2016-09-28T11:11:11Z2016-09-28T11:11:11Z2016-09-2820152017-05-31T11:11:11Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bookPartIn: OLIVEIRA, L. A.; FERNANDES, O. C.; JESUS, M. A.; BENTES, J. L. S.; ANDRADE, S. L.; SOUZA, A. Q. L.; SANTOS, C. (Org.). Diversidade microbiana da Amazônia. Manaus: Inpa, 2015. p. 316-321.http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053611porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2017-08-16T03:40:27Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/1053611Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestopendoar:21542017-08-16T03:40:27falseRepositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542017-08-16T03:40:27Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare. |
title |
Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare. |
spellingShingle |
Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare. SIQUEIRA, V. K. S. Heterotalismo Homotalismo Gene MAT Doença de Planta Fusarium Decemcellulare Guaraná Superbrotamento |
title_short |
Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare. |
title_full |
Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare. |
title_fullStr |
Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare. |
title_full_unstemmed |
Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare. |
title_sort |
Primers específicos para a determinação de MAT-1 em Fusarium decemcellulare. |
author |
SIQUEIRA, V. K. S. |
author_facet |
SIQUEIRA, V. K. S. MATOS, K. S. HANADA, R. E. GUALBERTO, G. F. SILVA, G. F. da |
author_role |
author |
author2 |
MATOS, K. S. HANADA, R. E. GUALBERTO, G. F. SILVA, G. F. da |
author2_role |
author author author author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
V. K. S. SIQUEIRA, INPA; K. S. MATOS, INPA; R. E. HANADA, INPA; G. F. GUALBERTO; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA. |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
SIQUEIRA, V. K. S. MATOS, K. S. HANADA, R. E. GUALBERTO, G. F. SILVA, G. F. da |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Heterotalismo Homotalismo Gene MAT Doença de Planta Fusarium Decemcellulare Guaraná Superbrotamento |
topic |
Heterotalismo Homotalismo Gene MAT Doença de Planta Fusarium Decemcellulare Guaraná Superbrotamento |
description |
Fusarium decemcellulare é caracterizado por ser endófito ou patogênico a diversas plantas em regiões tropicais e subtropicais. Em guaranazeiro é o agente causal de superbrotamento um dos principais problemas da cultura. O estudo do sistema mating type, idiomorfos MAT-1 e MAT-2, além de fornecer uma compreensão detalhada para delimitar espécies dentro de complexos de espécies, é fundamental para estudo da dinâmica e do potencial de variação genética de um patógeno. Primers degenerados disponíveis na literatura para determinar mating type em várias espécies de Fusarium, não foi capaz de amplificar o MAT-1 em Fdc. Assim, este trabalho teve como objetivo desenvolver primers específicos para determinar MAT-1 em F. decemcellulare. Inicialmente primers degenerados foram desenhados com base nas sequencias do MAT-1 disponíveis no NCBI, amplificado em Fdc e o fragmento do tamanho esperado foi clonado e sequenciado para o desenho de iniciadores específicos que foram validados usando população de isolados de Fdc de diferentes locais de coleta. |
publishDate |
2015 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2015 2016-09-28T11:11:11Z 2016-09-28T11:11:11Z 2016-09-28 2017-05-31T11:11:11Z |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/bookPart |
format |
bookPart |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
In: OLIVEIRA, L. A.; FERNANDES, O. C.; JESUS, M. A.; BENTES, J. L. S.; ANDRADE, S. L.; SOUZA, A. Q. L.; SANTOS, C. (Org.). Diversidade microbiana da Amazônia. Manaus: Inpa, 2015. p. 316-321. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053611 |
identifier_str_mv |
In: OLIVEIRA, L. A.; FERNANDES, O. C.; JESUS, M. A.; BENTES, J. L. S.; ANDRADE, S. L.; SOUZA, A. Q. L.; SANTOS, C. (Org.). Diversidade microbiana da Amazônia. Manaus: Inpa, 2015. p. 316-321. |
url |
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053611 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA |
instname_str |
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
instacron_str |
EMBRAPA |
institution |
EMBRAPA |
reponame_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
collection |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
repository.mail.fl_str_mv |
cg-riaa@embrapa.br |
_version_ |
1794503426050097152 |