Caracterização de bactérias antagonistas com alto potencial de inibição do crescimento de Thielaviopsis paradoxa quanto à presença de genes para síntese de policetídeos e peptídeos não-ribossomais.

• Autor(a) principal: FRAGA, Y. S. B.
• Data de Publicação: 2015
• Outros Autores: SANTOS, D. R. dos, REGO, R., BRANDÃO, É. C. T. dos A., DINIZ, L. E. C., FERNANDES, M. F.
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
• Texto Completo: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1028240
• topic: Síntase policetídeo; Sintetase peptídeo não ribossomal; Gene 16S DNAr; Gene RNAr 16S; T paradoxa

O solo é um ambiente estruturalmente complexo constituindo um importante reservatório da diversidade microbiana. Grande parte desta diversidade ainda permanece desconhecida, uma vez que a maioria dos micro-organismos não são recuperados e cultivados por técnicas convencionais. Bactérias do solo representam uma fonte abundante de compostos biologicamente ativos, que têm sido associados às vias metabólicas da sintase policetídeo e da sintetase peptídeo não-ribossomal. O objetivo deste estudo foi identificar, por meio de sequenciamento do gene 16S DNAr, 84 isolados de uma coleção de bactérias com potencial de inibição de fungos fitopatógenos e caracterizar os isolados com maiores potenciais de inibição de T. paradoxa quanto à presença de genes relacionados à síntese de policetídeos e de peptídeos não-ribossomais, compostos de elevada atividade biológica. A afiliação taxonômica dos isolados antagonistas foi realizada com base nas sequências parciais do gene RNAr 16S. O DNA extraído foi amplificado por PCR utilizando os primers 27F e 1488R (ADERIBIGBE et al., 2011). As sequências parciais do gene RNAr 16S obtidas foram comparadas às sequências de bactérias de cultura-tipo depositadas nas bases de dados do GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) utilizando o programa BLASTN (ALTSCHUL et al., 1997). Os isolados selecionados foram submetidos à pesquisa de genes PKS-1 e NRPS. Para isto, foi realizada a amplificação por PCR de sequências conservadas a partir da utilização de primers degenerados específicos descritos na literatura (PARSLEY et al., 2011; SACIDO; GENNILOUD, 2005). A pesquisa dos genes funcionais mostrou que o gene NRPS apresentou efeito significativo (p<0,05) em relação à inibição do crescimento do Thielaviopsis paradoxa, demonstrando a associação deste gene à atividade antagônica frente ao fitopatógeno. Bactérias obtidas de solos supressivos a fusariose coletados em Pernambuco, que apresentam potencial antagonista ao fungo fitopatogênico Thielaviopsis paradoxa, pertencem predominantemente à família Bacillaceae. Diversos estudos da literatura afirmam que Bacillus spp. predominam entre os gêneros bacterianos com potencial antagonista contra fitopatógenos diversos, o que corrobora com os resultados obtidos neste estudo.