Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos.
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2005 |
Outros Autores: | , , , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
Texto Completo: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594886 https://doi.org/10.1590/S1516-35982005000100009 |
Resumo: | O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h2 = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias, o tamanho das famílias e a proporção da variância genética devida aos QTLs e à posição dos QTLs, localizados no mesmo intervalo, em intervalos adjacentes e não-adjacentes. Os fatores que mais influenciaram as estimativas dos parâmetros foram as proporções da variância devida aos QTLs, ao número e ao tamanho das famílias. As estimativas mais viesadas dos componentes dos QTLs e poligênico foram obtidas com a análise dos registros de somente dez famílias. Com número suficiente de famílias e de indivíduos nas famílias e altas proporções de variância genética devida aos QTLs, o modelo aleatório pode detectar QTL com alto poder, apresentando estimativas das posições com boa acurácia, se não existirem dois QTLs no mesmo intervalo. Para o mapeamento fino e estimativas apropriadas da variância dos QTLs, métodos mais sofisticados devem ser utilizados. |
id |
EMBR_98e9fee60a72213a61ea066e59f62dbf |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/594886 |
network_acronym_str |
EMBR |
network_name_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository_id_str |
2154 |
spelling |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos.Mapeamento por intervaloMarcador GenéticoO procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h2 = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias, o tamanho das famílias e a proporção da variância genética devida aos QTLs e à posição dos QTLs, localizados no mesmo intervalo, em intervalos adjacentes e não-adjacentes. Os fatores que mais influenciaram as estimativas dos parâmetros foram as proporções da variância devida aos QTLs, ao número e ao tamanho das famílias. As estimativas mais viesadas dos componentes dos QTLs e poligênico foram obtidas com a análise dos registros de somente dez famílias. Com número suficiente de famílias e de indivíduos nas famílias e altas proporções de variância genética devida aos QTLs, o modelo aleatório pode detectar QTL com alto poder, apresentando estimativas das posições com boa acurácia, se não existirem dois QTLs no mesmo intervalo. Para o mapeamento fino e estimativas apropriadas da variância dos QTLs, métodos mais sofisticados devem ser utilizados.CNPGL.SILVA, M. V. G. B. daMARTINEZ, M. L.TORRES, R. de A.LOPES, P. S.EUCLYDES, R. F.PEREIRA, C. S.MACHADO, M. A.ARBEX, W.2023-01-23T21:02:34Z2023-01-23T21:02:34Z2005-10-112005info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleRevista Brasileira de Zootecnia, v. 34, n. 1, p. 66-75, 2005.http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594886https://doi.org/10.1590/S1516-35982005000100009porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2023-01-23T21:02:34Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/594886Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestopendoar:21542023-01-23T21:02:34falseRepositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542023-01-23T21:02:34Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
spellingShingle |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. SILVA, M. V. G. B. da Mapeamento por intervalo Marcador Genético |
title_short |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title_full |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title_fullStr |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title_full_unstemmed |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title_sort |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
author |
SILVA, M. V. G. B. da |
author_facet |
SILVA, M. V. G. B. da MARTINEZ, M. L. TORRES, R. de A. LOPES, P. S. EUCLYDES, R. F. PEREIRA, C. S. MACHADO, M. A. ARBEX, W. |
author_role |
author |
author2 |
MARTINEZ, M. L. TORRES, R. de A. LOPES, P. S. EUCLYDES, R. F. PEREIRA, C. S. MACHADO, M. A. ARBEX, W. |
author2_role |
author author author author author author author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
CNPGL. |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
SILVA, M. V. G. B. da MARTINEZ, M. L. TORRES, R. de A. LOPES, P. S. EUCLYDES, R. F. PEREIRA, C. S. MACHADO, M. A. ARBEX, W. |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Mapeamento por intervalo Marcador Genético |
topic |
Mapeamento por intervalo Marcador Genético |
description |
O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h2 = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias, o tamanho das famílias e a proporção da variância genética devida aos QTLs e à posição dos QTLs, localizados no mesmo intervalo, em intervalos adjacentes e não-adjacentes. Os fatores que mais influenciaram as estimativas dos parâmetros foram as proporções da variância devida aos QTLs, ao número e ao tamanho das famílias. As estimativas mais viesadas dos componentes dos QTLs e poligênico foram obtidas com a análise dos registros de somente dez famílias. Com número suficiente de famílias e de indivíduos nas famílias e altas proporções de variância genética devida aos QTLs, o modelo aleatório pode detectar QTL com alto poder, apresentando estimativas das posições com boa acurácia, se não existirem dois QTLs no mesmo intervalo. Para o mapeamento fino e estimativas apropriadas da variância dos QTLs, métodos mais sofisticados devem ser utilizados. |
publishDate |
2005 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2005-10-11 2005 2023-01-23T21:02:34Z 2023-01-23T21:02:34Z |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 34, n. 1, p. 66-75, 2005. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594886 https://doi.org/10.1590/S1516-35982005000100009 |
identifier_str_mv |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 34, n. 1, p. 66-75, 2005. |
url |
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594886 https://doi.org/10.1590/S1516-35982005000100009 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA |
instname_str |
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
instacron_str |
EMBRAPA |
institution |
EMBRAPA |
reponame_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
collection |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
repository.mail.fl_str_mv |
cg-riaa@embrapa.br |
_version_ |
1794503538336858112 |