Mineração de motivos SSR em sequências expressas de feijão-caupi contendo TAGS supersage diferecialmente expressas sob desidratação radicular.

• Autor(a) principal: SANTOS, R.
• Data de Publicação: 2013
• Outros Autores: BASANTE, C., FERREIRA NETO, J. R. C., PANDOLFI, V., ROCHA, M. de M., SILVA, K. J. D. e, NEPOMUCENO, A., BRONDANI, R. P. V., BENKO-ISEPPON, A. M., KIDO, E. A.
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)
• Texto Completo: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/965091
• topic: Estresse abiótico; Biblioteca genômica; Bioinformática; Vigna Unguiculata

O feijão-caupi é uma planta importante na nutrição e na economia de pequenos produtores das regiões Norte e Nordeste do Brasil. Entretanto, sua produtividade ainda é pequena, quando comparada com seu potencial e o de outras leguminosas. Uma das alternativas para auxiliar o melhoramento genético da cultura e associar tecnologias modernas, como o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR) e a identificação de genes importantes em resposta a estresses, via estudos de transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE. Nesse sentido, tags SuperSAGE de 26 pb, de genótipo tolerante a desidratação radicular, que foram observadas sendo induzidas após aplicação do estresse (até 150 min), em relação ao controle sem estresse, foram ancoradas em ESTs de feijão-caupi. Essas ESTs contendo as tags induzidas foram mineradas quanto à presença de motivos SSR. Os motivos identificados em 135 ESTs permitiram desenhar pares de primers para desenvolvimento de marcadores moleculares SSR, agora baseados em DNA, e não mais anônimos, visando aproveitar esse tipo de polimorfismos para genotipagem de materiais do melhoramento. Sua associação com resposta a estresses está sendo investigada.