Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers.
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2016 |
Outros Autores: | , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
Texto Completo: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1059482 |
Resumo: | Marcadores RAPD (Random amplified polymorphic DNA) são simples, eficientes, baratos e não requerem conhecimento prévio do genoma do organismo estudado, o que é particularmente importante para espécies nativas. O objetivo deste estudo é identificar marcadores moleculares que possam ser usados para caracterizar genótipos responsivos às auxinas usadas para induzir o enraizamento in vitro de explantes de guanandi (Calophyllum brasiliense). Amostras de DNA foram extraídas de folhas de plantas mantidas em casa de vegetação e plantas micropropagadas após a fase de enraizamento. Quatro primers foram usados e 26 loci encontrados, dois quais 21 são polimórficos (87.5%), com um número de alelos observado de 1.87 e efetivo de 1.39. A diversidade genética de Nei foi 0.24, valor similar ao encontrado em populações naturais. A substituição de nitrogênio líquido por armazenamento a -80°C por meia hora, com a adição de polivinilpirrolidona durante a maceração, foi efetiva na prevenção da degradação das amostras. Os resultados das análises sugerem uma interação entre o genótipo e a resposta à auxina usada durante a cultura in vitro, bem como a possibilidade de um grupo de plantas particularmente responsivo. Novas técnicas são necessárias para determinar a presença de um marcador que identifique genótipos mais suscetíveis ao enraizamento in vitro. |
id |
EMBR_e899a376bd2460ae865ec31fc7d0a939 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/1059482 |
network_acronym_str |
EMBR |
network_name_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository_id_str |
2154 |
spelling |
Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers.GuanandiPolivinilpirrolidonaRAPDCultura In VitroMarcador MolecularCalophyllum brasilienseMarcadores RAPD (Random amplified polymorphic DNA) são simples, eficientes, baratos e não requerem conhecimento prévio do genoma do organismo estudado, o que é particularmente importante para espécies nativas. O objetivo deste estudo é identificar marcadores moleculares que possam ser usados para caracterizar genótipos responsivos às auxinas usadas para induzir o enraizamento in vitro de explantes de guanandi (Calophyllum brasiliense). Amostras de DNA foram extraídas de folhas de plantas mantidas em casa de vegetação e plantas micropropagadas após a fase de enraizamento. Quatro primers foram usados e 26 loci encontrados, dois quais 21 são polimórficos (87.5%), com um número de alelos observado de 1.87 e efetivo de 1.39. A diversidade genética de Nei foi 0.24, valor similar ao encontrado em populações naturais. A substituição de nitrogênio líquido por armazenamento a -80°C por meia hora, com a adição de polivinilpirrolidona durante a maceração, foi efetiva na prevenção da degradação das amostras. Os resultados das análises sugerem uma interação entre o genótipo e a resposta à auxina usada durante a cultura in vitro, bem como a possibilidade de um grupo de plantas particularmente responsivo. Novas técnicas são necessárias para determinar a presença de um marcador que identifique genótipos mais suscetíveis ao enraizamento in vitro.SHEILA SUSY SILVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ; GUILHERME SCHNELL E SCHUHLI, CNPF; JULIANA DEGENHARDT GOLDBACH, CNPF; MARGUERITE GERMAINE GHISLAINE QUOIRIN, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ.SILVEIRA, S. S.SCHUHLI, G. S. eDEGENHARDT-GOLDBACH, J.QUOIRIN, M. G. G.2016-12-28T11:11:11Z2016-12-28T11:11:11Z2016-12-2820162016-12-28T11:11:11Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleScientia Forestalis, Piracicaba, v. 44, n. 110, p. 527-535, jun. 2016.http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1059482dx.doi.org/10.18671/scifor.v44n110.25enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice)instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)instacron:EMBRAPA2017-08-16T03:59:51Zoai:www.alice.cnptia.embrapa.br:doc/1059482Repositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestopendoar:21542017-08-16T03:59:51falseRepositório InstitucionalPUBhttps://www.alice.cnptia.embrapa.br/oai/requestcg-riaa@embrapa.bropendoar:21542017-08-16T03:59:51Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers. |
title |
Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers. |
spellingShingle |
Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers. SILVEIRA, S. S. Guanandi Polivinilpirrolidona RAPD Cultura In Vitro Marcador Molecular Calophyllum brasiliense |
title_short |
Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers. |
title_full |
Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers. |
title_fullStr |
Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers. |
title_full_unstemmed |
Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers. |
title_sort |
Analysis of in vitro rooting capacity of Calophyllum brasiliense through RAPD markers. |
author |
SILVEIRA, S. S. |
author_facet |
SILVEIRA, S. S. SCHUHLI, G. S. e DEGENHARDT-GOLDBACH, J. QUOIRIN, M. G. G. |
author_role |
author |
author2 |
SCHUHLI, G. S. e DEGENHARDT-GOLDBACH, J. QUOIRIN, M. G. G. |
author2_role |
author author author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
SHEILA SUSY SILVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ; GUILHERME SCHNELL E SCHUHLI, CNPF; JULIANA DEGENHARDT GOLDBACH, CNPF; MARGUERITE GERMAINE GHISLAINE QUOIRIN, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ. |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
SILVEIRA, S. S. SCHUHLI, G. S. e DEGENHARDT-GOLDBACH, J. QUOIRIN, M. G. G. |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Guanandi Polivinilpirrolidona RAPD Cultura In Vitro Marcador Molecular Calophyllum brasiliense |
topic |
Guanandi Polivinilpirrolidona RAPD Cultura In Vitro Marcador Molecular Calophyllum brasiliense |
description |
Marcadores RAPD (Random amplified polymorphic DNA) são simples, eficientes, baratos e não requerem conhecimento prévio do genoma do organismo estudado, o que é particularmente importante para espécies nativas. O objetivo deste estudo é identificar marcadores moleculares que possam ser usados para caracterizar genótipos responsivos às auxinas usadas para induzir o enraizamento in vitro de explantes de guanandi (Calophyllum brasiliense). Amostras de DNA foram extraídas de folhas de plantas mantidas em casa de vegetação e plantas micropropagadas após a fase de enraizamento. Quatro primers foram usados e 26 loci encontrados, dois quais 21 são polimórficos (87.5%), com um número de alelos observado de 1.87 e efetivo de 1.39. A diversidade genética de Nei foi 0.24, valor similar ao encontrado em populações naturais. A substituição de nitrogênio líquido por armazenamento a -80°C por meia hora, com a adição de polivinilpirrolidona durante a maceração, foi efetiva na prevenção da degradação das amostras. Os resultados das análises sugerem uma interação entre o genótipo e a resposta à auxina usada durante a cultura in vitro, bem como a possibilidade de um grupo de plantas particularmente responsivo. Novas técnicas são necessárias para determinar a presença de um marcador que identifique genótipos mais suscetíveis ao enraizamento in vitro. |
publishDate |
2016 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2016-12-28T11:11:11Z 2016-12-28T11:11:11Z 2016-12-28 2016 2016-12-28T11:11:11Z |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
Scientia Forestalis, Piracicaba, v. 44, n. 110, p. 527-535, jun. 2016. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1059482 dx.doi.org/10.18671/scifor.v44n110.25 |
identifier_str_mv |
Scientia Forestalis, Piracicaba, v. 44, n. 110, p. 527-535, jun. 2016. dx.doi.org/10.18671/scifor.v44n110.25 |
url |
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1059482 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) instname:Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) instacron:EMBRAPA |
instname_str |
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
instacron_str |
EMBRAPA |
institution |
EMBRAPA |
reponame_str |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
collection |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA - Alice) - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) |
repository.mail.fl_str_mv |
cg-riaa@embrapa.br |
_version_ |
1794503430178340864 |