Caracterização molecular do arbovirus Tacaiúma (AR617554) (Bunyavidirae, Orthobunyavirus), isolado na Região Norte do Brasil
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) |
Texto Completo: | https://patua.iec.gov.br/handle/iec/3107 |
Resumo: | Resumo: A família Bunyaviridae, composta por cinco gêneros (Orthobunyavirus, Nairovirus, Phlebovirus, Hantavirus e Tospovirus), é a maior família de vírus RNA entre os arbovírus e causam manifestações clínicas como febre, febre hemorrágica, falência renal, encefalite, entre outras. O Vírus Tacaíuma (VTCM) pertence ao gênero Orthobunyavirus, e foi isolado pela primeira vez em 1955 a partir do macaco Cebus apella, capturado na Floresta do Oriboca, Estado do Pará. Este vírus é o principal representante do sorogrupo Anopheles A e o único a causar doença humana naturalmente adquirida. O VTCM esta classificado no sorogrupo Anopheles A, porém trabalhos publicados demonstram que o mesmo apresenta reação sorológica fraca no teste de Fixação de Complemento (FC) e no Teste de Neutralização, quando cruzado com outros membros deste sorogrupo. Os resultados com a cepa AR617554 (Altamira, Pará – 1999) do VTCM forneceram as Cadeias Abertas de Leitura (CAL) dos segmentos S-RNA, M-RNA e L-RNA com 738 nucleotídeos (nt), 4167 nt e 6519 nt, respectivamente. O estudo dos motivos conservados nas proteínas sintetizadas pelo VTCM, relacionados com outros Orthobunyavirus, revelou a conservação dos resíduos ligados ao empacotamento da ribonucleoproteína, dos envolvidos na síntese de RNA e aqueles associados com a função de ligação com o RNA, para a proteína do Nucleocapsídeo (N); Já para a poliproteína, foram observados a conservação dos resíduos Císteina(C)-Císteína(C)- Histidina(H)-Cisteína (C), CCHC-Zinc Finger na glicoproteína Gn e a conservação do motivo relacionado ao peptídeo de fusão, na glicoproteína Gc; Em relação a RNA polimerase (proteína L), observou-se, principalmente, a conservação do sítio de adição nucleotídica no motivo C (resíduo Serina(S)-Aspartato(D)-Aspartato(D)) e também dos resíduos W(Triptofano)-Metionina(M)-Arginina(R) no motivo “Reaperlike” da NSs. A análise filogenética do VTCM perante os demais vírus do gênero Orthobunyavirus apresentou, principalmente para a proteína N, que o VTCM faz um grupo separado do Vírus Anopheles A (VANA) e dos Vírus Anopheles B (VANB) e Boracéia (VBOR). A distância aminoacidica e nucleotídica corroboraram com a maior proximidade do VTCM com o VANB do que com o VANA. O sequenciamento dos demais vírus dos grupos Anopheles A e B pode auxiliar na explicação dos resultados sorológicos descritos na literatura e também na classificação correta do VTCM entre os vírus do gênero Orthobunyavirus. |
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Melo Junior, Aristides Bezerra deCarvalho, Valéria LimaCruz, Ana Cecília RibeiroNunes, Marcio Roberto TeixeiraCarneiro, Adriana RibeiroSilva, Sandro Patroca daMedeiros, Daniele Barbosa de Almeida2018-03-29T11:08:30Z2018-03-29T11:08:30Z2015MELO JUNIOR, Aristides Bezerra de. Caracterização molecular do arbovirus Tacaiúma (AR617554) (Bunyavidirae, Orthobunyavirus), isolado na Região Norte do Brasil. 102 f. Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas, Programa de Pós-Graduação em Virologia, Ananindeua, 2015.https://patua.iec.gov.br/handle/iec/3107Resumo: A família Bunyaviridae, composta por cinco gêneros (Orthobunyavirus, Nairovirus, Phlebovirus, Hantavirus e Tospovirus), é a maior família de vírus RNA entre os arbovírus e causam manifestações clínicas como febre, febre hemorrágica, falência renal, encefalite, entre outras. O Vírus Tacaíuma (VTCM) pertence ao gênero Orthobunyavirus, e foi isolado pela primeira vez em 1955 a partir do macaco Cebus apella, capturado na Floresta do Oriboca, Estado do Pará. Este vírus é o principal representante do sorogrupo Anopheles A e o único a causar doença humana naturalmente adquirida. O VTCM esta classificado no sorogrupo Anopheles A, porém trabalhos publicados demonstram que o mesmo apresenta reação sorológica fraca no teste de Fixação de Complemento (FC) e no Teste de Neutralização, quando cruzado com outros membros deste sorogrupo. Os resultados com a cepa AR617554 (Altamira, Pará – 1999) do VTCM forneceram as Cadeias Abertas de Leitura (CAL) dos segmentos S-RNA, M-RNA e L-RNA com 738 nucleotídeos (nt), 4167 nt e 6519 nt, respectivamente. O estudo dos motivos conservados nas proteínas sintetizadas pelo VTCM, relacionados com outros Orthobunyavirus, revelou a conservação dos resíduos ligados ao empacotamento da ribonucleoproteína, dos envolvidos na síntese de RNA e aqueles associados com a função de ligação com o RNA, para a proteína do Nucleocapsídeo (N); Já para a poliproteína, foram observados a conservação dos resíduos Císteina(C)-Císteína(C)- Histidina(H)-Cisteína (C), CCHC-Zinc Finger na glicoproteína Gn e a conservação do motivo relacionado ao peptídeo de fusão, na glicoproteína Gc; Em relação a RNA polimerase (proteína L), observou-se, principalmente, a conservação do sítio de adição nucleotídica no motivo C (resíduo Serina(S)-Aspartato(D)-Aspartato(D)) e também dos resíduos W(Triptofano)-Metionina(M)-Arginina(R) no motivo “Reaperlike” da NSs. A análise filogenética do VTCM perante os demais vírus do gênero Orthobunyavirus apresentou, principalmente para a proteína N, que o VTCM faz um grupo separado do Vírus Anopheles A (VANA) e dos Vírus Anopheles B (VANB) e Boracéia (VBOR). A distância aminoacidica e nucleotídica corroboraram com a maior proximidade do VTCM com o VANB do que com o VANA. O sequenciamento dos demais vírus dos grupos Anopheles A e B pode auxiliar na explicação dos resultados sorológicos descritos na literatura e também na classificação correta do VTCM entre os vírus do gênero Orthobunyavirus.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.porInstituto Evandro ChagasCaracterização molecular do arbovirus Tacaiúma (AR617554) (Bunyavidirae, Orthobunyavirus), isolado na Região Norte do Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisNúcleo de Ensino e Pós-GraduaçãoInstituto Evandro ChagasMestrado AcadêmicoAnanindeua / PAPrograma de Pós-Graduação em VirologiaArbovirus / isolamento & purificaçãoBunyaviridae / isolamento & purificaçãoOrthobunyavirus / solamento & purificaçãoAnopheles / anatomia & histologiaGenoma ViralRNA Viral / genéticaVirus Tacaíumainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)instname:Instituto Evandro Chagas (IEC)instacron:IECORIGINALCaracterização molecular do arbovirus Tacaiúma (AR617554) (Bunyavidirae, Orthobunyavirus), isolado na Região Norte do Brasil.pdfCaracterização molecular do arbovirus Tacaiúma (AR617554) (Bunyavidirae, Orthobunyavirus), isolado na Região Norte do Brasil.pdfapplication/pdf4484547https://patua.iec.gov.br/bitstreams/60afb43a-f5d7-4419-82bd-fe6f7e752734/download69c3b9cb53ab9a10d13071cf94f12dacMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://patua.iec.gov.br/bitstreams/2aca92bb-bf77-4000-b170-008aa98f7dab/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTCaracterização molecular do arbovirus Tacaiúma (AR617554) (Bunyavidirae, Orthobunyavirus), isolado na Região Norte do Brasil.pdf.txtCaracterização molecular do arbovirus Tacaiúma (AR617554) (Bunyavidirae, Orthobunyavirus), isolado na Região Norte do Brasil.pdf.txtExtracted texttext/plain103213https://patua.iec.gov.br/bitstreams/38e5cc90-048d-4932-b18a-e1a748c66e0a/download522cc506ed95097a4073f431063d3175MD55THUMBNAILCaracterização molecular do arbovirus Tacaiúma (AR617554) (Bunyavidirae, Orthobunyavirus), isolado na Região Norte do Brasil.pdf.jpgCaracterização molecular do arbovirus Tacaiúma (AR617554) (Bunyavidirae, Orthobunyavirus), isolado na Região Norte do Brasil.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2688https://patua.iec.gov.br/bitstreams/405cd92a-41f1-455e-a33d-e616128f7646/downloade909bd7e11df40e17605d3fb1baabee0MD56iec/31072022-10-20 23:39:43.79oai:patua.iec.gov.br:iec/3107https://patua.iec.gov.brRepositório InstitucionalPUBhttps://patua.iec.gov.br/oai/requestclariceneta@iec.gov.br || Biblioteca@iec.gov.bropendoar:2022-10-20T23:39:43Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) - Instituto Evandro Chagas (IEC)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 |
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