Análise de viromas em Alouatta caraya e Saimiri collinsi mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas, Ananindeua, Pará
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Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Dissertação |
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Título da fonte: | Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) |
Texto Completo: | https://patua.iec.gov.br/handle/iec/3124 |
Resumo: | Resumo: Apesar dos 40 anos de experimentação científica com o uso das espécies de símios do novo mundo, pouco se conhece sobre as potencialidades das espécies de primatas neotropicais como reservatórios de zoonoses. Na última década, após o advento do Sequenciamento de Nova Geração (NGS), o sequenciamento genético sofreu um grande impulso, tornando possível a intensificação de estudos envolvendo metagenômica viral e culminando com a descoberta de novos vírus, especialmente aqueles não cultiváveis em sistemas celulares. Neste sentido, este trabalho teve como objetivo reconhecer a biodiversidade viral de primatas não humanos mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas (CENP), mediante identificação do viroma existente nas fezes dos primatas selecionados, assim como avaliar as diferenças nas comunidades virais oriundas de animais pertencentes à mesma espécie e de espécies diferentes. Para tanto, foram coletadas amostras de fezes de quatro machos de primatas neotropicais (dois animais da espécie Saimiri collinsi e dois animais da espécie Alouatta caraya). Após extração do DNA e RNA virais e sequenciamento na plataforma Ion PGMTM System (Life Technologies), os viromas identificados distribuíram-se em mais de 10 famílias, 30 gêneros e 160 espécies virais diferentes, com destaque para as famílias Shiphoviridae, Myoviridae, Phycodnaviridae, Mimiviridae e Podoviridae, os gêneros Chlorovirus e Cafeteriavirus e as espécies Bacillus phage G, Streptococcus phage phiSsUD.1, Cafeteria roenbergensis virus e Bacillus phage proCM3. Na comparação da diversidade viral entre as espécies de primatas, os animais da espécie Alouatta caraya contribuíram com 98% da diversidade viral total detectada, enquanto que na comparação da diversidade intraespécie houve destaque para Saimiri collinsi 01 e Alouatta caraya 01. |
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Moreira, Diego ReymãoMedeiros, Daniele Barbosa de AlmeidaMachado, Luiz Fernando AlmeidaScalercio, Sarah Raphaella Rocha de AzevedoVianez Júnior, João Lídio da Silva Gonçalves2018-04-06T11:49:54Z2018-04-06T11:49:54Z2016MOREIRA, Diego Reymão. Análise de viromas em Alouatta caraya e Saimiri collinsi mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas, Ananindeua, Pará. 69 f. Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas, Programa de Pós-Graduação em Virologia, Ananindeua, 2016.https://patua.iec.gov.br/handle/iec/3124Resumo: Apesar dos 40 anos de experimentação científica com o uso das espécies de símios do novo mundo, pouco se conhece sobre as potencialidades das espécies de primatas neotropicais como reservatórios de zoonoses. Na última década, após o advento do Sequenciamento de Nova Geração (NGS), o sequenciamento genético sofreu um grande impulso, tornando possível a intensificação de estudos envolvendo metagenômica viral e culminando com a descoberta de novos vírus, especialmente aqueles não cultiváveis em sistemas celulares. Neste sentido, este trabalho teve como objetivo reconhecer a biodiversidade viral de primatas não humanos mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas (CENP), mediante identificação do viroma existente nas fezes dos primatas selecionados, assim como avaliar as diferenças nas comunidades virais oriundas de animais pertencentes à mesma espécie e de espécies diferentes. Para tanto, foram coletadas amostras de fezes de quatro machos de primatas neotropicais (dois animais da espécie Saimiri collinsi e dois animais da espécie Alouatta caraya). Após extração do DNA e RNA virais e sequenciamento na plataforma Ion PGMTM System (Life Technologies), os viromas identificados distribuíram-se em mais de 10 famílias, 30 gêneros e 160 espécies virais diferentes, com destaque para as famílias Shiphoviridae, Myoviridae, Phycodnaviridae, Mimiviridae e Podoviridae, os gêneros Chlorovirus e Cafeteriavirus e as espécies Bacillus phage G, Streptococcus phage phiSsUD.1, Cafeteria roenbergensis virus e Bacillus phage proCM3. Na comparação da diversidade viral entre as espécies de primatas, os animais da espécie Alouatta caraya contribuíram com 98% da diversidade viral total detectada, enquanto que na comparação da diversidade intraespécie houve destaque para Saimiri collinsi 01 e Alouatta caraya 01.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.porInstituto Evandro ChagasAnálise de viromas em Alouatta caraya e Saimiri collinsi mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas, Ananindeua, Paráinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisNúcleo de Ensino e Pós-GraduaçãoInstituto Evandro ChagasMestrado AcadêmicoAnanindeua / PAPrograma de Pós-Graduação em VirologiaMetagenômicaGenoma ViralFezes / virologiaPrimatasAlouattaSaimiriRegião Norte (BR)Centro Nacional de Primatas (PA)info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá)instname:Instituto Evandro Chagas (IEC)instacron:IECORIGINALAnálise de viromas em Alouatta caraya e Saimiri collinsi mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas, Ananindeua, Pará.pdfAnálise de viromas em Alouatta caraya e Saimiri collinsi mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas, Ananindeua, Pará.pdfapplication/pdf1050744https://patua.iec.gov.br/bitstreams/32634eaf-3c49-43ad-84e8-3fcacd2c31b6/downloadb5084e9454440eafc07b68572fc6d6b9MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://patua.iec.gov.br/bitstreams/7a10b6ee-6efd-47d3-85fb-123288860020/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTAnálise de viromas em Alouatta caraya e Saimiri collinsi mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas, Ananindeua, Pará.pdf.txtAnálise de viromas em Alouatta caraya e Saimiri collinsi mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas, Ananindeua, Pará.pdf.txtExtracted texttext/plain102142https://patua.iec.gov.br/bitstreams/708797e9-997a-4e97-a855-67b3749ed6a4/download9943cee5cd91de8b55f4f8f642b3baedMD55THUMBNAILAnálise de viromas em Alouatta caraya e Saimiri collinsi mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas, Ananindeua, Pará.pdf.jpgAnálise de viromas em Alouatta caraya e Saimiri collinsi mantidos em cativeiro no Centro Nacional de Primatas, Ananindeua, Pará.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2372https://patua.iec.gov.br/bitstreams/3fd71fbb-c772-4df4-bcdf-d9ff7af5ba8d/download16f5eb843e91566d7a165da2218f14fdMD56iec/31242022-10-20 21:59:33.208oai:patua.iec.gov.br:iec/3124https://patua.iec.gov.brRepositório InstitucionalPUBhttps://patua.iec.gov.br/oai/requestclariceneta@iec.gov.br || Biblioteca@iec.gov.bropendoar:2022-10-20T21:59:33Repositório Digital do Instituto Evandro Chagas (Patuá) - Instituto Evandro Chagas (IEC)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 |
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