Smicridea McLachlan, 1871 (Trichoptera: Hydropsychidae: Smicrideinae) do Brasil: Associação de larvas e adultos usando sequências de DNA mitocondrial e metamorfótipo
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2016 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional do INPA |
Texto Completo: | https://repositorio.inpa.gov.br/handle/1/12418 http://lattes.cnpq.br/3367216140478101 |
Resumo: | Smicridea McLachlan, 1871 é o único gênero de Smicrideinae presente no Novo Mundo. Suas espécies são bastante diversas na região Neotropical e estão agrupadas em dois subgêneros, Smicridea e Rhyacophylax. Porém, as larvas de grande parte dessa diversidade permanecem desconhecidas, principalmente no Brasil, onde das 50 espécies registradas apenas sete têm larvas conhecidas. Este fato compromete sua aplicabilidade como bioindicadores em programas de biomonitoramento da qualidade de ambientes aquáticos. Portanto, para serem ilustradas e descritas morfologicamente em nível de espécie, larvas precisam ser associadas com adultos identificados. Nesse sentido, realizou-se associações entre larvas e adultos de Smicridea do Brasil através de metamorfótipos e comparação de sequências do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (COI). A partir da análise de material proveniente de diversas localidades do Brasil, quando metamorfótipos não foram encontrados ou disponíveis, foi extraído DNA mitocondrial dos espécimes para posterior amplificação, purificação e sequenciamento do fragmento do gene COI. As sequências obtidas, juntamente com algumas obtidas no banco de dados do DNA barcode (BOLD), foram editadas e alinhadas, resultando em um fragmento de 620 bp. Baseado nas sequências, distâncias genéticas intra e interespecífica foram calculadas usando modelo evolutivo Kimura 2-Parâmetros e a partir dessas distâncias foram construídos filogramas usando o método de Neighbor-Joining (NJ) com suporte dos ramos inferido por bootstrap com 1.000 replicações. Neste estudo, associações entre larvas e adultos foram realizadas para 11 espécies de Smicridea, quatro por meio de metamorfótipos e sete através de sequências do gene COI, com base nos agrupamentos do filograma gerado por NJ e de acordo com critérios de associação. Das espécies associadas, sete pertencem a S. (Rhyacophylax) e quatro a S. (Smicridea), das quais três são novas para a ciência. Larvas coespecíficas a adultos de espécies conhecidas juntamente com adultos machos das novas espécies são descritas, ilustradas e suas distribuições estendidas. Além disso, uma chave ilustrada de identificação taxonômica é fornecida para as 17 espécies de Smicridea com estágio larval conhecido que ocorrem no Brasil. |
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Nesse sentido, realizou-se associações entre larvas e adultos de Smicridea do Brasil através de metamorfótipos e comparação de sequências do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (COI). A partir da análise de material proveniente de diversas localidades do Brasil, quando metamorfótipos não foram encontrados ou disponíveis, foi extraído DNA mitocondrial dos espécimes para posterior amplificação, purificação e sequenciamento do fragmento do gene COI. As sequências obtidas, juntamente com algumas obtidas no banco de dados do DNA barcode (BOLD), foram editadas e alinhadas, resultando em um fragmento de 620 bp. Baseado nas sequências, distâncias genéticas intra e interespecífica foram calculadas usando modelo evolutivo Kimura 2-Parâmetros e a partir dessas distâncias foram construídos filogramas usando o método de Neighbor-Joining (NJ) com suporte dos ramos inferido por bootstrap com 1.000 replicações. Neste estudo, associações entre larvas e adultos foram realizadas para 11 espécies de Smicridea, quatro por meio de metamorfótipos e sete através de sequências do gene COI, com base nos agrupamentos do filograma gerado por NJ e de acordo com critérios de associação. Das espécies associadas, sete pertencem a S. (Rhyacophylax) e quatro a S. (Smicridea), das quais três são novas para a ciência. Larvas coespecíficas a adultos de espécies conhecidas juntamente com adultos machos das novas espécies são descritas, ilustradas e suas distribuições estendidas. Além disso, uma chave ilustrada de identificação taxonômica é fornecida para as 17 espécies de Smicridea com estágio larval conhecido que ocorrem no Brasil.Smicridea McLachlan, 1871 is the single genus of Smicrideinae in the New World. Its species are quite diverse in the Neotropics and are clustered into two subgenera, Smicridea and Rhyacophylax. However, the larvae of a big part of this diversity remain unknown, especially in Brazil, where among the 50 species recorded only seven has the larvae known. This fact compromises its applicability as biomarkers in biomonitoring programs of the quality of aquatic environments. Therefore, to be illustrated and morphologically described at the species level, larvae need to be associated with identified adults. In this sense, were carried associations between larvae and adult Smicridea of Brazil through metamorphotypes and sequence comparison of mitochondrial gene Cytochrome Oxidase subunit I (COI). From the analysis of material from various locations in Brazil, when metamorphotypes were not found or not available, mitochondrial DNA of the specimens was extracted for subsequent amplification, purification and sequencing of the COI gene fragment. The sequences obtained, together with some of the downloaded DNA barcode database (BOLD) were edited and aligned, resulting in a fragment of 620 bp. Based on sequences, intra- and interspecific genetic distances were calculated using evolutionary model Kimura 2-parameters and from these distances were built filogramas using the neighbor-joining method (NJ) with branches of support inferred by bootstrapping with 1.000 replications. In this study, associations between larvae and adults were performed for 11 species of Smicridea, four by metamorphotypes and seven through COI gene sequences, based on the philogram groupings generated by NJ and according to association’s criteria. Of associated species, seven belong to S. (Rhyacophylax) and four to S. (Smicridea), three of which are new to science. Larvae conspecific to adult of known species with adult males of the new species are described, illustrated and their extended distribution. In addition, an illustrated taxonomic identification key is provided for the 17 species of Smicridea with known larval stage that occurs Brazil.porInstituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPAEntomologiaAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessInsetos aquáticosSmicrideaDNA barcodingSmicridea McLachlan, 1871 (Trichoptera: Hydropsychidae: Smicrideinae) do Brasil: Associação de larvas e adultos usando sequências de DNA mitocondrial e metamorfótipoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional do INPAinstname:Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA)instacron:INPA1/124182020-04-15 11:13:00.243oai:repositorio:1/12418Repositório de PublicaçõesPUBhttps://repositorio.inpa.gov.br/oai/requestopendoar:2020-04-15T15:13Repositório Institucional do INPA - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA)false |
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